; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0025188 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0025188
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionOcticosapeptide/Phox/Bem1p (PB1) domain-containing protein
Genome locationchr03:227329..229092
RNA-Seq ExpressionPI0025188
SyntenyPI0025188
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000270 - PB1 domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142964.1 uncharacterized protein LOC101207008 [Cucumis sativus]1.8e-9281.82Show/hide
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XP_022961752.1 uncharacterized protein LOC111462427 [Cucurbita moschata]8.6e-7972.37Show/hide
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XP_022996772.1 uncharacterized protein LOC111491906 [Cucurbita maxima]2.5e-7872.25Show/hide
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        A+P SVYNIQGS  SS MF+H+G SWE
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XP_023545452.1 uncharacterized protein LOC111804876 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.0e-7972.93Show/hide
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        ASA+P SVYNIQGS  SS MF+H+G SWE
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XP_023545453.1 uncharacterized protein LOC111804876 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-8878.7Show/hide
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        SASA+P SVYNIQGS  SS MF+H+G SWE
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKJ2 PB1 domain-containing protein8.6e-9381.82Show/hide
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A0A5A7V149 Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein isoform 12.1e-6292.65Show/hide
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        ASYLERSAS++PF VYNIQGSCASSHMFLHSGNSWE
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A0A6J1BRT0 uncharacterized protein LOC1110051211.2e-5761.95Show/hide
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        MGRPPLHRNAL      T+KFLCSYGGKILPRYPDGKLRYHGGETRLL+V+RSISF                               TELL KFG LCGT
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        S+ VSFRCQLP EDLDALVS+TSDEDLANLIEEYDRAASP SS   KIRAFLSPPK Y K IS PPSS++S SSS++  HRC R +S PN  SY ERS S
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         +P  + N+ G+  S  +F+H+ NSW
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A0A6J1HAZ2 uncharacterized protein LOC1114624274.1e-7972.37Show/hide
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        MGRPPLHR ALT +PTPTIKFLCSYGGKILPRYPDG+LRYHGGETRLL+ NRSISFS                               +LLLKFG+LCGT
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        SISVSFRCQLP EDLDALVS+TSDEDLANLIEEYDRAAS SSSLKIRAFL PPKYAKRISPPSSM SFSS        S AHRCFRRMSPP+ASYLERSA
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        SA+P SVYNIQGS  SS MF+H+G  WE
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A0A6J1K2Y4 uncharacterized protein LOC1114919061.2e-7872.25Show/hide
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        SISVSFRCQLP EDLDALVS+TSDEDLANLIEEYDRAAS SSSLKIRAFL PPKYAKRISPPSSM SF       S S AHRCFRRMSPP+ASY ERSAS
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        A+P SVYNIQGS  SS MF+H+G SWE
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70640.1 octicosapeptide/Phox/Bem1p (PB1) domain-containing protein6.8e-3447.62Show/hide
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        T T+KFLCSYGG+I PRYPDGKLRY GG+TR+LSV R+ISF                               TEL  K G++CG +++ S RCQLPT+DL
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        DALV+V SDEDL NL+EEYD A   ++ +KI  FLSP K  +     SPP S TS SSS +    R  SPP+ S  E   S +  S+ N
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AT3G26510.1 Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein9.6e-3645.45Show/hide
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              S +++L H+GN W+
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AT3G26510.2 Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein9.6e-3645.45Show/hide
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              S +++L H+GN W+
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AT3G26510.3 Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein9.6e-3645.45Show/hide
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AT3G26510.4 Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein9.6e-3645.45Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAGACCTCCCCTCCACCGCAACGCACTCACCTTCAGACCTACTCCCACCATCAAGTTCCTCTGCAGCTACGGCGGCAAGATCCTCCCTCGTTATCCCGACGGCAA
ACTCCGTTATCACGGTGGCGAAACTCGCCTTCTTTCTGTCAACCGCTCCATTTCCTTCTCTGGTAACCGCTTTCACTCTCTCAATACCATTCTATTTCCCCCATCCATTC
CATTTATTTTTTTTAACTCTCATATTTCTGCTTCCTCTACAACAGAACTCCTGTTGAAGTTCGGGGACCTCTGCGGAACCTCAATTTCTGTGAGCTTCCGTTGCCAGTTG
CCTACAGAAGACCTCGATGCTCTAGTTTCCGTTACCTCCGATGAAGATCTCGCGAATCTCATCGAGGAATACGATCGAGCGGCTTCCCCTTCCTCATCGTTGAAGATCAG
AGCATTCCTTTCCCCTCCCAAATATGCCAAAAGAATATCGCCTCCTTCTTCAATGACTTCCTTCTCCTCCTCGGTGGCTCACCGTTGTTTTCGTCGGATGTCACCACCAA
ATGCTTCCTACTTGGAGAGATCTGCATCTGCGCTTCCTTTCAGTGTATATAATATTCAGGGAAGTTGTGCCTCTAGTCACATGTTCCTTCACAGTGGTAACAGCTGGGAA
TAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTGGGTTGAGGAAGAAGAAGCAAAGGCAAGTGGGTAAGCCAAAAAGGCCACAAAAGCCACAAAAGCCACCAAAGCCTCTCCTCTCTTATCTCGAATTTGAATAATACTC
GAAAAAGAATTATATTGGTGATACGACAACACATGGGCAGACCTCCCCTCCACCGCAACGCACTCACCTTCAGACCTACTCCCACCATCAAGTTCCTCTGCAGCTACGGC
GGCAAGATCCTCCCTCGTTATCCCGACGGCAAACTCCGTTATCACGGTGGCGAAACTCGCCTTCTTTCTGTCAACCGCTCCATTTCCTTCTCTGGTAACCGCTTTCACTC
TCTCAATACCATTCTATTTCCCCCATCCATTCCATTTATTTTTTTTAACTCTCATATTTCTGCTTCCTCTACAACAGAACTCCTGTTGAAGTTCGGGGACCTCTGCGGAA
CCTCAATTTCTGTGAGCTTCCGTTGCCAGTTGCCTACAGAAGACCTCGATGCTCTAGTTTCCGTTACCTCCGATGAAGATCTCGCGAATCTCATCGAGGAATACGATCGA
GCGGCTTCCCCTTCCTCATCGTTGAAGATCAGAGCATTCCTTTCCCCTCCCAAATATGCCAAAAGAATATCGCCTCCTTCTTCAATGACTTCCTTCTCCTCCTCGGTGGC
TCACCGTTGTTTTCGTCGGATGTCACCACCAAATGCTTCCTACTTGGAGAGATCTGCATCTGCGCTTCCTTTCAGTGTATATAATATTCAGGGAAGTTGTGCCTCTAGTC
ACATGTTCCTTCACAGTGGTAACAGCTGGGAATAACACCAACTCTTCCAACAGAAGAACAACCGGATTTGTCAAACCCAATACCAAATCACTTGAACTATACATATTATT
CACAAAAAAGAGAATTAAAATTGGAAGTACTCAAAGAGAGGCCAATACAATGATCTTTGGCACCAAAAGATTTTCGAGGTTGGACTCGGAGATTAAAGCTGCGGTAGACA
ACTGAGTAAGCTTCCTTGATTAAATGCAGTCTTCTGAAACAGTAATTTAATTTTAATTACATCTAAACCATGTTTTGTTTGTTATTAGTTTTTCTCAAGTCATTGCTGCG
GCTGGAGAAGCTGAAACACACAAGGGAGGGTCCATATCCCATGTGGGGTGATAGCTTTTTGGAATCTTAATCAACTGGACATGGTATATTAGAGAATGAGTGCTGGTGGT
GCATGGGATCAAAGTAGAATTTAATTGCAATCTTTTAAAACGGAGATAAGGGAACAAGAATAAATTAAATAAATAAATAAAAAGTAGATATTTGAATGAGATGAAGACTT
TGGCTTGCCTTCCACATAAATGGAGATTTCCGTTGGAAAGAGACATGCATGGCCTCTGTATATGCACCAAGCCAGAAAAGAAACACAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRPPLHRNALTFRPTPTIKFLCSYGGKILPRYPDGKLRYHGGETRLLSVNRSISFSGNRFHSLNTILFPPSIPFIFFNSHISASSTTELLLKFGDLCGTSISVSFRCQL
PTEDLDALVSVTSDEDLANLIEEYDRAASPSSSLKIRAFLSPPKYAKRISPPSSMTSFSSSVAHRCFRRMSPPNASYLERSASALPFSVYNIQGSCASSHMFLHSGNSWE