; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024587 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024587
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionPhotosystem II CP47 reaction center protein
Genome locationchr06:11600020..11600585
RNA-Seq ExpressionPI0024587
SyntenyPI0024587
Gene Ontology termsGO:0009772 - photosynthetic electron transport in photosystem II (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0045156 - electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000932 - Photosystem antenna protein-like
IPR036001 - Photosystem antenna protein-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
PWA96863.1 PSII 47 kDa protein, chloroplast [Artemisia annua]8.8e-4094.38Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGIV
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVS GLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGIV
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGIV

QVL25319.1 photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein [Gmelina hainanensis]8.8e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

YP_009434894.1 photosystem II 47 kDa protein [Lobelia hartlaubii]8.8e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

YP_009532556.1 photosystem II 47 kDa protein [Echinacanthus attenuatus]8.8e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

YP_247626.1 photosystem II 47 kDa protein [Cucumis sativus]8.8e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4EU40 Photosystem II CP47 reaction center protein4.3e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

A0A1X9Q1E5 Photosystem II CP47 reaction center protein4.3e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

A0A218KG68 Photosystem II CP47 reaction center protein4.3e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

A0A2L0VCT5 Photosystem II CP47 reaction center protein4.3e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

G3ETS3 Photosystem II CP47 reaction center protein4.3e-4095.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4GYT7 Photosystem II CP47 reaction center protein3.4e-4294.32Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRV TGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

O03061 Photosystem II CP47 reaction center protein3.4e-4294.32Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRV TGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

Q09G20 Photosystem II CP47 reaction center protein3.4e-4294.32Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRV TGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

Q14FD1 Photosystem II CP47 reaction center protein3.4e-4294.32Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRV TGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

Q2QD63 Photosystem II CP47 reaction center protein1.2e-4295.45Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00680.1 photosystem II reaction center protein B6.9e-4393.18Show/hide
Query:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI
        AFVVAGTMWYGS TTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE  RRVS GLAENQSLSEAW+KIPEKLAFYDYIGNNPAK GLFRAGSMDNGDGI
Subjt:  AFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQE--RRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGCTTTGGATCCGCTCAAGGACCTACTGGTTTAGCTTTTGTTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCAGAAACTACTCCGATTGAATTATTTGGGCCCACTCGTTA
TCAATGGGATCAAGGATACTTCCAGCAAGAACGAAGAGTTAGTACCGGGTTAGCCGAAAATCAAAGTTTATCAGAAGCTTGGTCTAAAATTCCTGAAAAATTAGCTTTTT
ATGATTATATCGGGAATAATCCCGCAAAAGATGGATTATTTAGAGCGGGTTCCATGGACAACGGGGATGGAATAGTTACATTAAGTAAAAAGTCTCAAACTAGAGAATCA
AGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGCTTTGGATCCGCTCAAGGACCTACTGGTTTAGCTTTTGTTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCAGAAACTACTCCGATTGAATTATTTGGGCCCACTCGTTA
TCAATGGGATCAAGGATACTTCCAGCAAGAACGAAGAGTTAGTACCGGGTTAGCCGAAAATCAAAGTTTATCAGAAGCTTGGTCTAAAATTCCTGAAAAATTAGCTTTTT
ATGATTATATCGGGAATAATCCCGCAAAAGATGGATTATTTAGAGCGGGTTCCATGGACAACGGGGATGGAATAGTTACATTAAGTAAAAAGTCTCAAACTAGAGAATCA
AGATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCFGSAQGPTGLAFVVAGTMWYGSETTPIELFGPTRYQWDQGYFQQERRVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKDGLFRAGSMDNGDGIVTLSKKSQTRES
R