; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028091 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028091
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptiontranscription factor SPATULA
Genome locationchr08:19714895..19716980
RNA-Seq ExpressionPI0028091
SyntenyPI0028091
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IPR031066 - Basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factors ALC-like, plant
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Homology Show/hide homology
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TYK12876.1 transcription factor SPATULA [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-20993.84Show/hide
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XP_031742540.1 transcription factor SPATULA isoform X2 [Cucumis sativus]4.3e-21795.66Show/hide
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XP_038883118.1 transcription factor APG-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.7e-19791.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLD3 BHLH domain-containing protein2.2e-21995.9Show/hide
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A0A1S3B0R8 transcription factor SPATULA1.3e-21493.98Show/hide
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A0A5D3CR49 Transcription factor SPATULA1.6e-20993.84Show/hide
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A0A6J1IJ91 transcription factor SPATULA-like isoform X22.8e-16181.07Show/hide
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        IS VD+SEQFAN   SGV+HDPLR CPT  PPNASS  VGASDH ENDEF+CES EGLEALVE+LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMK
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        GRTN  +TPFEL PPIQ HLVPFYLS S KSK IC  AL   DHQ VN  + QSETTP +SCP NIP  PDL+ LQNGVS+EPCIIE NRS
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A0A6J1ILN5 transcription factor SPATULA-like isoform X12.9e-16381.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JNI9 Transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR-LIKE 159.2e-2168.97Show/hide
Query:  SSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW-----LSLHPMNLPGSLQYLQLSHM
        S+KRSR AEVHNLSE+RRR RINEKM+ALQ LIPN NK DKASMLDEAIEYLK LQLQVQ       L + PM LP ++Q+LQ+  M
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Q10CH5 Transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR-LIKE 139.2e-2140.1Show/hide
Query:  PPTHNIPPP-YGPPNAVPDEISAVDSS------EQFANS-----------PSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHN-----------------E
        P +H+ PPP   PP A P   S + SS        F  S             +G    P RP  +S    A ++S G S  N                  
Subjt:  PPTHNIPPP-YGPPNAVPDEISAVDSS------EQFANS-----------PSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHN-----------------E

Query:  NDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-KWLS--LHPMNL
         ++ D  SE+      EE  +      S +R+RAAEVHNLSE+RRR RINEKM+ALQ LIP+ NKTDKAS+LDEAIEYLK LQ+QVQ  W++  + PM  
Subjt:  NDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-KWLS--LHPMNL

Query:  PGSLQYL
        PG+ Q++
Subjt:  PGSLQYL

Q8GZM7 Transcription factor PIF11.2e-2046.94Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+Q       + 
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH

Query:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

Q9FHA2 Transcription factor ALC2.3e-1943.24Show/hide
Query:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE
        P PS   EL+  +R     T    P      + P + + V S+E F  S S G +               SS   G S+  + D++  E +         
Subjt:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE

Query:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLP
          +    R+S KR+  A+ HNLSEK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ       L L+PM LP
Subjt:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLP

Q9FUA4 Transcription factor SPATULA9.2e-3743.35Show/hide
Query:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------
        S  D+IS FL+ I  RS          SP PS +S  T    A     H    P+            P ++V       D SE      S          
Subjt:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------

Query:  --HDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK
           +       S     SS+SVGAS  NE DE+DCESEEG EA+V+E P+    P+ RSSSKR RAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQ+LIPNSNKTDK
Subjt:  --HDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK

Query:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL
        ASMLDEAIEYLKQLQLQVQ       ++LHP+ LPG +L  LQLS +R              E  N   L+  +Q A++ + P M      N   + + L
Subjt:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL

Query:  VPPIQAHLVPFYLSES
         P I++H  PF L  S
Subjt:  VPPIQAHLVPFYLSES

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20180.1 phytochrome interacting factor 3-like 58.5e-2246.94Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+Q       + 
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH

Query:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

AT2G20180.2 phytochrome interacting factor 3-like 58.5e-2246.94Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+Q       + 
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH

