; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0026136 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0026136
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionTF-B3 domain-containing protein
Genome locationchr04:5344350..5347037
RNA-Seq ExpressionPI0026136
SyntenyPI0026136
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
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GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003340 - B3 DNA binding domain
IPR015300 - DNA-binding pseudobarrel domain superfamily
IPR044800 - B3 domain-containing transcription factor LEC2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038905859.1 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.3e-14890.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBH2 TF-B3 domain-containing protein4.2e-15192.62Show/hide
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A0A1S3B6T3 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X11.0e-15795.27Show/hide
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A0A1S3B7G9 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X22.5e-14895.02Show/hide
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A0A6J1IY80 B3 domain-containing protein At2g36080-like9.1e-12280.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53QI0 B3 domain-containing protein Os11g01560003.0e-4550.62Show/hide
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Q7F9W2 B3 domain-containing protein Os04g05814001.6e-3860.27Show/hide
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Q8GYJ2 B3 domain-containing protein At2g360801.7e-5648.48Show/hide
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Q8RYD3 B3 domain-containing protein At3g115801.1e-4745.7Show/hide
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          +      Y +  D  HA+S      V  G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP P P   N             +H +Y  YS+P P ++ F
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Q9FNI3 B3 domain-containing protein At5g062503.0e-5347.77Show/hide
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        DESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S   S+VA  +  V     G   + ++  ++N  + P
Subjt:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPAESAVATASGGVG----GGGGWTRMFCSAN--SYP

Query:  SHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHM
        SH  + H  +    ++       SSV      VG+S+ +RLFGV+LECQ  M E +   S+ V +++ S      ++ +Y +YS   PH+M
Subjt:  SHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36080.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.2e-5748.48Show/hide
Query:  MSINHFSPDFHQPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGK
        MSIN +S DFH       Q       +   +    +   +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL         AAAA D+ +KGLLL FEDE GK
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Query:  IWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPAESAVATASGGVGGGGGWTRMFCSANSYPSHHHHHHLPSP
         WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR                            S++S  S+ H     S 
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         Y      PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+  ++  D  +  FYP   HY  P P++MD +F+ D+N+T
Subjt:  PYQSSSDSPHA-ESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYP---HYSSPLPHHMDFTFSQDVNQT

AT2G36080.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.3e-4860.37Show/hide
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        MSIN +S DFH       Q       +   +    +   +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL         AAAA D+ +KGLLL FEDE GK
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Query:  IWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPAESA
         WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR   S +  +
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AT3G11580.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein7.7e-4945.7Show/hide
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        MS+NH    +H  L         L+      VA A    +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+ +     +      + +KG+LLSFEDESGK
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Query:  IWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR--SAPSPAESAVATASGGVGGGGGWT------RMFCSANSYPSHH
         W+FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VK+K LDAGDVV F+RHR D  RLFIGW+RR  ++ SPA S V +    V     W+      R   ++ +YP+ H
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Query:  HHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEP-PSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDF
          +      Y +  D  HA+S      V  G+S+ +RLFGV+LEC  D  EP P P   N             +H +Y  YS+P P ++ F
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AT5G06250.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein4.0e-5348.07Show/hide
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        MS+NH+S D H  L    Q        S  +  A    D L   +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL  +A + ++AAA   S++KG+LLSFE
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Query:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPAESAVATASGGVGGGGGWTRMFCSANSYPSHHHHH
        DESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S   S+VA  +  V           S+    S+H  H
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Query:  HLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHM
           +    ++       SSV      VG+S+ +RLFGV+LECQ  M E +   S+ V +++ S      ++ +Y +YS   PH+M
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AT5G06250.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein2.1e-5447.77Show/hide
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Query:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPAESAVATASGGVG----GGGGWTRMFCSAN--SYP
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Subjt:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPAESAVATASGGVG----GGGGWTRMFCSAN--SYP

Query:  SHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHM
        SH  + H  +    ++       SSV      VG+S+ +RLFGV+LECQ  M E +   S+ V +++ S      ++ +Y +YS   PH+M
Subjt:  SHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCTCCCCATGTTCGAAAAACCCTTAACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCCGAAAAATACTTTCCCCTCTCTCCCTCCGCCG
CGGTCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCCGATAAGGGGTTGCTCCTCAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGTTACTCTTATTGGAAT
AGTAGTCAGAGCTATGTGCTGACGAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAACGGCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGCCGTGACGGTGATAG
GTTGTTCATTGGGTGGAAAAGGAGGTCGGCGCCGTCTCCGGCGGAAAGTGCGGTGGCGACGGCGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGACTAGAATGTTCTGTT
CTGCAAATTCATATCCTTCTCATCATCATCATCATCATCTTCCTTCACCGCCATACCAATCTTCTTCTGATTCTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTG
TCGGTTGGGAATTCAAAGATACTGCGGCTGTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCTGAACCACCGTCGTCGCTCAATGTTGGGTCAAGTTTAAG
TTCATCGGGTCGAGATCCAACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACCAGACGAAATATC
AAGGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCATAAACCACTTCTCTCCTGACTTCCATCAACCTCTTTTCTCTACTCCCCAACTCCCCATCATGCTCAACCCCAAATCCTCCCTCTCCGTCGCCGCCGCCGACCA
CCTCCCCATGTTCGAAAAACCCTTAACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCCGAAAAATACTTTCCCCTCTCTCCCTCCGCCG
CGGTCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCCGATAAGGGGTTGCTCCTCAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGTTACTCTTATTGGAAT
AGTAGTCAGAGCTATGTGCTGACGAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAACGGCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGCCGTGACGGTGATAG
GTTGTTCATTGGGTGGAAAAGGAGGTCGGCGCCGTCTCCGGCGGAAAGTGCGGTGGCGACGGCGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGACTAGAATGTTCTGTT
CTGCAAATTCATATCCTTCTCATCATCATCATCATCATCTTCCTTCACCGCCATACCAATCTTCTTCTGATTCTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTG
TCGGTTGGGAATTCAAAGATACTGCGGCTGTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCTGAACCACCGTCGTCGCTCAATGTTGGGTCAAGTTTAAG
TTCATCGGGTCGAGATCCAACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACCAGACGAAATATC
AAGGATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSINHFSPDFHQPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWN
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SVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSSLNVGSSLSSSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDFTFSQDVNQTKYQG