; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0025281 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0025281
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionvacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2
Genome locationchr04:424747..430111
RNA-Seq ExpressionPI0025281
SyntenyPI0025281
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0032509 - endosome transport via multivesicular body sorting pathway (biological process)
GO:0045324 - late endosome to vacuole transport (biological process)
GO:0000815 - ESCRT III complex (cellular component)
GO:0005771 - multivesicular body (cellular component)
InterPro domainsIPR005024 - Snf7 family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN49499.1 hypothetical protein Csa_003398 [Cucumis sativus]3.5e-8494.47Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREI+SLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

XP_008439501.1 PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2 isoform X1 [Cucumis melo]1.6e-8494.97Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

XP_008439502.1 PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2 isoform X2 [Cucumis melo]1.6e-8494.97Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

XP_011658526.1 vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2 [Cucumis sativus]3.5e-8494.47Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREI+SLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

XP_023544394.1 vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-8393.47Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        M++NIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREIASLQLEE+KLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KL14 Uncharacterized protein1.7e-8494.47Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREI+SLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

A0A1S3AYV7 vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2 isoform X27.5e-8594.97Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

A0A1S3AYX6 vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2 isoform X17.5e-8594.97Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

A0A6J1D013 vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 21.9e-8392.96Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        M++NIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREIASLQLEE+KLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTV S
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

A0A6J1ECU7 vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2-like9.2e-8392.46Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI
        M++NIFRKKTSPKDALRTSKREM VATRGIEREIASLQLEE+KLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSI
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLD TIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTV S
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WTY4 Vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 21.4e-7585.71Show/hide
Query:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST
        +NIF+KKT+PKDALRTSKREM VATRGIEREI SLQLEE++LVAEIK+TAKTGNEAAT+ILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSIS+
Subjt:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST

Query:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAAR
        GMKGATKAMVAMNKQMAP KQAKVIK+FQKQSAQLDMTIEMMSE+IDETLDKDEAEEETE+LTNQVLDEIGV +ASQLSSAPKGRIA +
Subjt:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAAR

Q54DB1 Charged multivesicular body protein 2a homolog 21.4e-2740Show/hide
Query:  IFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQI-------TNLQGSRAQFGALYASTSISTGM
        +F K+ +PK+ LR ++R +  + R I+RE  +LQ +E+K++ +IK+ AK G   + +I+A+ LVR R  I       T LQ    +   L ++ +++  M
Subjt:  IFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQI-------TNLQGSRAQFGALYASTSISTGM

Query:  KGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAP
        KG TKAM+ MN+QM   +  K++ EF++QS ++DM  EMM++++D+ +++D  EE+++E+ NQVLDEIG+D+ASQL  AP
Subjt:  KGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAP

Q6NXD2 Charged multivesicular body protein 2b1.2e-2337.24Show/hide
Query:  NIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQFGALYASTSISTG---MKGA
        ++F+KKT   D ++   +E+    R I R+  +L+ +E++L  EIK+ AKTGN  A ++LA+QLV++R+Q T      ++  ++   T +      M GA
Subjt:  NIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQFGALYASTSISTG---MKGA

Query:  ----TKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
            TK M A+NK+M P K  + ++ FQK++A++DMT EMM++++DE  +    EEE++++ NQVLDEIG++I+ +++ AP    AARKT +   +
Subjt:  ----TKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

Q941D5 Vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 31.6e-6369.54Show/hide
Query:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST
        +NIF KK +P++ LR SKREMT ATRGIE+EI SLQ EE+KLV EIK+TAK+GNE AT+ILARQL+RLRQQI NLQGSRAQ         A++A TS++ 
Subjt:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST

Query:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        GM+GATKAM AM+K M PAKQAKV++EFQKQSAQ+DMT EMMS+SID+ LD DEAE+ETE+LTNQVLDEIG+DIASQLSSAPKG+I  +K E+  +S
Subjt:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

Q9SKI2 Vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 16.0e-3141.62Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQI-------TNLQGSRAQFGALYASTSI
        M  +IF K+ +P + LR +KR +  + R IERE   LQ +E+KL+ EIK+TAK G   A +++A+ L+R R QI       + LQG   +   L ++ ++
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQI-------TNLQGSRAQFGALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTV
           MKG TKAM  MN+QM      K+++EF++Q+ +++M  E+M ++ID+ L+ DE EEETE+L +QVLDEIG+DI  +L +AP G +A    +N V
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03950.1 vacuolar protein sorting-associated protein 2.31.1e-6469.54Show/hide
Query:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST
        +NIF KK +P++ LR SKREMT ATRGIE+EI SLQ EE+KLV EIK+TAK+GNE AT+ILARQL+RLRQQI NLQGSRAQ         A++A TS++ 
Subjt:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST

Query:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS
        GM+GATKAM AM+K M PAKQAKV++EFQKQSAQ+DMT EMMS+SID+ LD DEAE+ETE+LTNQVLDEIG+DIASQLSSAPKG+I  +K E+  +S
Subjt:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS

AT2G06530.1 SNF7 family protein4.3e-3241.62Show/hide
Query:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQI-------TNLQGSRAQFGALYASTSI
        M  +IF K+ +P + LR +KR +  + R IERE   LQ +E+KL+ EIK+TAK G   A +++A+ L+R R QI       + LQG   +   L ++ ++
Subjt:  MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQI-------TNLQGSRAQFGALYASTSI

