; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024743 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024743
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSuperoxide dismutase [Cu-Zn]
Genome locationchr11:5417035..5421049
RNA-Seq ExpressionPI0024743
SyntenyPI0024743
Gene Ontology termsGO:0019430 - removal of superoxide radicals (biological process)
GO:0004784 - superoxide dismutase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001424 - Superoxide dismutase, copper/zinc binding domain
IPR018152 - Superoxide dismutase, copper/zinc, binding site
IPR024134 - Superoxide dismutase (Cu/Zn) / superoxide dismutase copper chaperone
IPR036423 - Superoxide dismutase-like, copper/zinc binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
APO14279.1 superoxide dismutase 3 [Luffa aegyptiaca]1.2e-10189.69Show/hide
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XP_004145768.1 superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic [Cucumis sativus]3.1e-10895.52Show/hide
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XP_008465422.1 PREDICTED: superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic [Cucumis melo]5.8e-10795.52Show/hide
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XP_038902141.1 superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic [Benincasa hispida]2.5e-10291.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEQ1 Superoxide dismutase [Cu-Zn]1.5e-10895.52Show/hide
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A0A1L5JHV7 Superoxide dismutase [Cu-Zn]6.0e-10289.69Show/hide
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A0A1S3CNS3 Superoxide dismutase [Cu-Zn]2.8e-10795.52Show/hide
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A0A5A7T2V6 Superoxide dismutase2.4e-10395.37Show/hide
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A0A6J1K3P0 Superoxide dismutase [Cu-Zn]1.5e-10089.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04997 Superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic2.7e-8378.73Show/hide
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O65199 Superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic3.5e-8375.93Show/hide
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P07505 Superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic2.4e-8476.13Show/hide
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P10792 Superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic6.4e-8575.8Show/hide
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P14831 Superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic7.9e-8376.26Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08830.1 copper/zinc superoxide dismutase 11.1e-5266.22Show/hide
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        IPL+GPNS+VGRA VVH   DDLGKGGHELS  TGNAGGR+ACG++GL
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AT1G08830.2 copper/zinc superoxide dismutase 11.1e-5266.22Show/hide
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AT2G28190.1 copper/zinc superoxide dismutase 22.0e-8174.43Show/hide
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AT5G18100.1 copper/zinc superoxide dismutase 31.0e-4860.81Show/hide
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        +AVA++ G +NV G +   Q   G T V  +I+GL+PG HGFH+H FGDTTNGCISTGPHFNP    HG P +E RHAGDLGNI+A ++GVAE  I D  
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        IPLSG  S++GRA VVH   DDLGKGGH+LS +TGNAG R+ CG++GL
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AT5G18100.2 copper/zinc superoxide dismutase 37.2e-3960.32Show/hide
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        +AVA++ G +NV G +   Q   G T V  +I+GL+PG HGFH+H FGDTTNGCISTGPHFNP    HG P +E RHAGDLGNI+A ++GVAE  I D  
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        IPLSG  S++GRA VVH   DDLGKG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGCAGTTCTTGCAGCTATGGCCGCACAATCCATTCTCTCTGTTTCCCTATCCAACTACATCGCATTGCCCCCATTCTCCAATTCTTCCTCTTCCTCTTCTCTTTC
TCTCACCTCCTCCTTCCATGGCGCCTCTCTCAAACTCCCTCGCCACTCCCTCTCCCTCGCCGCCTCAGTTGCCCCCAAACCCCTTGCTGTCGTCGCCGCCACCAAGAAAG
CTGTCGCTGTCCTCAAGGGAACTTCCAACGTTGAAGGCGTTGTCACCCTCACCCAACTAGACGATGGTCCAACATCAGTCAATGTGCGTATTACCGGGCTCACCCCAGGT
CTTCATGGATTCCATCTTCATGAATTTGGAGACACAACGAATGGATGCATTTCTACAGGACCACATTTTAATCCTAACAAGTTAACGCATGGTGCTCCCGAGGACGAAAT
CCGACATGCGGGTGACCTGGGAAACATAATTGCCAATGCTGATGGAGTAGCAGAGGCAACCATTGTAGATAACCAGATTCCTCTTAGCGGCCCCAATTCTGTAGTTGGAA
GAGCCTTTGTGGTACATGAGCTTGAGGATGATCTAGGAAAAGGAGGTCATGAACTCAGTTCAACCACTGGCAATGCGGGTGGAAGATTGGCATGTGGTGTCGTGGGTCTG
ACTCCTGTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGGGTCGGGGCGAAAGAGACATATCATATAAGCAGTTAGTTGCTGCAAAGTGGCATACACACATCTACTGGAAGCCTCCATTTCCAATCTCCCATTATCTCATTAT
CATCGACAGTTCCCCATAGCTAATGCAAGCAGTTCTTGCAGCTATGGCCGCACAATCCATTCTCTCTGTTTCCCTATCCAACTACATCGCATTGCCCCCATTCTCCAATT
CTTCCTCTTCCTCTTCTCTTTCTCTCACCTCCTCCTTCCATGGCGCCTCTCTCAAACTCCCTCGCCACTCCCTCTCCCTCGCCGCCTCAGTTGCCCCCAAACCCCTTGCT
GTCGTCGCCGCCACCAAGAAAGCTGTCGCTGTCCTCAAGGGAACTTCCAACGTTGAAGGCGTTGTCACCCTCACCCAACTAGACGATGGTCCAACATCAGTCAATGTGCG
TATTACCGGGCTCACCCCAGGTCTTCATGGATTCCATCTTCATGAATTTGGAGACACAACGAATGGATGCATTTCTACAGGACCACATTTTAATCCTAACAAGTTAACGC
ATGGTGCTCCCGAGGACGAAATCCGACATGCGGGTGACCTGGGAAACATAATTGCCAATGCTGATGGAGTAGCAGAGGCAACCATTGTAGATAACCAGATTCCTCTTAGC
GGCCCCAATTCTGTAGTTGGAAGAGCCTTTGTGGTACATGAGCTTGAGGATGATCTAGGAAAAGGAGGTCATGAACTCAGTTCAACCACTGGCAATGCGGGTGGAAGATT
GGCATGTGGTGTCGTGGGTCTGACTCCTGTGTGATGTTGGTGATAAACAAACTGTGTAGCCTATGAGGTCGGTACGAGGTATATGGAGGCACTATTTTATGGTCAACCAC
TTCTCCACAGGCTCGAGTTTCTTTTCTTTTGTTCAGCATATAAATTGTAGCCTCGGGAAGACAGTTTCATTACGTACTCATTGATATCTGTTACTGTGCTTTCCATTAGC
TGAATAAAATTGACTTGCTGCTTGAGCTAATGTGTTTGAATAAAGATTTGTTAACTTTAGAGACTTGTGAAGAGATATGATATTGACATTCCCTTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQAVLAAMAAQSILSVSLSNYIALPPFSNSSSSSSLSLTSSFHGASLKLPRHSLSLAASVAPKPLAVVAATKKAVAVLKGTSNVEGVVTLTQLDDGPTSVNVRITGLTPG
LHGFHLHEFGDTTNGCISTGPHFNPNKLTHGAPEDEIRHAGDLGNIIANADGVAEATIVDNQIPLSGPNSVVGRAFVVHELEDDLGKGGHELSSTTGNAGGRLACGVVGL
TPV