Query:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

AT2G20180.3 phytochrome interacting factor 3-like 58.5e-2246.94Show/hide
Query:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH
        D  +  E +  + +  E+  EE        +S+KRSRAAEVHNLSE++RR RINE+MKALQ LIP  NK+DKASMLDEAIEY+K LQLQ+Q       + 
Subjt:  DHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQKW---LSLH

Query:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA
        PM  PG  QY  + HM M  G        +Q  P   F+  P+  AA
Subjt:  PMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAA

AT4G36930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.5e-3843.35Show/hide
Query:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------
        S  D+IS FL+ I  RS          SP PS +S  T    A     H    P+            P ++V       D SE      S          
Subjt:  SPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYG-----------PPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVL------

Query:  --HDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK
           +       S     SS+SVGAS  NE DE+DCESEEG EA+V+E P+    P+ RSSSKR RAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQ+LIPNSNKTDK
Subjt:  --HDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTK---PNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDK

Query:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL
        ASMLDEAIEYLKQLQLQVQ       ++LHP+ LPG +L  LQLS +R              E  N   L+  +Q A++ + P M      N   + + L
Subjt:  ASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLPG-SLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIH-PFMSDIGRTNAAETPFEL

Query:  VPPIQAHLVPFYLSES
         P I++H  PF L  S
Subjt:  VPPIQAHLVPFYLSES

AT5G67110.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.6e-2043.24Show/hide
Query:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE
        P PS   EL+  +R     T    P      + P + + V S+E F  S S G +               SS   G S+  + D++  E +         
Subjt:  PSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSGVLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEE

Query:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLP
          +    R+S KR+  A+ HNLSEK+RRS+INEKMKALQ LIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ       L L+PM LP
Subjt:  LPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQLQLQVQ-----KWLSLHPMNLP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCATTCAGTTCCCAACAACTGCGATCGAAATGCATGTACTTCTTCGACGTGGACTCTCCCCGCCGCCGCCGTCTCTTCCTCTTCCCCTCCCGACGATATCTCTCT
GTTTCTTCAACAGATTTTGCGGCGTTCCTCTTCCTCTGCTCCTCACTTCTCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCCATCTTCTCTGAGCTCACCTGCAACATTAGAGCCTTCA
CCCCCCCAACCCATAACATTCCCCCTCCATACGGACCGCCCAATGCAGTCCCGGACGAGATCTCCGCCGTCGATTCCTCAGAACAATTTGCAAATTCCCCATCATCCGGT
GTACTACATGATCCCTTGCGCCCTTGTCCCACATCCATTCCACCCAACGCGTCTTCTACGTCGGTTGGAGCTAGTGATCATAACGAAAACGATGAATTTGACTGCGAAAG
TGAGGAGGGTCTGGAGGCATTGGTTGAAGAGCTGCCTACAAAGCCCAATCCTCGCAGCTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCTGAAGTTCATAATTTGTCTGAAAAGAGAA
GGAGGAGCAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTCTGCAAAATCTGATCCCCAATTCTAACAAGACTGACAAGGCCTCGATGCTAGACGAAGCAATTGAATATCTGAAGCAG
CTTCAACTTCAAGTTCAGAAATGGCTGAGTTTGCATCCTATGAACTTGCCTGGAAGTTTGCAATATCTCCAACTTTCCCACATGAGAATGGACTTTGGTGAAGAAAACAG
GTCAATTTCTTCTGACCAAGAAAGACCTAACCAGATCTTTCTCAGTTTACCTGACCAAAAGGCTGCCTCCATCCATCCTTTCATGTCAGACATTGGAAGAACTAATGCAG
CTGAAACTCCATTTGAATTGGTCCCGCCCATCCAGGCTCACCTAGTCCCTTTTTACTTGAGTGAGTCCTCCAAGTCTAAGGAGATTTGCAGCAGAGCTTTACTGCGAGAT
GATCACCAGGCAGTGAATGTGAATGTGAGCCAATCGGAGACAACTCCCTTAGTGTCATGCCCCTATAACATACCAGAGACTCCTGATTTACAAGGATTGCAGAATGGCGT
CTCAGTGGAACCGTGCATCATTGAAGGAAATCGGTCTGGTGTGCTTCTAAATTACACCCCAGAACACAGCCTTGTTTTCCCTTCCCCTTTTAATGGCATCAAACAAGAAG
ACCGACTGAAACAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTGCTTCGCTTCCTATTCCTCTAATATGGACCATTCAGTTCCCAACAACTGCGATCGAAATGCATGTACTTCTTCGACGTGGACTCTCCCCGCCGCCGCCGTCTCTTC
CTCTTCCCCTCCCGACGATATCTCTCTGTTTCTTCAACAGATTTTGCGGCGTTCCTCTTCCTCTGCTCCTCACTTCTCTCTCCTCTCTCCCTCTCCCTCCATCTTCTCTG
AGCTCACCTGCAACATTAGAGCCTTCACCCCCCCAACCCATAACATTCCCCCTCCATACGGACCGCCCAATGCAGTCCCGGACGAGATCTCCGCCGTCGATTCCTCAGAA
CAATTTGCAAATTCCCCATCATCCGGTGTACTACATGATCCCTTGCGCCCTTGTCCCACATCCATTCCACCCAACGCGTCTTCTACGTCGGTTGGAGCTAGTGATCATAA
CGAAAACGATGAATTTGACTGCGAAAGTGAGGAGGGTCTGGAGGCATTGGTTGAAGAGCTGCCTACAAAGCCCAATCCTCGCAGCTCTTCCAAGAGAAGCAGAGCCGCTG
AAGTTCATAATTTGTCTGAAAAGAGAAGGAGGAGCAGAATTAATGAGAAAATGAAAGCTCTGCAAAATCTGATCCCCAATTCTAACAAGACTGACAAGGCCTCGATGCTA
GACGAAGCAATTGAATATCTGAAGCAGCTTCAACTTCAAGTTCAGAAATGGCTGAGTTTGCATCCTATGAACTTGCCTGGAAGTTTGCAATATCTCCAACTTTCCCACAT
GAGAATGGACTTTGGTGAAGAAAACAGGTCAATTTCTTCTGACCAAGAAAGACCTAACCAGATCTTTCTCAGTTTACCTGACCAAAAGGCTGCCTCCATCCATCCTTTCA
TGTCAGACATTGGAAGAACTAATGCAGCTGAAACTCCATTTGAATTGGTCCCGCCCATCCAGGCTCACCTAGTCCCTTTTTACTTGAGTGAGTCCTCCAAGTCTAAGGAG
ATTTGCAGCAGAGCTTTACTGCGAGATGATCACCAGGCAGTGAATGTGAATGTGAGCCAATCGGAGACAACTCCCTTAGTGTCATGCCCCTATAACATACCAGAGACTCC
TGATTTACAAGGATTGCAGAATGGCGTCTCAGTGGAACCGTGCATCATTGAAGGAAATCGGTCTGGTGTGCTTCTAAATTACACCCCAGAACACAGCCTTGTTTTCCCTT
CCCCTTTTAATGGCATCAAACAAGAAGACCGACTGAAACAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDHSVPNNCDRNACTSSTWTLPAAAVSSSSPPDDISLFLQQILRRSSSSAPHFSLLSPSPSIFSELTCNIRAFTPPTHNIPPPYGPPNAVPDEISAVDSSEQFANSPSSG
VLHDPLRPCPTSIPPNASSTSVGASDHNENDEFDCESEEGLEALVEELPTKPNPRSSSKRSRAAEVHNLSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEYLKQ
LQLQVQKWLSLHPMNLPGSLQYLQLSHMRMDFGEENRSISSDQERPNQIFLSLPDQKAASIHPFMSDIGRTNAAETPFELVPPIQAHLVPFYLSESSKSKEICSRALLRD
DHQAVNVNVSQSETTPLVSCPYNIPETPDLQGLQNGVSVEPCIIEGNRSGVLLNYTPEHSLVFPSPFNGIKQEDRLKQ