Query:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTV
           MKG TKAM  MN+QM      K+++EF++Q+ +++M  E+M ++ID+ L+ DE EEETE+L +QVLDEIG+DI  +L +AP G +A    +N V
Subjt:  STGMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTV

AT5G22950.1 SNF7 family protein1.7e-1228.73Show/hide
Query:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQFG--ALYASTSISTG----
        +NI + K  PK  LR  +R++    R IER+I  +Q EER +   IK+ AK  +  + + LA+++V  R+ +  L  ++AQ    +++   S++      
Subjt:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQFG--ALYASTSISTG----

Query:  -MKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSA
         +  + + M  +N  M   + A  ++EF K+  +  +  E ++E+ID  LD ++ EEE +E  ++VL  I  + A++L  A
Subjt:  -MKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSA

AT5G44560.1 SNF7 family protein9.7e-7785.71Show/hide
Query:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST
        +NIF+KKT+PKDALRTSKREM VATRGIEREI SLQLEE++LVAEIK+TAKTGNEAAT+ILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSIS+
Subjt:  LNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSIST

Query:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAAR
        GMKGATKAMVAMNKQMAP KQAKVIK+FQKQSAQLDMTIEMMSE+IDETLDKDEAEEETE+LTNQVLDEIGV +ASQLSSAPKGRIA +
Subjt:  GMKGATKAMVAMNKQMAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAAR

AT5G44560.2 SNF7 family protein9.1e-6785.8Show/hide
Query:  MTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSISTGMKGATKAMVAMNKQMAPAK
        M VATRGIEREI SLQLEE++LVAEIK+TAKTGNEAAT+ILARQLVRLRQQITNLQGSRAQ         ALYASTSIS+GMKGATKAMVAMNKQMAP K
Subjt:  MTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQF-------GALYASTSISTGMKGATKAMVAMNKQMAPAK

Query:  QAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAAR
        QAKVIK+FQKQSAQLDMTIEMMSE+IDETLDKDEAEEETE+LTNQVLDEIGV +ASQLSSAPKGRIA +
Subjt:  QAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAAR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCTTGAACATCTTCAGGAAGAAAACCTCGCCTAAAGATGCTCTTCGCACCAGCAAGCGAGAAATGACTGTTGCAACTAGAGGCATTGAGCGAGAAATTGCGTCTCT
TCAGTTGGAGGAAAGAAAATTGGTGGCAGAGATAAAGCAAACTGCTAAAACTGGAAATGAGGCTGCCACTAGAATCTTAGCTCGACAGCTTGTTCGCCTGCGCCAACAGA
TAACTAATTTGCAAGGGAGTCGTGCCCAATTCGGGGCACTATATGCCAGCACTTCAATCTCCACTGGAATGAAGGGTGCTACAAAGGCAATGGTTGCAATGAACAAGCAA
ATGGCACCAGCTAAGCAGGCTAAAGTGATTAAGGAGTTTCAGAAGCAGTCAGCACAGTTGGACATGACGATTGAGATGATGTCAGAGTCTATAGATGAAACTTTAGATAA
GGATGAGGCTGAAGAGGAGACTGAGGAGCTTACGAATCAGGTGCTTGATGAGATTGGCGTTGATATTGCATCCCAGTTATCTTCCGCTCCCAAAGGCCGGATTGCAGCAA
GAAAGACTGAAAATACAGTTGCCAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCTTGAACATCTTCAGGAAGAAAACCTCGCCTAAAGATGCTCTTCGCACCAGCAAGCGAGAAATGACTGTTGCAACTAGAGGCATTGAGCGAGAAATTGCGTCTCT
TCAGTTGGAGGAAAGAAAATTGGTGGCAGAGATAAAGCAAACTGCTAAAACTGGAAATGAGGCTGCCACTAGAATCTTAGCTCGACAGCTTGTTCGCCTGCGCCAACAGA
TAACTAATTTGCAAGGGAGTCGTGCCCAATTCGGGGCACTATATGCCAGCACTTCAATCTCCACTGGAATGAAGGGTGCTACAAAGGCAATGGTTGCAATGAACAAGCAA
ATGGCACCAGCTAAGCAGGCTAAAGTGATTAAGGAGTTTCAGAAGCAGTCAGCACAGTTGGACATGACGATTGAGATGATGTCAGAGTCTATAGATGAAACTTTAGATAA
GGATGAGGCTGAAGAGGAGACTGAGGAGCTTACGAATCAGGTGCTTGATGAGATTGGCGTTGATATTGCATCCCAGTTATCTTCCGCTCCCAAAGGCCGGATTGCAGCAA
GAAAGACTGAAAATACAGTTGCCAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLNIFRKKTSPKDALRTSKREMTVATRGIEREIASLQLEERKLVAEIKQTAKTGNEAATRILARQLVRLRQQITNLQGSRAQFGALYASTSISTGMKGATKAMVAMNKQ
MAPAKQAKVIKEFQKQSAQLDMTIEMMSESIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIAARKTENTVAS