; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0027708 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0027708
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like
Genome locationchr04:30738164..30742865
RNA-Seq ExpressionPI0027708
SyntenyPI0027708
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0016607 - nuclear speck (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136307.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22 [Cucumis sativus]7.7e-7797.45Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRS+SPRGRSFSRSPPYRGREE+PYANGNGIKDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

XP_008466294.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor RSZ22A [Cucumis melo]5.1e-7394.9Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLR      GGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

XP_022133130.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like [Momordica charantia]1.4e-7394.9Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLR    GGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRS+SRSPPYRGREELPYANGNG+KDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

XP_022940964.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like [Cucurbita moschata]2.2e-7192.99Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGG  GGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECR R   GGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRS+SRSPPYRGREE+PYANGNG+KDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

XP_023524392.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-7293.63Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGG  GGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECR R  GGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRS+SRSPPYRGREE+PYANGNG+KDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEI3 Uncharacterized protein3.7e-7797.45Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRS+SPRGRSFSRSPPYRGREE+PYANGNGIKDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

A0A1S3CQW5 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22A2.5e-7394.9Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLR      GGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

A0A6J1BUF4 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like6.5e-7494.9Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLR    GGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRS+SRSPPYRGREELPYANGNG+KDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

A0A6J1FS77 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like1.0e-7192.99Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGG  GGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECR R   GGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRS+SRSPPYRGREE+PYANGNG+KDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

A0A6J1J0W6 serine/arginine-rich splicing factor RSZ22-like1.2e-7091.72Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGG  GGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECR R     GGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRS+SRSPPYRGREE+PYANGNG+KDRRRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81126 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ221.2e-5170.45Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHN--SRGGGG-----GRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRR
        + PGYAF+DF+DPRDARDAI  LDGKNGWRVE SHN   RGGGG     G GGGGRG  GGSDLKCYECGE GHFARECR R           GG GRRR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHN--SRGGGG-----GRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRR

Query:  SRS-----PRYRRSPSYGRRSYSPRGRS---PRRRSLSP---RGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        S+S     PRYRRSPSYGRRSYSPR RS   PRRRS SP   RGRS+SRS PPYR REE+PYANGNG+K+RRRSRS
Subjt:  SRS-----PRYRRSPSYGRRSYSPRGRS---PRRRSLSP---RGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

Q69KL9 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21A2.4e-4168.12Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        K PG+AFIDFDD RDA+DAI ++DGKNGWRVELS N+       G GGR R G S+ KCYECGE GHFARECRLR G GG G G      R RSRSPRYR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSP-RGRSFSRSPPY-RGREELP-YANGNGIKDRRRSRS
        RSPSYGRRSYSP GRSPRRRS+SP R RS+SRSP Y RGR+E P Y NG      RRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSP-RGRSFSRSPPY-RGREELP-YANGNGIKDRRRSRS

Q6K4N0 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ218.3e-4267.09Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        K PG+AFIDFDD RDA DA+ +LDGKNGWRVELS NS         GGR R GGS++KCYECGE GHFARECRLR G GG G G      R RSRSP+YR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSP-RGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        +SP+YGRRSYSPR RSPRRRS+SP RGRS+SRSP  RGR   PYA+G      RRSRS
Subjt:  RSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLSP-RGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

Q6K9C3 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ232.6e-3560.47Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGG---------AGR
        K PG+AFIDFDD RDA DAI +LDGKNGWRVELS  +   G GR   GR RSGGSD+KCYECGEPGHFARECRLR G GG G G              GR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGG---------AGR

Query:  RRSRSPRYRRSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLS-----PRGRSFSRSPP-------------YRGREELPYAN
         RSRSPRYRRSPSYGR   SPR RSP+RRS S      R RS+SRSPP                REE PYAN
Subjt:  RRSRSPRYRRSPSYGRRSYSPRGRSPRRRSLS-----PRGRSFSRSPP-------------YRGREELPYAN

Q9SJA6 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ22A1.7e-5071.1Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGG------GGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRS
        + PGYAF+DF+D RDARDAI E+DGKNGWRVE SHN RGGGGGRGG      GGRGR GGSDLKCYECGE GHFARECR RGG G          GRRRS
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGG------GGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRS

Query:  RS-----PRYRRSPSY-GRRSYSPRGRS---PRRRSLSPRGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RS     PRYR+SP+Y GRRSYSPR RS   PRRRS SPRGR++SRS PPYR R+E+PYANGNG+KD RRSRS
Subjt:  RS-----PRYRRSPSY-GRRSYSPRGRS---PRRRSLSPRGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23860.1 RS-containing zinc finger protein 214.5e-3558.79Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAF++FDD RDA DAI  LD KNGWRVELSH  +   GGRGGGG  R G  D KCYECGE GHFARECR            G G+ RRRS SPR R
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYG--RRSYSPRGR--SPRRRSLSP--RGRSFSRSPPYRGR-------------EELPYANG
        RSP YG  RRS SPRGR   PRRRS++P  RGRS+SRSPPYRG                 PYANG
Subjt:  RSPSYG--RRSYSPRGR--SPRRRSLSP--RGRSFSRSPPYRGR-------------EELPYANG

AT1G23860.2 RS-containing zinc finger protein 214.5e-3558.79Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR
        + PGYAF++FDD RDA DAI  LD KNGWRVELSH  +   GGRGGGG  R G  D KCYECGE GHFARECR            G G+ RRRS SPR R
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYR

Query:  RSPSYG--RRSYSPRGR--SPRRRSLSP--RGRSFSRSPPYRGR-------------EELPYANG
        RSP YG  RRS SPRGR   PRRRS++P  RGRS+SRSPPYRG                 PYANG
Subjt:  RSPSYG--RRSYSPRGR--SPRRRSLSP--RGRSFSRSPPYRGR-------------EELPYANG

AT2G24590.1 RNA recognition motif and CCHC-type zinc finger domains containing protein1.2e-5171.1Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGG------GGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRS
        + PGYAF+DF+D RDARDAI E+DGKNGWRVE SHN RGGGGGRGG      GGRGR GGSDLKCYECGE GHFARECR RGG G          GRRRS
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGG------GGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRS

Query:  RS-----PRYRRSPSY-GRRSYSPRGRS---PRRRSLSPRGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        RS     PRYR+SP+Y GRRSYSPR RS   PRRRS SPRGR++SRS PPYR R+E+PYANGNG+KD RRSRS
Subjt:  RS-----PRYRRSPSY-GRRSYSPRGRS---PRRRSLSPRGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

AT4G31580.1 serine/arginine-rich 228.2e-5370.45Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHN--SRGGGG-----GRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRR
        + PGYAF+DF+DPRDARDAI  LDGKNGWRVE SHN   RGGGG     G GGGGRG  GGSDLKCYECGE GHFARECR R           GG GRRR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHN--SRGGGG-----GRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRR

Query:  SRS-----PRYRRSPSYGRRSYSPRGRS---PRRRSLSP---RGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        S+S     PRYRRSPSYGRRSYSPR RS   PRRRS SP   RGRS+SRS PPYR REE+PYANGNG+K+RRRSRS
Subjt:  SRS-----PRYRRSPSYGRRSYSPRGRS---PRRRSLSP---RGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS

AT4G31580.2 serine/arginine-rich 228.2e-5370.45Show/hide
Query:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHN--SRGGGG-----GRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRR
        + PGYAF+DF+DPRDARDAI  LDGKNGWRVE SHN   RGGGG     G GGGGRG  GGSDLKCYECGE GHFARECR R           GG GRRR
Subjt:  KTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHN--SRGGGG-----GRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRR

Query:  SRS-----PRYRRSPSYGRRSYSPRGRS---PRRRSLSP---RGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS
        S+S     PRYRRSPSYGRRSYSPR RS   PRRRS SP   RGRS+SRS PPYR REE+PYANGNG+K+RRRSRS
Subjt:  SRS-----PRYRRSPSYGRRSYSPRGRS---PRRRSLSP---RGRSFSRS-PPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTGCACGAAGACCCCGGGTTATGCCTTTATAGATTTTGATGACCCCAGAGATGCACGGGATGCGATTCATGAATTAGATGGGAAGAATGGCTGGAGAGTTGAACT
TTCTCACAATTCTAGAGGTGGTGGAGGTGGCCGTGGAGGAGGAGGTCGTGGTCGTTCCGGTGGTTCTGATTTGAAATGCTATGAGTGTGGTGAGCCTGGGCATTTTGCTC
GTGAGTGCCGTTTACGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGCTGGAAGAAGACGTAGCCGCAGTCCTCGATACCGCCGGAGTCCAAGTTATGGT
CGCAGGAGTTACAGTCCCCGTGGAAGATCTCCAAGACGTCGCAGCTTGTCACCTCGTGGGCGTAGCTTTAGTAGATCACCTCCATACCGTGGTAGAGAGGAGCTACCTTA
TGCCAACGGAAATGGCATAAAGGACCGGCGCCGGAGCAGGAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACACAAATGATGGGAAGGGTAGAAAATAAGAATTCACATAAGAGTATGGGGCAATTTACCAATTTTAAAAACTTCAAGGACTCCGAGCTAAATTCGTAGGAGATATAT
AAAGCATTCCCGTAGTACCCGAAACCCAAAATATCTGCACCTTGAAGAGAGAATCACGTTGAGCTGCTAGGGTTTTTTCCGGTTTCTTGTAAAGCAATGTCTCGTGTATA
TGTTGGGAATTTGGATCCGAGGGTCTCTGAGCGCGAGCTTGAAGATGAATTTCGTGTGTTTGGAGTTATTCGAAGTGTATGGGTTGCACGAAGACCCCGGGTTATGCCTT
TATAGATTTTGATGACCCCAGAGATGCACGGGATGCGATTCATGAATTAGATGGGAAGAATGGCTGGAGAGTTGAACTTTCTCACAATTCTAGAGGTGGTGGAGGTGGCC
GTGGAGGAGGAGGTCGTGGTCGTTCCGGTGGTTCTGATTTGAAATGCTATGAGTGTGGTGAGCCTGGGCATTTTGCTCGTGAGTGCCGTTTACGTGGTGGTGGTGGCGGC
GGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGCTGGAAGAAGACGTAGCCGCAGTCCTCGATACCGCCGGAGTCCAAGTTATGGTCGCAGGAGTTACAGTCCCCGTGGAAGATCTCC
AAGACGTCGCAGCTTGTCACCTCGTGGGCGTAGCTTTAGTAGATCACCTCCATACCGTGGTAGAGAGGAGCTACCTTATGCCAACGGAAATGGCATAAAGGACCGGCGCC
GGAGCAGGAGCTGAAGACTGCCAACTTCTCAACCTGTCTTAGTTAACACATGATGTTTAGAGGATTACTCCGGTTCTATATGTTTTTAGTGCTTGGACTTCGTATGGGAC
CTTTTTAAAATCGGGCGACGCCCTCAGCCTCTACTTTTGAGTTTGGATAAGTCCTTTCTATCTTCTGTTTGAATTGTTTTTCTTTTAGTTGATCAGTATAGTTGTAGGAT
ACTAAAATATCATTAGTTCATATTTATTTTGATAATGTTATTAAGCAAATGTCTTGAAGGGCACTGCTAAAGATGTATGTTTTTTTTTTCCTTGTTGAGGTGTCGTCTCG
TTCTGCCTCACTGCTTTTCTGCTTCTAGTCGTCTGCTTCTGCTTCACTGCTTTTCTGCTTCTGCCCTATCCTCCGGGATTTCGTTCTACACTGCCCAGCTCTGGGATCTT
CAATTTGAAAGGTTGTAGGTCCCAGCCGGCTATTGATTGAATCTCTCTGCGGTTGTGTGCACGCTCTCATAATGTTTATGGGATTCCTTTTTAATTAACTTGATGAGGCA
TGAGGAACGACATCAAATGCTTCTGGCAGTGACTTGTCTCAAGATGAGCAACTTCTACCCAACTGAGTGCTAGTGGGAGTTCTCTTCCGTGCTACTCGACCTCCCATTTC
AATGATTCTTTAGATTATCGCGTTCGTGTTAAGTTCTGCACATCTAGCAGAGACTTGGTTCGTTTCCCATCTGCTTGAAAGTTCCTATCTCTCAAGAGAAACATAAGTGT
ACCTGTGGGTTGTCATCGGAAGTCGTCATGCCCGCCAGTTTCCCTTCGTCTTAGTATGCGGCTGCTAGGTCCTTGTCTGCCTACATAATTATGCATGTTCGATATGTAAT
CAAGATTTTGTAATTTGGCTTTTGCTTTATCATTTGCCAATGTTTTTATAATTGCCAGGCTGGATCATTTGAATTTTACAGGTTTTTTAGAGAATATTTGAATAGCCTTA
GCTGGAAATGCTAACCTCTACTACTTTGCCTCCCAATCGTTGATTCCTTTTCAATCCATATTTTTTAATTTGGACTCATGGATTCGAAGGGTTTGGGTGAGAATATTAAT
ATTGATTTATATATATATATATATATATATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGCTKTPGYAFIDFDDPRDARDAIHELDGKNGWRVELSHNSRGGGGGRGGGGRGRSGGSDLKCYECGEPGHFARECRLRGGGGGGGGGGGGGAGRRRSRSPRYRRSPSYG
RRSYSPRGRSPRRRSLSPRGRSFSRSPPYRGREELPYANGNGIKDRRRSRS