; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024823 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024823
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionThioredoxin
Genome locationchr04:313615..317377
RNA-Seq ExpressionPI0024823
SyntenyPI0024823
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR013766 - Thioredoxin domain
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK13382.1 thioredoxin O2 [Cucumis melo var. makuwa]8.1e-6877.96Show/hide
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XP_004134537.1 thioredoxin O2, mitochondrial [Cucumis sativus]4.2e-7286.67Show/hide
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XP_008439481.1 PREDICTED: thioredoxin O2, mitochondrial-like [Cucumis melo]7.3e-7792.12Show/hide
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XP_023545001.1 thioredoxin O2, mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.5e-5672.12Show/hide
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        MGRN++  WRLLRR LD GR   P YRNYSI SRS  LLGSSSSSS         S++PS   APDF  P +PF HCR LCSASDPSNII IKSE+  K+
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        SL KA++EALPAIFYFTA WCGPCRLL+PVIKELSK++P+VTTYKIDIDQEGLERTLNDLNITSV
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XP_038883351.1 thioredoxin O2, mitochondrial [Benincasa hispida]4.5e-6681.82Show/hide
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        MGRN+V QWRLLRRVLDDG  R P YRNYSI SRSGT LGS SSSSSSLPKFLFSSS PSL   PDFH P V F HCRSLCSASDPSNII IKSE+   +
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMC3 Thioredoxin domain-containing protein2.0e-7286.67Show/hide
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        MG+NLVP WRLLRRVLDD RLRAPF RNYS L  SGTLLGSSSSS SS  K LF+SS  SLCHAPDFHFP V  HHCRSLCSASDPSNII +KSENLLKE
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A0A1S3AYT8 thioredoxin O2, mitochondrial-like3.5e-7792.12Show/hide
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A0A5D3CPS2 Thioredoxin O23.9e-6877.96Show/hide
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        SLSKAREEALPAIFYFTA WCGPCRLLAPVIKELSK+YPEVTTYKIDIDQ  L  T+  L    +     +I IY   + C V+ S
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A0A6J1EDE2 thioredoxin O1, mitochondrial-like isoform X12.6e-5672.12Show/hide
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        MGRN++  WRLLRR LD GR   P YRNYSI SRS  LLGSSSSSSS        S++PS   APDF  P +PF HCR LCSASDPSNII IKSE+  K+
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        SL KA++EALPAIFYFTA WCGPCRLL+PVIKELSK++P+VTTYKIDIDQEGLERTL+DLNITSV
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E5GCL6 Thioredoxin3.5e-7792.12Show/hide
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        MGRNLVPQWRLLRRVL DGRLR PFYRNYS  SRSGT LGSSSS SSSL KFLFSSSS SL HAPDFHFP VPFHHCRSLCSASDPSNII IKSENLLKE
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64764 Thioredoxin O1, mitochondrial6.8e-2542.59Show/hide
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        W ++R+VL      LR+    +    S    +L  +S SS      LF++S+  PS+    DF+F      H RSLCS A   + ++ +KSE     ++S
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        KA++ +LP++FYFTA WCGPCR ++PVI ELSK YP+VTTYK+DID+ G+  T++ LNIT+V
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P29448 Thioredoxin H15.7e-0838.24Show/hide
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        AS+   +I+  +     E L KA E     +  FTA+WCGPCR +AP   +L+K  P V   K+D D+
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Q655X0 Thioredoxin O, mitochondrial1.7e-1537.84Show/hide
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        L R   LL  ++++++S P   +    PS    P    P  PF     L     S+S  S+++ + S       +SK   E LPA+FY+TA WCGPCR +
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        APVI +LS  YP++  YK+DID +G+   L+DL I S   V T   YY
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Q93VQ9 Thioredoxin O2, mitochondrial1.4e-2250.5Show/hide
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        +F+F      + RS C A  D S+ + +KSE     +LSKAR+ +LP++FYFTA WCGPCRL++PVI ELS  YP+VTTYK+DID+ GL   +  LN+++
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Query:  V
        V
Subjt:  V

Q96419 Thioredoxin H-type3.4e-0833.33Show/hide
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        ++ + +I+  +     E   KA++     +  FTA+WCGPCR++ P + EL+K +P V  +K+D+D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31020.1 thioredoxin O21.0e-2350.5Show/hide
Query:  DFHFPCVPFHHCRSLCSA-SDPSNIISIKSENLLKESLSKAREEALPAIFYFTATWCGPCRLLAPVIKELSKSYPEVTTYKIDIDQEGLERTLNDLNITS
        +F+F      + RS C A  D S+ + +KSE     +LSKAR+ +LP++FYFTA WCGPCRL++PVI ELS  YP+VTTYK+DID+ GL   +  LN+++
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Query:  V
        V
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AT2G35010.1 thioredoxin O14.8e-2642.59Show/hide
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        W ++R+VL      LR+    +    S    +L  +S SS      LF++S+  PS+    DF+F      H RSLCS A   + ++ +KSE     ++S
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        KA++ +LP++FYFTA WCGPCR ++PVI ELSK YP+VTTYK+DID+ G+  T++ LNIT+V
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AT2G35010.2 thioredoxin O14.8e-2642.59Show/hide
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        W ++R+VL      LR+    +    S    +L  +S SS      LF++S+  PS+    DF+F      H RSLCS A   + ++ +KSE     ++S
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Query:  KAREEALPAIFYFTATWCGPCRLLAPVIKELSKSYPEVTTYKIDIDQEGLERTLNDLNITSV
        KA++ +LP++FYFTA WCGPCR ++PVI ELSK YP+VTTYK+DID+ G+  T++ LNIT+V
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AT3G17880.1 tetraticopeptide domain-containing thioredoxin5.3e-0936.99Show/hide
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        R   +A +   +ISI S + L+     A++ +   I YFTATWCGPCR ++P+   L+  +  V   K+DID+
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AT3G51030.1 thioredoxin H-type 14.1e-0938.24Show/hide
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        AS+   +I+  +     E L KA E     +  FTA+WCGPCR +AP   +L+K  P V   K+D D+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGAAATTTAGTCCCTCAGTGGCGTCTACTCCGTCGAGTTCTTGACGACGGCCGACTCCGAGCTCCATTTTATCGCAACTATTCTATCCTCAGTCGCTCTGGAAC
ACTTCTTGGAAGCTCGTCATCATCGTCGTCTTCGTTGCCCAAGTTCCTCTTCAGCTCCTCCAGTCCCTCCCTTTGTCACGCGCCGGACTTTCATTTCCCATGTGTGCCTT
TCCATCACTGTCGATCTCTATGCTCAGCGTCAGATCCTTCGAACATTATATCGATAAAGTCTGAAAATCTATTAAAGGAGTCACTAAGCAAAGCACGAGAGGAAGCTTTG
CCGGCAATTTTCTACTTCACAGCTACCTGGTGTGGCCCTTGCAGATTATTAGCTCCTGTGATCAAAGAATTGAGTAAGAGCTATCCTGAGGTGACAACATATAAAATTGA
CATTGATCAGGAAGGCCTCGAAAGGACTTTGAACGACTTAAATATTACCTCTGTGGTAAGAGTCTCGACTCTTATTATTTACTACAGCCGTGTTATTTGTTTTGTGAATA
GCTCGAGAGCTCGGGCATTTCTATCTTCGTGCCTAATTTCAACCAAGGTTTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCAAATCCATTCCTACCGTGATACCATTCTAATTCCCTCGAAACACGAAAGAGGGAAAAGAGTGATTCTCAATTTCGGGGAACCGGCAGAATGGGAAGAAATTTAGTCC
CTCAGTGGCGTCTACTCCGTCGAGTTCTTGACGACGGCCGACTCCGAGCTCCATTTTATCGCAACTATTCTATCCTCAGTCGCTCTGGAACACTTCTTGGAAGCTCGTCA
TCATCGTCGTCTTCGTTGCCCAAGTTCCTCTTCAGCTCCTCCAGTCCCTCCCTTTGTCACGCGCCGGACTTTCATTTCCCATGTGTGCCTTTCCATCACTGTCGATCTCT
ATGCTCAGCGTCAGATCCTTCGAACATTATATCGATAAAGTCTGAAAATCTATTAAAGGAGTCACTAAGCAAAGCACGAGAGGAAGCTTTGCCGGCAATTTTCTACTTCA
CAGCTACCTGGTGTGGCCCTTGCAGATTATTAGCTCCTGTGATCAAAGAATTGAGTAAGAGCTATCCTGAGGTGACAACATATAAAATTGACATTGATCAGGAAGGCCTC
GAAAGGACTTTGAACGACTTAAATATTACCTCTGTGGTAAGAGTCTCGACTCTTATTATTTACTACAGCCGTGTTATTTGTTTTGTGAATAGCTCGAGAGCTCGGGCATT
TCTATCTTCGTGCCTAATTTCAACCAAGGTTTACTGATTGCATTCCACAATTTGATCTGCCCGTTTACATCTAATATTGCTATGTGATTTAATCTTGAGAGGACCAACCA
ATCGGGTTATTTTTCTCAAGGTAAATAACTTTGTTTCTGCATTTGTCAATCCTAACGGATGGTGAGTGAGTACATATTTTTGCTCCTCTTAGAACTTTTGGATGACATTT
ATGACCATACTTGAACAAGATCTATTCTATAGATTGTACAGCTTATCCTCGAGTTTTTGGAATTGTTGGATGACATTATGCCTTTGCTTCGGTAGTTTTATCATTTATTG
TCTGCTTGGTTTCACTCCACTTTGTTTAAGTGAAAATGAGAGGGGAGATTGGGGAAAAACCTTCAGTCATATTGGCCTTGTTCGTTTGTCTTCAAAACTTACATATAAAC
ACTCTTATTTTCTTATACATTTCCCTATAGCAAAATTTTATCAGCTCACGTGATTTTTCTAGACTATGATGTATGTGAATAGTGAATGTGGAGTGTCCAGTAATTTTAAT
CTTAGGTTGTTTTAAAGCGCCTCCCATTATGAATGCAGTTTTATATTAAATCCAAAAGGGTTATAGTTCAAACGACCATAAAAACTTGTCAGAATTCATTTTGTTATATT
TATTTCTGTAGTAGATCCAATTATATCTCATACGCTTATTGTGGTGTTTGGCAAGCAGCCAACACTTTATTTCTTTCAGGATGGGAAAGAGGCTGGGAAAATTGTCGGTG
CTGATGTTGCAGGCATAAAAAATATAATGGAGCAGGTTTACAAAAAATGACCTAACGTATTTTGCTTTATCCATTTTCAAAGCAGGTTTACGACTTGATGCCAAGTAGAT
TCTGAAGTTTACCGTTGGTATTTAAATTTAATAGTGTTACGAAATTTGATAACTTTCAGAATGTGATGACTAATAAGAAGTTGCAAACAGGTCTGTTCTTTCATGTGATG
ATGAGAATCCTTTTACCGAAAGTATTTAACGAGAGAATTGATACAGAATTTTTGTGGAGTATGAAGATTTGCAATTTGATAGTTATTTAAGGCACATTTGAGTGTTAAGA
GTGACACAAAAATTTATAGTATTTTTTTTTTTTTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRNLVPQWRLLRRVLDDGRLRAPFYRNYSILSRSGTLLGSSSSSSSSLPKFLFSSSSPSLCHAPDFHFPCVPFHHCRSLCSASDPSNIISIKSENLLKESLSKAREEAL
PAIFYFTATWCGPCRLLAPVIKELSKSYPEVTTYKIDIDQEGLERTLNDLNITSVVRVSTLIIYYSRVICFVNSSRARAFLSSCLISTKVY