; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024983 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024983
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL18-like
Genome locationchr11:17892627..17894203
RNA-Seq ExpressionPI0024983
SyntenyPI0024983
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047798.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucumis melo var. makuwa]4.3e-7188.97Show/hide
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KAG7010790.1 RING-H2 finger protein ATL18, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.4e-3959.87Show/hide
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TYK01060.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-7088.28Show/hide
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XP_022944066.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucurbita moschata]7.4e-3960.53Show/hide
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XP_023512248.1 RING-H2 finger protein ATL18-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-3960.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KFW5 RING-type domain-containing protein2.4e-6792.59Show/hide
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        PLCRC FFF+DN KM+TKWSFLVPDNPSSLYYFLQ
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A0A5A7TXY0 RING-H2 finger protein ATL18-like2.1e-7188.97Show/hide
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A0A5D3BPT9 RING-H2 finger protein ATL18-like1.0e-7088.28Show/hide
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A0A6J1FTE6 RING-H2 finger protein ATL18-like3.6e-3960.53Show/hide
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        MLGL +L S +   I+FFNTF+WIPLFR+K+AILG VA+VF L   PE  +     L+VR Y+E     DR+  EE+CSICLTEF R  DSVC+LP+C H
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        +FHF+CI++W +RNRFTCPLCRCFF  + H  E K  F+VPDNPSSLYYFLQ
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A0A6J1G855 E3 ubiquitin-protein ligase ATL41-like3.7e-3659.42Show/hide
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        I FFNT++WIPL R+K AI+G V +VF L   P S       L+VR Y+E     DR+ EEICSICL EF R GDSVC LP+C H+FHF+CI++W++RNR
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        FTCPLCRCFFF +  ++ E K  F+VPDNPS LYYFLQ
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8GW38 RING-H2 finger protein ATL471.4e-0842.67Show/hide
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        D L V  Y E + ++E   C++CL EF    D +  LPNC H FH +CI  W+  N  TCPLCR   F   H+ E
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Q9FL07 RING-H2 finger protein ATL461.2e-0746.43Show/hide
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        C++CL EF    D +  LP C H FH NCI  W+  N  TCPLCR   F     ME
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Q9SUS4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHA1A1.3e-0939.19Show/hide
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        VVR  D     E+ C++CL++F  S D V +LP C H+FH  C+  WI D N+  CP+CR  F       ++ W
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Q9SUS5 E3 ubiquitin-protein ligase RHA1B1.3e-0939.19Show/hide
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        VVR  D     E+ C++CL++F  S D + +LP C H+FH  C+  WI D N+ TCP+CR  F  +       W
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Q9SZL4 RING-H2 finger protein ATL183.6e-1236.52Show/hide
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        M+ + +  SP+    + F T + IPL R+K+                + G +L+ V   D+++  E  C ICL EF  + D+V  LP C HLFH NCI+ 
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Query:  WIDRNRFTCPLCRCF
        W+ R   TCPLCR F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G11360.1 RING-H2 finger A1B9.0e-1139.19Show/hide
