; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0026927 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0026927
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein ATHB-40
Genome locationchr07:4262273..4265047
RNA-Seq ExpressionPI0026927
SyntenyPI0026927
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031239.1 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.6e-8883.11Show/hide
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XP_038877287.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Benincasa hispida]3.3e-9991.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWL3 Homeobox domain-containing protein6.3e-10493.61Show/hide
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A0A1S3BY52 homeobox-leucine zipper protein ATHB-401.4e-11197.24Show/hide
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A0A6J1C5L6 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.1e-8180.97Show/hide
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A0A6J1FTB2 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like9.1e-8782.19Show/hide
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A0A6J1J034 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.0e-8581.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YN17 Homeobox-leucine zipper protein HOX141.3e-2642.49Show/hide
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O23208 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-401.7e-4554.29Show/hide
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Q7XI85 Homeobox-leucine zipper protein HOX142.1e-2740.72Show/hide
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        P S G    L ++D+  Y+PE
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Q9LVR0 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-532.3e-3450Show/hide
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Query:  ESVVVEKCRLETEILKLKEQLLEVEKEKERVIMGERADGPLSSSSPSPSMSMEAMEMDPISLGEISPLYEEDVFYYMPENYCIYGME-WPNPYI
        ++VV+ +C+LE++ILKL EQL E + E  +  + ER +  + ++S S S+S+EA    P    E++P    ++ +YM +N  +  ME W   Y+
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Q9ZU70 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-212.0e-4348.02Show/hide
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        PRQVAVWFQNRRARWKNK++E+EY+ LK  +E+ VVEKCRL++E++ LKEQL E E+E +R  + +R +G LS+S  S S+++EA    P   G+    +
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        +   ++   Y P+   I G++W + ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G69780.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.8e-1841.86Show/hide
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        S+  +  G KKR+L   QV  LE NF   +KLE ERK +LA  LGL PRQ+A+WFQNRRARWK K+LE++Y  LK+  +++  E   L+T   KL+ ++ 
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Query:  -LEVEKEKERVIMGERADGPLSSSSPSPS
         L+  ++ E + + +  +G  S+ S + S
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AT2G18550.1 homeobox protein 211.5e-4448.02Show/hide
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        +   ++   Y P+   I G++W + ++
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AT3G01470.1 homeobox 11.9e-2042.65Show/hide
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        KKR+LT  QVHLLE +F +E+KLE ERK +LA +LGL PRQVAVWFQNRRARWK K+LE +Y  LK         ++S+V++  +L +E+  L E+L   
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                      G   +++  P    E  ++DP+
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AT4G36740.1 homeobox protein 401.2e-4654.29Show/hide
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        K+LEEEY+ LK  H++VVV+KCRLE+E+++LKEQL + E+E +R  + ER +G  S+S  S S+S+EA E        +G+    Y+  +FY +PEN  I
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