CuGenDBv2

Gene ID	PI0026505
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	protein FAM133 isoform X2
Genome location	chr09:21897725..21903898
RNA-Seq Expression	PI0026505
Synteny	PI0026505
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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e value

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XP_023542895.1 protein FAM133-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038889695.1 protein FAM133-like isoform X2 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0KWA3 Uncharacterized protein

1.5e-52

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A0A1S3CAA6 protein FAM133 isoform X2

5.9e-49

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A0A1S3CBZ8 protein FAM133 isoform X1

1.1e-47

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A0A6J1DCJ7 protein FAM133B-like

3.6e-46

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        NRSS KTGHEK
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A0A6J1G233 protein FAM133-like isoform X1

3.8e-48

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT2G43795.1 unknown protein

2.1e-22

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AT2G43795.2 unknown protein

2.1e-22

71.62

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AT3G59800.1 unknown protein

1.9e-36

71.17

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        N SS K+  +K
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Sequences

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CDS sequence

Show/hide CDS sequence

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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AGTTTTAGATAATCTTTTGGGGAATGAGAACAAACTTTGCTCCTTGGGCAAAGAGATTGTTCTTTCTCCCTCTGTGCAACATAAAGGACAATCTTCAGCTTATGGTGATG
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ATTGTCATTCTTCAAGAAATAAGTGTGTGGGATTGCAAAATTGTCAAAGCTATTTTGAGCTCCTGCTTCGTGGTATTGCCTTCTGTGGCTAATGAGCAATGTAACCCATT
AAAAGTTTGTGAAGAAATACTTATCAAACCCCCTAGTTGCTTGCCAGTGGCTTCAAAAGCTGATCTCTTCCGCAAAGGAAGATTTCTTGCCTGGACGTATTTCGAAATGG
GTAAGAATCAAGCGTACAAAGCGATGCAGAAAGCCAGGCTGGGATCCTCAAGCTCGACTGGACCAGCTGAGATTGAAGATGGAATGGTGGATGGTTCATTTCATTCACCA
GCATGGCATGCTGCTCGTTTGGCCAGCCTTAATACTTCTCACACGATTACCTGGGAGGAGTATAAAAGGAAGCAAAAGGGAGAGCTGGAAGCAGATACGGATAGAATGAT
GAAAGAATATAGAGCACAATTGGATGCTGAGCGTGCACGAAAACTTGCTCATGGAAGAAATCGTTCTAGTAGCAAGACTGGTCATGAAAAGGGTACGTTTTGATCCATTT
TGATATTAATTAGATAAATGAGATCTTCTAAAGCGGTCAGCATTACAGATAGGAAGAACAGAGAATTAAAGAAGCGGAGCAAAAAAAAGAGAAAGCATTCCAAGAGGAAA
TTGTCCGAGTCTAGCTCCTCAAGTTCATCGTCTGATTCATCCAGCAGTGACGAAGAAGAAAGAGAATCTAGAAGATCCAAGTCCAAATCAAAGAGATCTAAGAGGGAGAA
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GTTCTGTAACCGTGTAACGTTTATAGAATTTCCAGTCTTGAAATAGCATATTTGATCCTGTTCATTTTCTTTTGAGTTTGCACTTACACAATTCAATTATCAGTTTTCTA
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AGCAAGAGTCAATTATGCTCCATTTTCATTAGGACGATGCTTGTGAGGGAAAAGAAACTAGAATCCTGCAAGTATAATAGAGTATAAAGTGATATTATAGTCCTGAGTTA
AAAAGGCTGTGCTTACATCACTGGAATGAAAAATGGGAAAACGTAATGGAAAAATGTAATCGATTTTTATGGATGAATCAAATGTAATGGACCTCAATTGTAAGGTTAGA
TTGTTTTTTAACATGTTTATTTGACCAGTTTTTTAACA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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IVILQEISVWDCKIVKAILSSCFVVLPSVANEQCNPLKVCEEILIKPPSCLPVASKADLFRKGRFLAWTYFEMGKNQAYKAMQKARLGSSSSTGPAEIEDGMVDGSFHSP
AWHAARLASLNTSHTITWEEYKRKQKGELEADTDRMMKEYRAQLDAERARKLAHGRNRSSSKTGHEKGTF

PI0026505 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome