; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028088 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028088
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionmini zinc finger protein 1
Genome locationchr12:470913..471677
RNA-Seq ExpressionPI0028088
SyntenyPI0028088
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036083.1 mini zinc finger protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-4998.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVI9 ZF-HD dimerization-type domain-containing protein8.7e-51100Show/hide
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A0A1S3B557 mini zinc finger protein 15.6e-5099.05Show/hide
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A0A5A7SZK7 Mini zinc finger protein 11.6e-4998.1Show/hide
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A0A5D3BJJ4 Mini zinc finger protein 15.6e-5099.05Show/hide
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A0A6J1K9G7 mini zinc finger protein 18.7e-3575Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 12.9e-1959.49Show/hide
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Q0J5F8 Mini zinc finger protein 42.6e-2072.88Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 38.4e-2763.11Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 17.3e-3167.31Show/hide
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 23.8e-2764.42Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14440.1 homeobox protein 311.9e-1856.72Show/hide
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AT1G18835.1 mini zinc finger6.0e-2863.11Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 15.2e-3267.31Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 22.7e-2864.42Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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