; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024498 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024498
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein yippee-like
Genome locationchr07:21844699..21851543
RNA-Seq ExpressionPI0024498
SyntenyPI0024498
Gene Ontology termsGO:0000151 - ubiquitin ligase complex (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004910 - Yippee/Mis18/Cereblon
IPR034751 - Yippee domain
IPR039058 - Yippee family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649834.1 hypothetical protein Csa_012456 [Cucumis sativus]2.3e-6392.48Show/hide
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XP_038899427.1 protein yippee-like At5g53940 [Benincasa hispida]7.5e-6798.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L050 Protein yippee-like2.0e-6595.35Show/hide
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A0A1S4E4C9 Protein yippee-like1.4e-6696.9Show/hide
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A0A6J1CDY9 Protein yippee-like3.9e-6188.37Show/hide
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A0A6J1F692 Protein yippee-like1.9e-6088.37Show/hide
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A0A6J1IP05 Protein yippee-like3.9e-6189.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P59234 Protein yippee-like1.0e-3763.81Show/hide
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Q9C777 Protein yippee-like At3g112305.1e-3460Show/hide
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        ER ++
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Q9FN32 Protein yippee-like At5g539404.9e-5373.64Show/hide
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        ERGRIVD+I+ ST  +ID+  S SD+EDS
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Q9LY56 Protein yippee-like At3g558903.3e-3353.49Show/hide
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        E  +I            DS   +SD +D+
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Q9SR97 Protein yippee-like At3g089901.9e-3650Show/hide
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        ER +++    +  G+ ++    ++ S+D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40110.1 Yippee family putative zinc-binding protein8.4e-4065.71Show/hide
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AT2G40110.2 Yippee family putative zinc-binding protein1.9e-3966.67Show/hide
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AT3G08990.1 Yippee family putative zinc-binding protein1.3e-3750Show/hide
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AT3G08990.2 Yippee family putative zinc-binding protein1.3e-3750Show/hide
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AT5G53940.1 Yippee family putative zinc-binding protein3.5e-5473.64Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATGTGGACAAATTGTCGGGTGGAAATATGAGGCAGCGCATGAGAAGAGCCAAAAGTACAAAGAGGGGAAGTATGTTCTTGAAAGGGGGAGGATAGTTGACGACATTGAA
TTCTCGACTGGCTTCTTTATAGACTCTCGGTCTAGTATCAGTGATAGCGAAGATAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAATTGAACCCATTCTCCGTTCATCGGAACCACACTGATATCCAATGGGCCAAATCTTAGAGCTTCTTCTTACGTCAACAGTGGCGGTGATCGTGTCCTTTCCGTACT
GGAAGATGGACGGATTTAGGGGCAAAAGGCGGTTTCCATTTTTCTCAAAATTCAAGCTACTGACTCTGGCGTAATCCTTCCCCGTTGAAGCTGAGGCGGAAGACGGGAGC
TTAGAGGAGCGTGGAGTGGCGGAAGAGAGCGATGGGACGGGTTTTTGTTGTGGAAAGGGAAGGGAGGTCTTACAGATGCAAATACTGCAATACGCAGTTAGCTCTCTTCG
