; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0025485 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0025485
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr08:21927885..21930317
RNA-Seq ExpressionPI0025485
SyntenyPI0025485
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038906326.1 uncharacterized protein LOC120092168 [Benincasa hispida]2.6e-6895.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAB4 Uncharacterized protein1.7e-6895.86Show/hide
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A0A1S3B6W3 uncharacterized protein LOC1034864423.1e-6794.48Show/hide
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A0A6J1CVE7 uncharacterized protein LOC1110149319.4e-6488.67Show/hide
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A0A6J1F162 uncharacterized protein LOC111441439 isoform X12.6e-6186.9Show/hide
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A0A6J1J3V4 uncharacterized protein LOC1114824281.8e-6288.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53470.1 unknown protein1.4e-3567.54Show/hide
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        SSS    CS   P  PRK ++++    DK STDWDKAW  FKK+ +K++FS F+ DKYV+WNP RSE+ LSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAIV
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AT3G53470.2 unknown protein1.6e-3467.83Show/hide
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        SSS    CS   P  PRK ++ N     DK STDWDKAW  FKK+ +K++FS F+ DKYV+WNP RSE+ LSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTAGTCGGAACCATAATCGCACCTCGTAGCTTTTTCTCAAGAAACAAACAGAAATCATCTTCGTCCTCATCGTCATCGTCTTCTTCTTCATCGGTGATTCCTCTGTG
TTCGGGGAGAAGGCCTAAAGATCCTCGAAAAGATGACGATAATGACGATCAGACACGTGATAAGCTCTCAACAGATTGGGACAAAGCATGGTCCAAGTTCAAAAAGCGAG
GAAGAAAGACGATGTTCTCCGATTTCTCTCCCGACAAATATGTAAGTTGGAATCCGCGAAGGTCAGAATATCCATTGTCTGAAGAAGTAGATCCCATAAAAAGAACAGAG
AGATCAAACCTGATGCTGTGGACTAGTCCAAGATTTACTCTAGCAGGTGCAATTGTAATTGTCACATTCTTGTTGGTCTACACCATTCTTGCACCAATTAATAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAACTAAAGGTGCTGGACGGCTCGGTCCAGTTCACGACGACGCTAAAAAAAGCCCAAATTAGTCGACGTGGGATATAACGGGCCCACAAAAGACGATGATTCGGATGA
CGTGGCAGATTCTGAGGCCTGCAAAGTTCGCCGGATACGAATATCAGAAGGTACGAACTGAGGGGTGGCCAGTGAAGTGAATCAGTGGATGCAGACCAGGCAACGAATTC
TTGGTTTCAATCTGGAATTGGAATCTTTGCCGCGATGCTAGTCGGAACCATAATCGCACCTCGTAGCTTTTTCTCAAGAAACAAACAGAAATCATCTTCGTCCTCATCGT
CATCGTCTTCTTCTTCATCGGTGATTCCTCTGTGTTCGGGGAGAAGGCCTAAAGATCCTCGAAAAGATGACGATAATGACGATCAGACACGTGATAAGCTCTCAACAGAT
TGGGACAAAGCATGGTCCAAGTTCAAAAAGCGAGGAAGAAAGACGATGTTCTCCGATTTCTCTCCCGACAAATATGTAAGTTGGAATCCGCGAAGGTCAGAATATCCATT
GTCTGAAGAAGTAGATCCCATAAAAAGAACAGAGAGATCAAACCTGATGCTGTGGACTAGTCCAAGATTTACTCTAGCAGGTGCAATTGTAATTGTCACATTCTTGTTGG
TCTACACCATTCTTGCACCAATTAATAAGTGATTTTTGTTGCTGTGTTGAACTTTCTTCTTATATTCTTCTTCTTCTAATGATGTTAATGATTGTAGAAAGGTCTGTAAA
TTTGTATGGAAATTCAATGGAATCTGTGCTTTCTGTTTTGCTTGCTTTCTATGGGAAGATGCCTTACCTTGCACTAGCTAATGCATGTTATGATTTGCTTTCTAGTCTTC
ATAAATTAAAGTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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