; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0025288 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0025288
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionGlycine-rich cell wall structural protein 1.8-like
Genome locationchr05:20490826..20491844
RNA-Seq ExpressionPI0025288
SyntenyPI0025288
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571715.1 hypothetical protein SDJN03_28443, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.4e-7658.98Show/hide
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        +GE++GRGGEAIG ++GRGG+ IGE+FGRGG A+G + GRGGEA G +LGRGGE +GE++GRG  A+G +LGRGGE +G ++GRGGDA+G   GRGG+A+
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        G +LGRGG+ +G+++GRGGEAIG ++GRGG+AIG   GRGG+A+G +LGRGGK +GE++GRGGEA+G ++GR GDA+G  +GRGG A G +LGRGG+ +G
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        E++GRG EAIG ++GRG D V     +    GGEAMG ++GRGG  +GE+ GRGG+AIG +LGRGG+A+G  +GRGGEA+G    G  G G  +G
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KAG7011439.1 hypothetical protein SDJN02_26344, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.9e-7558.16Show/hide
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        +G  +GRGGEAIG ++GRGG K+GE+ GRGG+A+G +LGRGG+AIG  + RGGEA+G ++GRG  +GE++GRGGE +G ++GRGGDA+G   GRGG+AIG
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        ++GRG EAIG ++GRG D V       +  GGEA+G ++GRGG  +GE+ GRGG+AIG +LGRGG+A+G  +GRGGEAMG    G  G G  +G
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TYK13397.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-9470.2Show/hide
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        GRG EAIGEI+GR GE IGEIFGRGG+A+GEILGR GEA+GEILGRGGEA+GE++GRG  A+GEI+GRGG  MGEI+GRGG+A+GEI GRGG+A+GEILG
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        RGGEAMG+ILGRGGEA+GEIIGRGGEAIGEI GRGG+AMGEILGRGGKAMGEILGRGGEA+GEIVGR G  +GEI GRGG A GEI GRGGEA+GEI+GR
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        G +  AIGEIVGR               GG+A+GEI GRGGDAIGEIFGR G +IG +LGRGG   G ++  GG  MG I  G  G+       GR IG 
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Query:  RR
        RR
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XP_016900727.1 PREDICTED: glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucumis melo]3.7e-5364.32Show/hide
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        MGEILGRGGEA GEI+GRGGEA+GEI+GRG  AMGEILGRGGE +GEIVGRGG  IGEIFGRGG+A+GEI GRGGEAMG+ILGRGG+AIGEI+GRGGEAI
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        GEIFGRG       +GRGGKA+GEI GRGG+A+GEI GR G ++G +LGRGG   G I G GG       GRG   IG   GRG           +V+GG
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          MG IV  G   IG I   GG+ IGE
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XP_031742894.1 glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like [Cucumis sativus]1.7e-6961.32Show/hide
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        MGEILGRGGE +GE MGRGG+ IGEIFGRGG+AMGEILGRGGE +GE +GRGG+AIGEI GRG  AMGEILGRGGET+GE +GRGG AIGEIFGRGG+A+
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        GEILGRGGE +G+ +GRGG+AIGEI GRGG A+GEI GRGG+ +GE +GRGGKA+GEI GRGG A+GEIVGR G  +G +LGRGG   GEI+G G   G+
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          G   GRGD   G   GRGV             GG   G+  G GG     + G GG+  G    RGG  +G   GRG G   GE+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHS4 Pollen coat oleosin-glycine rich protein6.8e-10170.92Show/hide
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        MGEILGRGGE +GE MGRGG+ IGEIFGRGG+AMGEILGRGGE +GE +GRGG+AIGEI GRG  AMGEILGRGGET+GE +GRGG AIGEIFGRGG+A+
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        GEILGRGGE +G+ +GRGG+AIGEI GRGG A+GE+ GRGG+ +GE +GRGGKA+GEI GRGG AMGEI+GR G+ +GE +GRGG A GEI GRGG A+G
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        EI+GRG E +GE +GRG   + +++ +    GG AMGEI+GRGG+ +GE  GRGGKAIGEI GRGG AMGEILGRGGE +GE
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A0A1S4DXM4 glycine-rich cell wall structural protein 1-like1.8e-5364.32Show/hide
