; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0026150 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0026150
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSignal peptidase complex subunit
Genome locationchr10:15051734..15054961
RNA-Seq ExpressionPI0026150
SyntenyPI0026150
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0045047 - protein targeting to ER (biological process)
GO:0005787 - signal peptidase complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009582 - Signal peptidase complex subunit Spc2/SPCS2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037360.1 putative signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-6296.85Show/hide
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XP_038891545.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Benincasa hispida]2.9e-5097.17Show/hide
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A0A0A0KSD0 Uncharacterized protein4.5e-5799.15Show/hide
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A0A1S3CIQ9 probable signal peptidase complex subunit 24.8e-5199.06Show/hide
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A0A5A7T1V9 Putative signal peptidase complex subunit 22.7e-6296.85Show/hide
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A0A6J1FVT7 probable signal peptidase complex subunit 21.0e-4893.4Show/hide
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A0A6J1K981 probable signal peptidase complex subunit 27.7e-4993.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P58684 Probable signal peptidase complex subunit 23.0e-4281.31Show/hide
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Q5BJI9 Probable signal peptidase complex subunit 21.8e-0739.05Show/hide
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        Y +  GIL      KEKN  L      PAG        +SS L RF D YTL +S +D K+  + E  +FTKSV+ +F ++G LV   + K V  L D  
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Q5M8Y1 Probable signal peptidase complex subunit 29.2e-0737.14Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39960.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)2.1e-4381.31Show/hide
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         EPKK K
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AT4G04200.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)2.0e-4172.17Show/hide
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        L+ EY  A EPKK +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTTGGTTTCGTTTAGTGGAATGCAAATCGTTGGATGGTGTCTCTTATGTGATCTTTAACTCTGGCAAGTATGTAGTTTTTAATGGGATCTTGCAGTTTATTGTTTA
CACCAAGGAGAAGAACGCAATTTTGTTCACGTATCCTCCTGCAGGATCCTTCACCAGCACTGGGCTGATAGTTTCTTCAAAACTGCCCAGATTCTCAGATCTGTATACAC
TGACCATATCTAGTTCGGATCCCAAATCAATTTCTGCTAATGAACCAGTTCAATTTACCAAGAGCGTCACTCGCTGGTTTACTAAAGATGGGGTTTTAGTTGAGGGACTT
TTCTGGAAAGATGTTGAAGCGTTGATCGATGAGTATGCTAGAGAACCAAAAAAGAGCAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAGGTCGAAGAAGACTGAGTCTCCTCTTTCTCAGATTTCAGACAAACCTTCGTATAGACGGCGAAGAGAACTGAAACTGAAAAAGATTTCAAAATATGGCGACCAAAA
CTGCTAAAAAGGCCAATCTCTTGGATCATCACTCTCTCAAACACCTACTCGATGAATCTGTTTCTGAGATTGTCACCAGTCGCGGCTATGTTGAAGACGTTAGGTTGAGT
AATGTCAAATTGATTATGGGCACTCTCATCATCATTATAGCTTTGGTGGCTCAATTTTACAAAAAGAAATTCCCTGAGAATCGTGATTTCTTAATCGGTTGCATTATATT
ATATCCTTCTTTATGAATTGCGTGTTTTATTTTTTTATCGTTTAGATCTTTTGTTGATAGATTGAATTTCATTTCTTGATTCTGGTGTCCGATGGGAATGGGTATTGGAT
TAAATGCTGGATATTCTCGAATGGAGAAATGTGTTTTACCCTGCGCCATTTTTTTAGTTTTTTATGGTTTGGTTTCGTTTAGTGGAATGCAAATCGTTGGATGGTGTCTC
TTATGTGATCTTTAACTCTGGCAAGTATGTAGTTTTTAATGGGATCTTGCAGTTTATTGTTTACACCAAGGAGAAGAACGCAATTTTGTTCACGTATCCTCCTGCAGGAT
CCTTCACCAGCACTGGGCTGATAGTTTCTTCAAAACTGCCCAGATTCTCAGATCTGTATACACTGACCATATCTAGTTCGGATCCCAAATCAATTTCTGCTAATGAACCA
GTTCAATTTACCAAGAGCGTCACTCGCTGGTTTACTAAAGATGGGGTTTTAGTTGAGGGACTTTTCTGGAAAGATGTTGAAGCGTTGATCGATGAGTATGCTAGAGAACC
AAAAAAGAGCAAGTGATTTCCTATACAAGCCTTCTTTAATGGGGGGATCTAACTTTCAAGTAAAGTAACTGTTTCCAATTTTTCTTGCTTCTTTTTTATTGCTAGCAAAC
TGAACTATCTTTTTCCTTGATTAATAGACTTTAGAAGCAAAACAGGATGAGCCTAAATTTTTAATATCGTTTTTGGTAATAGGAATATACTATCTCTTAAAGTCTCTTAG
CTCACACGAAAACCACAAACGACATAGCTTTTTTCCTTTTAAACCTTAGTTGAATGTTCGTTCCTATAGCATAATGTTTGATTGAAGATGTTTCTTTTGCATCATCAACC
CTTGGTAGAGATGGATTTGCTATGAGCTAGTTGAACTTTTATTGAGAGTTTATTTGAAATGACTTCCTAGATGTAAAAAGAAGTGTGTTTTTGAGCATTGGAAAAGTCGT
TCCAACTTGCTCTAATGCTTCTTAAAATTGTAGTTGTAAATATAACGATCATACACAAAGTATTAGTAAATGAAACATTTACAAATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVWFRLVECKSLDGVSYVIFNSGKYVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTYPPAGSFTSTGLIVSSKLPRFSDLYTLTISSSDPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGL
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