; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0026787 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0026787
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationchr03:25495489..25497886
RNA-Seq ExpressionPI0026787
SyntenyPI0026787
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056568.1 zinc finger protein 511 [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-13090.3Show/hide
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KAG6602683.1 Zinc finger protein 511, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.6e-12792.37Show/hide
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XP_008441334.1 PREDICTED: zinc finger protein 511 [Cucumis melo]1.1e-13397.19Show/hide
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XP_038885473.1 zinc finger protein 511 [Benincasa hispida]1.6e-12691.97Show/hide
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        ISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRGLTFVPRAVQ+EK S SS AGT R
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein5.6e-13397.19Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5115.1e-13497.19Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5111.5e-13090.3Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5111.1e-12591.57Show/hide
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A0A6J1JHI5 zinc finger protein 5115.7e-12590.76Show/hide
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        I GVSKLSTS STPSS+SFGRRHTRGLTFVPRAVQR+K SDSSTAG+ +
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5111.1e-2135.03Show/hide
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        +H+ E HDS FQ  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R  H+V  H + A F F K
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5112.9e-2532.63Show/hide
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        E ++  P+ ++P + RF  +  +F  G++ R +  + +     +D++           SE  C I GC     +L+ +E HYN+ H   CS C R FP++
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        RLL +H+ E HDS FQ  +A    MYECLVEGCGLKFK+ K R  HL+  H + A F F K     +   +K  +K+        + ++ E +E MD   
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Query:  --------GLISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRG
                 + +   K   S   PSSI FG+   RG
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Q8NB15 Zinc finger protein 5111.9e-2133.49Show/hide
Query:  RFDPDSPFFASGNVEREILAKQVALDLTE-DEKLQLHNMAVDASSEIFCPIVGCGAHLKSLDDFEDHYNSRHTASCSVCPRVFPTSRLLSLHVSEAHDSF
        RF  +  FF  G+V+R +  + V + + +  EK ++   A        C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R FP+  LL  H+ E HDS 
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Query:  FQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKIYRKQALQG-REETSKMEVENE-IMDGLISGVSKLSTSDSTP
        FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R  H+V  H + A F F K   P K +           G R E   ME+ +E +         +       P
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Query:  SSISFGRRHTRG
        S+I FG+   RG
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Q9V574 Protein lethal(2)k102011.4e-1129.63Show/hide
Query:  DHYNSRHTASCSVCPRVFPTSRLLSLHVSEAHDSFFQAKVARG-YDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKIYRKQA
        D+ +   + SC  C ++ PT+ LL LH++E HD +F A V RG   M+ C +E C +KF + + R  H +  HK  A++ F            K   KQ 
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Query:  LQGREETSKMEVENEIMD-GLISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRGLTFVPRAVQREKASD
         QG+ + + MEV+  I +   +  V   S    T  S   G+    G T       +E  +D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding1.8e-9165.49Show/hide
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        M V++  E  FPYW P +RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH      +  I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RHTASCSVC RV
Subjt:  MEVESQSE--FPYWKPFQRRFDPDSPFFASGNVEREILAKQVALDLTEDEKLQLHNMAVDASSEIFCPIVGCGAHLKSLDDFEDHYNSRHTASCSVCPRV

Query:  FPTSRLLSLHVSEAHDSFFQAKVARGYDMYECLVEGCGLKFKSYKSRHQHLVDKHKFSASFEFFKKAHPSKKQRQKIYRKQALQGREETSK-------ME
        +PTSRLLS+H+SEAHDSFFQAKV+RGYDMYECLVEGCGLKFK+YK+RH+HL+DKHKF  +FEFFKK   SKK+R+K+ R+   + + E  K       ME
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Query:  VENE-IMDGLISGVSKLSTSDSTPSSISFGRRHTRGLTFVPRAVQREKASDSSTA
        VE++  +DGL+S +S L+TSD+TPS++SFGRRH RGLTFVPR+V REK ++SS+A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTGAATCACAATCAGAATTCCCGTACTGGAAGCCTTTCCAACGGAGGTTCGATCCTGATTCTCCCTTTTTTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGC
CAAACAGGTGGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTAGCAGTGAAATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACT
TGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTGTGCCCTAGAGTTTTCCCGACATCACGCCTACTTAGTTTACATGTCTCT
GAGGCGCACGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTTGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTATAAAAGCAGACACCA
GCATCTAGTGGACAAACATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAGAAACAAAGACAGAAAATATATCGTAAACAAGCTCTTCAAGGAA
GGGAAGAAACCTCCAAAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACTTCGGACTCAACTCCTTCGTCAATCAGCTTTGGC
CGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGAGAAAAAGCGTCAGACTCCTCAACAGCTGGAACAAAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTCCTCCATCTGCAACGGTCCATTGCCCTTCCATGGAAGTTGAATCACAATCAGAATTCCCGTACTGGAAGCCTTTCCAACGGAGGTTCGATCCTGATTCTCCCTTTT
TTGCCTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGCCAAACAGGTGGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTAGCAGTGAA
ATCTTTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACTTGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATACTGCCTCTTGTTCAGTGTGCCCTAGAGTTTT
CCCGACATCACGCCTACTTAGTTTACATGTCTCTGAGGCGCACGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTTGCGCGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTG
GTTTGAAGTTCAAAAGCTATAAAAGCAGACACCAGCATCTAGTGGACAAACATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCTCATCCATCTAAGAAACAAAGA
CAGAAAATATATCGTAAACAAGCTCTTCAAGGAAGGGAAGAAACCTCCAAAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTAC
TTCGGACTCAACTCCTTCGTCAATCAGCTTTGGCCGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGAGAAAAAGCGTCAGACTCCTCAACAGCTG
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TGGAGATTTGAGGATTGGGAAGATATTTACTTAGCTTATCAATTCCATATACCAAGAAATAGAACTTCACTAAGTTGGAAAAGTTTCCATTGAGGGAACCTTGATTAGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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