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        VVR  D     E+ C++CL++F  S D + +LP C H+FH  C+  WI D N+ TCP+CR  F  +       W
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AT4G11370.1 RING-H2 finger A1A9.0e-1139.19Show/hide
Query:  VVRSYDEDRSSEEICSICLTEFGRSGDSVCELPNCDHLFHFNCIQEWI-DRNRFTCPLCRCFFFKDNHKMETKW
        VVR  D     E+ C++CL++F  S D V +LP C H+FH  C+  WI D N+  CP+CR  F       ++ W
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AT4G38140.1 RING/U-box superfamily protein2.5e-1336.52Show/hide
Query:  MLGLFWLVSPMRFPILFFNTFLWIPLFRIKQAILGVVATVFGLPPSPEHGTDLLVVRSYDEDRSSEEICSICLTEFGRSGDSVCELPNCDHLFHFNCIQE
        M+ + +  SP+    + F T + IPL R+K+                + G +L+ V   D+++  E  C ICL EF  + D+V  LP C HLFH NCI+ 
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Query:  WIDRNRFTCPLCRCF
        W+ R   TCPLCR F
Subjt:  WIDRNRFTCPLCRCF

AT5G37250.1 RING/U-box superfamily protein5.9e-1048.33Show/hide
Query:  EEICSICLTEFGRS-GDSVCELPNCDHLFHFNCIQEWIDRNRFTCPLCRCFFFKDNHKME
        E  CSICL +F  S  D++  LP+C HLFH NCI EW+ R R +CPLCR   ++++ + E
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AT5G43200.1 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) family protein1.2e-1046.27Show/hide
Query:  PEHGTDLLVVRSYDEDRSSEEICSICLTEFGRSGDSVCELPNCDHLFHFNCIQEWIDRNRFTCPLCR
        P   TDL    S  E+  S + C+ICL E   S D  CELPNC H FH  C+ +W+ R   +CPLCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTAGGTTTGTTTTGGCTCGTTTCCCCTATGCGATTCCCCATCCTTTTCTTCAACACTTTCCTGTGGATTCCGCTTTTTCGTATCAAGCAAGCCATTCTGGGCGTGGT
GGCTACTGTTTTTGGCCTGCCCCCCTCCCCAGAACATGGAACTGATCTCCTGGTGGTGAGGTCATACGATGAGGATAGATCGTCGGAGGAGATTTGCTCCATCTGTTTGA
CGGAGTTTGGTAGATCAGGAGATTCAGTGTGTGAATTACCGAATTGTGACCATTTATTTCATTTCAATTGCATCCAGGAATGGATTGACAGGAACCGCTTCACTTGTCCC
CTCTGTAGATGCTTCTTCTTCAAAGACAACCACAAGATGGAGACCAAGTGGAGCTTCCTCGTTCCTGATAATCCTTCCTCTCTCTATTACTTCTTGCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAACCAAATAAAGTAGAATTCACAATATACCAACCTCCTGATCAAAGATAGTGGAGGGGAAGCAAAAAGTTAATACAAAAGAATTCCCGCCCACATCCAAGGGGTAGA
AAGAGAAAGAGGATGGGTGAAGCTGTTTTATTTTGGCTGTTAAATAAGTGATTTCTTTTAGAACTGTGTCAACAGAAGTGGGTATGAATATATGAAGGTGAAGAGAATTT
TAAATAATATACAAATTAATAAAATAAAATGATAATACATATCCCTTACTTCGTTTTTATGTTGTTCAAAATTAATGAAAACGATTTTGGCCCACAAAACTGAAGACTCC
TTCAACCTATGCTCCCAATTATATATATATATATATATATATAATGGCCATCCAAATCCACTTCCCTTCATATCAATCACCTAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TTAAAACTTCAATCCAATCGCCAATATGTTAGGTTTGTTTTGGCTCGTTTCCCCTATGCGATTCCCCATCCTTTTCTTCAACACTTTCCTGTGGATTCCGCTTTTTCGTA
TCAAGCAAGCCATTCTGGGCGTGGTGGCTACTGTTTTTGGCCTGCCCCCCTCCCCAGAACATGGAACTGATCTCCTGGTGGTGAGGTCATACGATGAGGATAGATCGTCG
GAGGAGATTTGCTCCATCTGTTTGACGGAGTTTGGTAGATCAGGAGATTCAGTGTGTGAATTACCGAATTGTGACCATTTATTTCATTTCAATTGCATCCAGGAATGGAT
TGACAGGAACCGCTTCACTTGTCCCCTCTGTAGATGCTTCTTCTTCAAAGACAACCACAAGATGGAGACCAAGTGGAGCTTCCTCGTTCCTGATAATCCTTCCTCTCTCT
ATTACTTCTTGCAGTGATTTGATCCTCTGTACATTTTGTTTCTGGATTTGGAAATTTTGTAGTTTTTATCAGTTCCCATTTCTTTTATTCTCTGTAAACGTCTTTCCAAT
AATCATCTGCAAATACAACAAACCCTCCTTCTTCAAATTCAAAACTCTCTTTCTTCTCATAATTCATTTCCAAATTCATTCTTCTGCACTGCGCAAACTCATCATCCCTT
TCATTAATTATTTTTAATCAATATACTTTACATTTCTTAATCTAATATATAATGTTAATAATGCTTATATTATAATTTGTTAAAATAATTAATAGTAACACTTAAATTAT
ATAATTTGTTTCAAAATGTCAATGCATGAACTCAATTACTCAAAACCTAAAAGAAGTCGTCTCCCTCCAAATTCCCCAACTCCATTTTTTGGCGACTATTTTCTTTTTCT
TTTTCTATTTTTAATTTACTCTTTTTAATGTTTCAACACAAAAGTCAATCTCTTTTTTCCTTTTTGAGTTGCAAATATCATTTCTTTCATTTCTTATGCTTTTTATATAT
ATATAAAAAAAAAAAGTCATTTTTTTATAATAGATGAACATTTTCTAGTGAAATACGTTGTCCCAGCTGCCATTAAAATTTATATTAATACGTTGACAATATTTTTTAAA
CAATTTTTTAGAACTTAGTTTTAAATTTTTGTATATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLGLFWLVSPMRFPILFFNTFLWIPLFRIKQAILGVVATVFGLPPSPEHGTDLLVVRSYDEDRSSEEICSICLTEFGRSGDSVCELPNCDHLFHFNCIQEWIDRNRFTCP
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