ACGACCTTGCATCTCGGGCCTTTCATTGCCGGCATGGAAAAGCATACCTTTTCAATAATGCGATAAACATTTCTTTTGGAGCATTGGAAGAGAGGATGATGCTCTCAGGA
TTGCACACTGTAGCAGACATATTTTGTTGCACATGTGGACAAATTGTCGGGTGGAAATATGAGGCAGCGCATGAGAAGAGCCAAAAGTACAAAGAGGGGAAGTATGTTCT
TGAAAGGGGGAGGATAGTTGACGACATTGAATTCTCGACTGGCTTCTTTATAGACTCTCGGTCTAGTATCAGTGATAGCGAAGATAGTTAGAGTGAGATATTATCATGTA
GTATACAGTAAATCATAATAATTACCAAATGATGATGTTCATGTTTGCATATAATCTAATAATGTCTGGACTATGTAAATGCAGAGTTATCTAGATAGGCATGCCTATTT
TTCTTAATTCTCCCACCCTTCTAGCTCATCACTCCATTTTGTTCCTTATTTTCGGTGCAACAATTTCACTAACTTTCCATTGCTGGCTGACCTTTCTAACTCTTTTGACC
CATTTGACTCTGTAGTTGAGTGATTGCTTCTATGTCATATAAAGCTGCTGCAGGCTCCCAAACTATGATGTAAGTTTTTGGTCATTGATATTAGTTGTTGAGACTTGAGC
TTTCAGAATGATCAACAAATGTATTTTTTCTTTTCAACTTCAGCTAACACATGGAGGTGAAAATATGAACCCTAATCCTTTTAGTCAACGATGTATGCTTTAACGAGTTG
AGTTGTCCTCAAGTTAATAAAATACTTGGTTTTTAAAAACTTGTTTTAAAATTTTGTTGAGATTTACCAAATTCTTGAATGGTATAAGAGACTTTGACTAAACCATCATG
GTTTGGATTAGTCGTCAATAATGGCCAAAAATATAATAAAGGATTTAGAGAGAATGAGTTAATGTAGCTGTTTACCTAAGATTTAATATTCTATGAGTTTTTTTGGTACT
CAAATGTTGTAAGGTTAGAAAGATAGATAACTTCACCTTAAACTGGGCCCCTTGATTTTGGTTTGGTTCAAATGCTGTATGGATAAATATGTTACCTTTTTCATATTTCT
TTTCTTGATATATTTGTATAGGCTGTTTAATGTGGTGGTTGTATTAAAATATTATGATTGTTTTTTTACTGCTATTTTTGTTATATTTAATCTCTTGTATAATTTACAAC
CGCACACTTGGAAAAAGACTGGTGGCTGTATAATTTTGATGGAACATTACAATTTTATCCGTTAAAAAGACAGTTACATGTAGTTTAGTTTAAGAATACGTTTGAATCAT
TAATGTAGAACACTTTATTGGTTGAGTTATGATCACGTTACAAGGTAGGTCAATTATTGATCTTATGATTGTCATAAATTAGTATGTGGATCAATTGTTAATTGTTGTGC
AACAAAAACTCATTAAATAGCATAAATGCACTTAAAATTGTAATAGATTGTTGAACTCTCAATTTTCAATCTTACAGGTTTTTGAATTTTTTATTTTGCATTAATAAGTT
ACTCTTATATTTGATTTTCTTTCTTTTTTTTTCTTATGAAGTCACTCCTATATTTGATATTTGATATTTGTTTTCCTTTTTTCTTATGGAGTCACTCTATTTCTTTTTCC
TATTTATTCATATGGTTGTCCTACGAGCATGATTTCTCCTACTAGGGGTCTTTGTCAAGGTCATCCTTTGTCTCCTATCTCTTCTTTCTTGTACAGAAGGCTTGTCAGTT
GTCAAGATAATCATGGACTGATATTTGTCCGGCATGAACTTGCCCTCCTATTGCTCATCTTTTCTTTGCAGATGAAAGCCTTATTTTTAAAGGTGTCTGGTCAATAATTT
TTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTCAAACGAATTCTCTTAATGTTTACAAGAAAGGATTCGGGAAAAGCGAGAATATAAATTGTGTATGGTTTTCTCTTTTAATGTTCAGTCT
GATTATCAGTGAATTATTCAAGTTAATGCAGTGGGGTCTCTTTGTATCTATCTTGGGATGTCGTTGATCATCTCCTGTTGTAAATCTCAGGATTTTTGGCATAGCAAAGA
CCAAATTTGGAAATGTTTACAAGGTTGAAAAGGCCGTTTTTTCTCAATGGGAGGTATGTTAATTAAGAGTGTGGTTCATGCAATTCCTACGTTAGTGATGGGTTGTTTCA
GGTTGCCTACAGGTTTTTACAAGGATATTATGTGTTTGTGTGCTTAATTATGGTTCAGGCGAAAGGTCAATATGCATTGGTTGTCTTGAGATAAACTGTCTTCCTAAGAG
GTGGGTGGATTGAGTTTTAGGGATTTGAGGTCTTTAACCAAGTTCTCCTGGCTAAACAAGCTTGGTGTTTTTTAAACAATCCTTGCTCTTCCTTGGTTGATAAGGTGTTA
CAAGGGAGATATTTGTCTTCTATTCTTTTGCTAAGGTTTCTCGATATTGTTTGTTTTTCTGGAAAGGTTTTGTTTTGGGTATTAATTTGTTGAAATTTGGACTTCGCACA
AGCATTGGTAATGGAGTATCAACTCATATGTCTAGTGATCCTTGGACACCAAGGCTTTCTGCTTTTCGTCCTATTACACTGAATCAAGTGCTTTAGATCTCCTAGTGTCG
GATTTTATAACCATGTAAAGATAGAGGGATATAGGTAAGTTTGAGCAATTTTCATTCTATTGACTATGAGGTTATTCTTGGAATCCTGCTTAGCCAAACTGTTACTGATG
AAGGGTGGTTGTGGAACTTTGATAAATGAGGTTATGCTTCTTTACAAACGTTCCTCCACCACTAGTGAGAATGTTTGGGTCCGATGGTGGAAAAGTTTATGGAGCTCAAA
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ATAATTTATTGGTTCTATCGTTATCGTTTCGAAGTGTTTGGACTAGAATATGTTCATAGTTACTATGGACCTTCCTCTATTGTGGTGTTGGGCAACAAGAATATGAGTTT
TCTTAGTCCTTTCGGTCATCTTGGTCATTTTGTTCTTTATGTCGATGCTTCTTGCTGAGCGGGTTTTGATTCTACTGGCTTTGGAGCTATGGTGATAGATGATACAGGTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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