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        MGEILGRGGEA GEI+GRGGEA+GEI+GRG  AMGEILGRGGE +GEIVGRGG  IGEIFGRGG+A+GEI GRGGEAMG+ILGRGG+AIGEI+GRGGEAI
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        GEIFGRG       +GRGGKA+GEI GRGG+A+GEI GR G ++G +LGRGG   G I G GG       GRG   IG   GRG           +V+GG
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          MG IV  G   IG I   GG+ IGE
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A0A5A7UQF2 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like2.5e-3459.02Show/hide
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        RGG+  GE  GRG K +GE   RGG+ IGE   RGG+ IGE  GR  +GE  GRG E +GEI+GR G+AIGEIFGRGG+A+GEILGR GEAMG+ILGRGG
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        EA+GE+IGRGGEAIGEI GRGG AMGEILGRGG   G ++G G    G ++G  G   G ++G   +    I G  G  I EI
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A0A5D3BMR9 Glycine-rich cell wall structural protein 1-like4.3e-3181.52Show/hide
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        +GEILGRGG+AMG+ILGRGGEAIGEI+GRGG+ IGEIFGRGG+AMGEI GRGG+AMGEILGRGG+A+GEI+GR G+A+GEI GRGG ATGEI
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A0A5D3CNE0 Glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like1.2e-9470.2Show/hide
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        GRG EAIGEI+GR GE IGEIFGRGG+A+GEILGR GEA+GEILGRGGEA+GE++GRG  A+GEI+GRGG  MGEI+GRGG+A+GEI GRGG+A+GEILG
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        RGGEAMG+ILGRGGEA+GEIIGRGGEAIGEI GRGG+AMGEILGRGGKAMGEILGRGGEA+GEIVGR G  +GEI GRGG A GEI GRGGEA+GEI+GR
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        G +  AIGEIVGR               GG+A+GEI GRGGDAIGEIFGR G +IG +LGRGG   G ++  GG  MG I  G  G+       GR IG 
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Query:  RR
        RR
Subjt:  RR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCGAAATATTGGGACGAGGAGGTGAAGCTATTGGTGAAATAATGGGACGAGGCGGTGAAAAAATTGGTGAGATATTTGGACGGGGGGGTAAAGCTATGGGTGAAAT
ATTAGGACGAGGTGGTGAAGCTATAGGCGAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTATCGGTGAAATAGTGGGACGAGGAGCTATGGGCGAAATATTGGGTCGAGGGGGTG
AAACTATGGGTGAAATAGTGGGACGAGGCGGTGATGCTATTGGTGAGATATTTGGACGAGGTGGTAAAGCTATAGGTGAAATATTAGGACGAGGTGGTGAGGCTATGGGC
AAAATATTGGGACGAGGTGGTGAAGCTATTGGTGAAATAATAGGCCGAGGCGGTGAAGCTATTGGTGAGATATTTGGACGTGGAGGTAAAGCTATGGGTGAAATATTAGG
ACGTGGTGGTAAAGCTATGGGCGAAATATTGGGTCGAGGGGGTGAAGCTATGGGTGAAATAGTGGGACGAGACGGTGATGCTATGGGTGAGATATTAGGACGTGGTGGTG
TGGCTACAGGCGAAATATTGGGACGAGGAGGTGAAGCTATCGGTGAAATAGTAGGACGAGGCGATGAAGCTATTGGTGAGATAGTTGGACGGGGGGTGGACGTGGTGGTA
AAGCTATGGGCGAAATATTTGGTCGTGGGGGGTGAAGCTATGGGTGAAATAGTGGGACGAGGCGGTGATGCTATCGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTATAGG
TGAAATATTAGGGCGGGGTGGTGAAGCTATGGGTGAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTATGGGTGAGATTAGGACGGGGTGGTGTGGCTATGGGCGAAATATTGGGA
CGAGGAGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCGAAATATTGGGACGAGGAGGTGAAGCTATTGGTGAAATAATGGGACGAGGCGGTGAAAAAATTGGTGAGATATTTGGACGGGGGGGTAAAGCTATGGGTGAAAT
ATTAGGACGAGGTGGTGAAGCTATAGGCGAAATATTGGGACGAGGGGGTGAAGCTATCGGTGAAATAGTGGGACGAGGAGCTATGGGCGAAATATTGGGTCGAGGGGGTG
AAACTATGGGTGAAATAGTGGGACGAGGCGGTGATGCTATTGGTGAGATATTTGGACGAGGTGGTAAAGCTATAGGTGAAATATTAGGACGAGGTGGTGAGGCTATGGGC
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ACGTGGTGGTAAAGCTATGGGCGAAATATTGGGTCGAGGGGGTGAAGCTATGGGTGAAATAGTGGGACGAGACGGTGATGCTATGGGTGAGATATTAGGACGTGGTGGTG
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AAGCTATGGGCGAAATATTTGGTCGTGGGGGGTGAAGCTATGGGTGAAATAGTGGGACGAGGCGGTGATGCTATCGGTGAGATATTTGGACGGGGTGGTAAAGCTATAGG
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CGAGGAGGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGEILGRGGEAIGEIMGRGGEKIGEIFGRGGKAMGEILGRGGEAIGEILGRGGEAIGEIVGRGAMGEILGRGGETMGEIVGRGGDAIGEIFGRGGKAIGEILGRGGEAMG
KILGRGGEAIGEIIGRGGEAIGEIFGRGGKAMGEILGRGGKAMGEILGRGGEAMGEIVGRDGDAMGEILGRGGVATGEILGRGGEAIGEIVGRGDEAIGEIVGRGVDVVV
KLWAKYLVVGGEAMGEIVGRGGDAIGEIFGRGGKAIGEILGRGGEAMGEILGRGGEAMGEIRTGWCGYGRNIGTRR