; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024623 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024623
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationchr04:9660224..9663048
RNA-Seq ExpressionPI0024623
SyntenyPI0024623
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141196.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X1 [Cucumis sativus]1.6e-10598.97Show/hide
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XP_008443563.1 PREDICTED: LOB domain-containing protein 25-like [Cucumis melo]2.2e-9498.31Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]9.9e-9598.87Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]3.2e-9392.42Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.6e-10095.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein7.9e-10698.97Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.1e-9498.31Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.1e-9498.31Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like1.5e-9392.42Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like3.3e-8892.09Show/hide
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        KELDATNA+LIRYAC+EIPAPSPSSSSQYARRSSSTSH+G SSTSSYGHYY+  YFSPWSN++NG CGDGHDK ++K
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 64.2e-4063.64Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC PDCVFAPYFPP+ PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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          +L +Y  +   A + S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 28.5e-4152.57Show/hide
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        L    ++L +Y    I A +  S        ++     G++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.4e-5184.68Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Query:  DATNADLIRYA
        + TNADL+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 64.2e-4063.64Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC PDCVFAPYFPP+ PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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          +L +Y  +   A + S+S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES1.2e-5078.23Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 251.0e-5284.68Show/hide
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Query:  DATNADLIRYA
        + TNADL+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.4e-5278.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NADL  Y  S   A +P +
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.4e-5278.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.4e-5278.23Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein8.4e-5278.23Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAACAACAGCTTACAGAAAGGAGAGAAAGGGGAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGACG
AAAATGCCTACCGGATTGTGTTTTTGCGCCATATTTTCCGCCCGAAGAGCCTCAAAAGTTCGCCAATGTTCACAAGATCTTTGGTGCCAGTAATGTCAGCAAACTGTTGA
ACGAAGTCCAGCCACATCAGCGGGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCCTACGAGGCCGAGGCGAGGATGAAAGACCCTGTCTATGGCTGCGTTGGCGCCATCTCTATACTC
CAAAGGCAAGTCATCAAGCTCCAAAAAGAGCTCGATGCTACTAACGCCGACCTCATTCGCTATGCCTGCAGTGAAATCCCAGCCCCATCTCCATCTTCATCGTCGCAGTA
TGCTCGTAGGTCTTCGTCAACAAGCCACGAGGGTGGCTCGTCTACTTCTAGCTATGGTCATTACTATACTGGTCTCTACTTTTCACCATGGAGTAACAACAATAATGGCC
CTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGATTACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATGGCTTCAACTTCATTTTGCTTAAGGTTTTCATACAAGAGATGTTGAAACAACAGCTTACAGAAAGGAGAGAAAGGGGAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTTCCAC
CTACTCCAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGACGAAAATGCCTACCGGATTGTGTTTTTGCGCCATATTTTCCGCCCGAAGAGCCTCAAAAGTTCGCCAATG
TTCACAAGATCTTTGGTGCCAGTAATGTCAGCAAACTGTTGAACGAAGTCCAGCCACATCAGCGGGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCCTACGAGGCCGAGGCGAGGATG
AAAGACCCTGTCTATGGCTGCGTTGGCGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAAGTCATCAAGCTCCAAAAAGAGCTCGATGCTACTAACGCCGACCTCATTCGCTATGCCTG
CAGTGAAATCCCAGCCCCATCTCCATCTTCATCGTCGCAGTATGCTCGTAGGTCTTCGTCAACAAGCCACGAGGGTGGCTCGTCTACTTCTAGCTATGGTCATTACTATA
CTGGTCTCTACTTTTCACCATGGAGTAACAACAATAATGGCCCTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGATTACAAGTAAATATTTTTCAATTGATATCGTTATCTTTAT
AATTTGAATCATCACAAGGGATAATATCATATGTTGATATGGGTGTGAAAATTTTATGATATTTTGATCATAAATATAACCAATAATTACAAATCACATCTGTTGTATTC
GTCTAGTTTGTAAGTTATATCTCTGCATTTTGAAAATTGATTTCAAACATTCTTGTAATTTGCAGAATCTAAAAATCAGAAATGCCCTTTTATTGAATATCAGATATATA
TATAAAGAATAATTCTCGTGTAACAATTTTTGTTAAACTTAACCAATAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKQQLTERRERGKNYWKMSSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISIL
QRQVIKLQKELDATNADLIRYACSEIPAPSPSSSSQYARRSSSTSHEGGSSTSSYGHYYTGLYFSPWSNNNNGPCGDGHDKGDYK