CuGenDBv2

Gene ID	PI0024463
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	nuclear pore complex protein NUP62
Genome location	chr11:2518888..2529003
RNA-Seq Expression	PI0024463
Synteny	PI0024463
Gene Ontology terms	GO:0006405 - RNA export from nucleus (biological process) GO:0006606 - protein import into nucleus (biological process) GO:0044613 - nuclear pore central transport channel (cellular component) GO:0005543 - phospholipid binding (molecular function) GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domains	IPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

XP_008459731.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo]

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XP_023006514.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima]

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        SS        +A SSS   +S  FGVSSSS G +  SFG            FGA+S+S  S APLFG+A SSGSSP PSFGAAP+SGSS+AP FG+    
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                                +SS+G+SS+P FGAAPSVG +SAPSLFGG SS ATTSSAPLF TSA   + GS++FGASAAASGS +S        
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               LFGS+ F +SSSGTLSSVSTSNLF SS SS   +PFQNS SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSFST SLSKTTSIT A       SSSSSLT A
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        LGQKFWMS
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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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        SS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SS                            APLFG+A SSGSSP PSFGAAP+SGSS+AP 
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        FG+                            +SS+G+SS+P FGAAPS GA SAPSLFGG SS ATTSSAPLF TSA   + GS++FGASAAASGS +S 
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                      LFGSSPF +S     SSVSTSNLF SS SS   SPFQNS SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSFST SLSKTTSIT A       SS
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        SSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTL
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XP_031743587.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus]

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        APS GASSAPSLFGGASSATTSSAPLF TSASA +SGS LFGASAAASGSG SLFGT ATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSS STSNLFASSLS+SP
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XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]

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                                      FG++ SS  SSAPLFG+ASSSGSSPAPSFG A SSGSSL PSFGAL SS G+SSAPLFGA PS GA SAP
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        SLFGG SSATTSSAPLF +TSAS  + GSALFGAS AASGS +SLFGT +T+SGS+GS LFGSSPFGAS     SS+STSNLFASS SS   SPFQNS S
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        SSSSQNL SSS FAA    S SGFSFST SLSKTTSITTA       SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAPSTTATKP
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Query:  TSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQ
        TSLSLS+SVAPLFSTVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASS PSA+SSGAVSSFTGFGVTS ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQ
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A0A0A0KA27 Nsp1_C domain-containing protein

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        MSGFGFGSSTSQ   SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSSPSPLSL SSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSN P SSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGA
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        SSSSAPSS+ATSASSLFGVSSSS GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSG+S          PAPSFGAAPSSGSS+APSFGALSSSAGTSSAPLFGA
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        APS GASSAPSLFGGASSATTSSAPLF TSASA +SGS LFGASAAASGSG SLFGT ATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSS STSNLFASSLS+SP
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        FQ++LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSF T SLSKTTSIT                                                            
Subjt:  FQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSIT------------------------------------------------------------

Query:  -----------------------------------------------------------------------------------------------TASSS
                                                                                                       ++SSS
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        SSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSL                SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSS
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Query:  SAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSG
        SAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTS+ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSG
Subjt:  SAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSG

Query:  TTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLS
        TTST+SATVSSTPKLPSEITGKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+S
Subjt:  TTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLS

Query:  VEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
        VEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
Subjt:  VEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK

Query:  LAATEGPAADRELLGQKFWMS
        LAATEGPAADRELLGQK WMS
Subjt:  LAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A1S3CAD4 nuclear pore complex protein NUP62

0.0e+00

93.86

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Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPP-PSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA
        MSGFGFGSSTSQ SSSSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPP  SSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPP-PSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA

Query:  SSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSS----------GSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA
        SSSS PSSSA SASSLFGVSSSS GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSS          GSSPAPSFGAAPSSGSS+APSFGALSSSAGTSSAPLFGA
Subjt:  SSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSS----------GSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGA

Query:  APSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSP
        APS GASSAPSLFGGASSATTSSAPLF T+ASA +SGSALFGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SSVSTSNLFASSLSSSP
Subjt:  APSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSP

Query:  FQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTAT
        FQ+SLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSF T++LSKTTSIT       SSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTAT
Subjt:  FQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTAT

Query:  KPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASS
        KPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTS+ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASS
Subjt:  KPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASS

Query:  SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR
        SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTST+SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR
Subjt:  SQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR

Query:  IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA
        IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE+DAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA
Subjt:  IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA

Query:  NQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        NQGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  NQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP62

7.3e-208

81.45

Show/hide

Query:  FGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSL
        FGAA ++GSS    FGAAPS         G+ +SSAG+SS  LFGAAPS GA SAPSLFGG SSAT+SS PLF +SA     GSAL GAS AASG   SL
Subjt:  FGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSL

Query:  FGTLATSSGSTGSGLFG----SSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAA-SPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSS
        FGT A+SSGS GS LFG    ++ FG+++ GT    S+S LFASS+SS   S FQNS SSSSSQ+L+SSSPFAA S SGFSF T SLSKTT+  TA    
Subjt:  FGTLATSSGSTGSGLFG----SSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAA-SPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSS

Query:  SSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS
          SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFS +NAAST  S+AP TTATKPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVPAFS SSS
Subjt:  SSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS

Query:  AATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGT
        AATT+S AASS PSAASSGA SSFTGFGVT+TASSSS I SLSLPTKT TAASSSQ PASFGFPSL SASTAATT+SGFSA SQSQTSSTLVVASSSSGT
Subjt:  AATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGT

Query:  TSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSV
        TST+SA VS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE+KLELIETHQQEVDKALLSV
Subjt:  TSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSV

Query:  EEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL
        EEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+
Subjt:  EEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL

Query:  AATEGPAADRELLGQKFWMS
        AAT+GPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  AATEGPAADRELLGQKFWMS

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1

1.2e-247

77.65

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA
        MSGF FGSS+SQ+SSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP S+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTGA
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA

Query:  SSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSS----------------------------APLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPS
        SS S       S SSLF  SSSS G +SFGFG SSSS  SS                            APLFG+A SSGSSP PSFGAAP SGSS+AP 
Subjt:  SSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSS----------------------------APLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPS

Query:  FGALSS-------------SAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSG
        FG+  S             SAG+SS+P FGAAPS G +SAPSLFGG SS ATTSSAPLF TSA   + GS++FGAS AASGS +S               
Subjt:  FGALSS-------------SAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSG

Query:  LFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSF
        LFGS+PF +S     SSVSTSNLF SS SS   +PFQNS SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSFST SLSKTTSIT A       SSSSSLT ASTSSSSF
Subjt:  LFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSF

Query:  SFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG
        SFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASS PS  SSG
Subjt:  SFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG

Query:  AVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEIT
        A SSFTGFGVTSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSSTLV+ASSSSGTTST+S TVS+TPKLPSEIT
Subjt:  AVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEIT

Query:  GKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDE
        GKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDE
Subjt:  GKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDE

Query:  AASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWM
        AASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADRELLGQKFWM
Subjt:  AASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWM

Query:  S
        S
Subjt:  S

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP62

5.5e-248

77.72

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA
        MSGF FGSS+SQSSSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFGS  SPLSL SSSSSSNP+SSSS F N TSNPP S+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTGA
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGA

Query:  SSS-------SAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFN--SFG------------FGASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA----
        SS        +A SSS   +S  FGVSSSS G +  SFG            FGA+S+S  S APLFG+A SSGSSP PSFGAAP+SGSS+AP FG+    
Subjt:  SSS-------SAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFN--SFG------------FGASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA----

Query:  -----------------------LSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATS
                                +SS+G+SS+P FGAAPSVG +SAPSLFGG SS ATTSSAPLF TSA   + GS++FGASAAASGS +S        
Subjt:  -----------------------LSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATS

Query:  SGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLA
               LFGS+ F +SSSGTLSSVSTSNLF SS SS   +PFQNS SSSSSQNL+SSSPFAAS SGFSFST SLSKTTSIT A       SSSSSLT A
Subjt:  SGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLA

Query:  STSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSA
        STSSSSFSFGTPASS+SQSSFGF+I+NAAS  GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSA
Subjt:  STSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSA

Query:  PSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTP
        PSA SSGA SSFTGFG+TSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTST+SATVS+TP
Subjt:  PSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTP

Query:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDER
        KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDER
Subjt:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDER

Query:  GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL
        GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAAT+GPAADREL
Subjt:  GLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADREL

Query:  LGQKFWMS
        LGQKFWMS
Subjt:  LGQKFWMS

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

G0SBQ3 Nucleoporin NSP1

8.5e-04

28.9

Show/hide

Query:  PSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSS--SAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSSA-PLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSG
        PS+S   G+S  S+++++P S  L  ++TG+S+   S  ++S T + SLFG +++    + FG  +S++ A + A  LFG ++SS S P+    A+  SG
Subjt:  PSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSS--SAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSSA-PLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSG

Query:  SSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFG
        +     FG  S+SA  SS P          +  PSLFG  S   T+SA   ST+ +AT    +LFG++ A          T   SS  T +GLFG S   
Subjt:  SSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFG

Query:  ASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQ
         +S     S +T     S   ++P +    S       S++P  A P+  + +       +   T  +S+ +   S+S T    SS+      PA +S+ 
Subjt:  ASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQ

Query:  SSFGFSINNAASTGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLS----IAASSAPSAASSGAVSSFT
        ++      + A+T  +SAP STT T     +L++S     ++ +T +ASTPAA   T+P F   A +S+  ++TT +     + + A +AA+  + ++ T
Subjt:  SSFGFSINNAASTGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLS----IAASSAPSAASSGAVSSFT

Query:  GFG----VTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASA---STAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSA-TVSSTPKLPSE
         FG     T+ A++SS   + S P+   +  +S+ APAS G P+  +A   ++A  TT+    S  S T+ST      +  TT+ L A TV    +LP  
Subjt:  GFG----VTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASA---STAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSA-TVSSTPKLPSE

Query:  ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLD
        +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + EWDR +++N + + +L     +      E+E++L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + G    
Subjt:  ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLD

Query:  DEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATEG
        ++AA     R+  Y+ AE +  +L++M + +  +I+ +N      ++G + D      P+  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + G
Subjt:  DEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATEG

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP62

3.7e-108

51.92

Show/hide

Query:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSF------GSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSP-FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLA
        + GF FGSS++ +SSS+S  +S   FSF       ST F FGSS S    SS++ S    +SS+P F   +S    + SFGFGSS+  +  S+  SF   
Subjt:  MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSF------GSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSP-FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLA

Query:  SASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGF--GASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPS-FGAAPSSGSS----LAPSFGALSSSAGTSSAPL
        +    A+SSSAP+ S    SS    SS++ G + FGF   ++SS+A  S+ LFGA +SS ++P+ S FGAAP+SGS+     +PS  +  SSA  S++ L
Subjt:  SASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGF--GASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPS-FGAAPSSGSS----LAPSFGALSSSAGTSSAPL

Query:  FGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASS
        FGA+ S   S++P LFG  SSA T + P FS ++SA  S S++FG    A+GS  S F   +++SGS+ S  G  GSSPF  SSS   S+ ST +LFASS
Subjt:  FGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASS

Query:  LSS------SPFQNSLSSSSSQNLT---SSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNA
         S       SPF  S  +SSS + T   S+SPF+AS +GFSF  ++ S TTS TT S+   ++S          SSSSFSFGT A+S      GF++   
Subjt:  LSS------SPFQNSLSSSSSQNLT---SSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNA

Query:  ASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIG
         STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +    S A ++ P  ASS A  S TGFG+ S+  ++ +  
Subjt:  ASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIG

Query:  SLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT
        S +     KTST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERT
Subjt:  SLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT

Query:  GKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIEREL
        G+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +EREL
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Query:  EQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        E MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+P+D VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G   DREL+  K WMS
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore

2.6e-109

51.92

Show/hide

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        + GF FGSS++ +SSS+S  +S   FSF       ST F FGSS S    SS++ S    +SS+P F   +S    + SFGFGSS+  +  S+  SF   
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Query:  SASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGF--GASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPS-FGAAPSSGSS----LAPSFGALSSSAGTSSAPL
        +    A+SSSAP+ S    SS    SS++ G + FGF   ++SS+A  S+ LFGA +SS ++P+ S FGAAP+SGS+     +PS  +  SSA  S++ L
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Query:  FGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASS
        FGA+ S   S++P LFG  SSA T + P FS ++SA  S S++FG    A+GS  S F   +++SGS+ S  G  GSSPF  SSS   S+ ST +LFASS
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Query:  LSS------SPFQNSLSSSSSQNLT---SSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNA
         S       SPF  S  +SSS + T   S+SPF+AS +GFSF  ++ S TTS TT S+   ++S          SSSSFSFGT A+S      GF++   
Subjt:  LSS------SPFQNSLSSSSSQNLT---SSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNA

Query:  ASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIG
         STG S+AP++        S S +V  + +T TTTS+STPAA  T+ P+ S PA + +  +    S A ++ P  ASS A  S TGFG+ S+  ++ +  
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Query:  SLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT
        S +     KTST ASSSQ   +   P+ + +  ++T+T+  + SS + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERT
Subjt:  SLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT

Query:  GKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIEREL
        G+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +EREL
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Query:  EQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
        E MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+P+D VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G   DREL+  K WMS
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Sequences

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CDS sequence

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ATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCGACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACGGCCTTTTCCTTCGGATC
GTCTCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCTTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACCTCCAATCCTCCTCCTTCTTCTTCCTTTG
GCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCTCCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCTCAGCAACT
TCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGCTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCTTCATCAGCAAACTCCTCTGCTCCCTTGTTTGGGGCTGC
TTCCTCCTCCGGGAGCTCACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGCAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGAGCTCTTTCCTCCTCTGCTGGGACCTCCTCTG
CGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGTAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTAGCACATCTGCA
TCCGCTACAAATTCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCTGGTACCTCTCTGTTTGGGACATTAGCTACATCTTCAGGAAGTACAGGTTCAGG
TTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTGTCATCGGTTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTATCCAGTTCTCCGTTCCAGAACTCCC
TTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCAATTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCACT
GCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTC
TTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGTGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGT
TCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTG
TCCATAGCGGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTT
ATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCGCCAGCCTCTTTTGGCTTCCCTTCTCTGGCATCTGCTTCCACTGCTGCTACCACCACATCCGGTT
TCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTCTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCA
TCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTTCAAGAGCGTACCGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGA
TAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTTCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTC
ATCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAAGCTGCATCTACAAGGGAT
GCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGTGAACTTGATGT
GATTGATGGGATGACGCCGATAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGA
AGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CTAAGAAACATCCTTCAAAATTCAAAGAGAAACCATAGACTCAAAAGTTGTTATCCACGTGGACGAAACGCGCCACCGCCGTTCGAGCTGCTGTCCAATCCCGTCTTCCT
CCGTTCGCCTTCGTTGTCCGATCGATCTATTTATTTGCAAAAGGGCAAATGGGACATTTCAATTTTCATACCAATTTCCTCTAAAACCCCTAAAACCCTTCACTTCACAG
TCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCGACCACTGGTTTCTCCTTCG
GATCCACGGCCTTTTCCTTCGGATCGTCTCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCTTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACCTCC
AATCCTCCTCCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCTCCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTC
TAGCGCCCCTTCTTCCTCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGCTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCTTCATCAGCAAACT
CCTCTGCTCCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGAGCTCACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGCAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGAGCTCTT
TCCTCCTCTGCTGGGACCTCCTCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGTAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAG
TGCACCATTGTTTAGCACATCTGCATCCGCTACAAATTCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCTGGTACCTCTCTGTTTGGGACATTAGCTA
CATCTTCAGGAAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTGTCATCGGTTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTA
TCCAGTTCTCCGTTCCAGAACTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCAATTCTTT
GTCTAAAACTACTAGTATTACCACTGCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACAC
CTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGTGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCG
TTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTC
GAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCGGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTT
CTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCGCCAGCCTCTTTTGGCTTCCCTTCTCTGGCATCTGCTTCC
ACTGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTCTTAGTGCAAC
AGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTTCAAGAGCGTACCGGAAAGTTTCGAAAGC
AGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTTCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAG
AAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCATCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGA
CGATGAAGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATG
CAAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGATAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCC
GAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGAATTGTAAGCTGGTTTTA
GTTTTATTTGTTGTGAAGCTGAACTGGAAATCTTTTTGTCCAAAAGGATATATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATATAGGGTGGGCAATCGAATTTT
CGACGATTTAGATGAGGTAGAGATACTTTAATCGATAAACTAGGCTCAAGCCTCAAGTTGGTGCATAAAACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCTTTTACAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSAT
SASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSA
SATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITT
ASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTL
SIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLP
SEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD
AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS

PI0024463 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome