; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028103 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028103
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRas GTPase-activating protein-binding protein 2-like
Genome locationchr12:802053..804849
RNA-Seq ExpressionPI0028103
SyntenyPI0028103
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64061.1 hypothetical protein Csa_013259 [Cucumis sativus]1.4e-6296.03Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKAASSLLQTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+N  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
TYJ98943.1 uncharacterized protein E5676_scaffold248G001440 [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-6498.41Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKAASSLLQTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
XP_004137440.2 uncharacterized protein LOC101204278, partial [Cucumis sativus]1.4e-6296.03Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKAASSLLQTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+N  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
XP_008451315.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492624, partial [Cucumis melo]2.6e-6498.41Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKAASSLLQTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
XP_038895860.1 uncharacterized protein LOC120084028 [Benincasa hispida]2.1e-6193.65Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SSL QTLKRY KKPWEITGPCADPEYR AVPSALEYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKET+FD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVM5 Uncharacterized protein6.9e-6396.03Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKAASSLLQTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKE KFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+N  GGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
A0A1S3BR63 uncharacterized protein LOC1034926241.3e-6498.41Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKAASSLLQTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
A0A5D3BI32 Uncharacterized protein1.3e-6498.41Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKAASSLLQTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
A0A6J1E7N6 uncharacterized protein LOC1114313903.8e-6192.06Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SS  QTLKRYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
A0A6J1KK07 uncharacterized protein LOC1114953031.4e-6091.27Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SS  QTLKRYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRV CPA+ KEKAI+PTSNPETVFDIKYY+RDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G08060.1 unknown protein4.9e-4566.14Show/hide
Query:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETK-F
        ++ AASSL+Q L+RYIKKPW+ITGPCA PEY  AVP A EYR+ CPATI E+AI+P+S+PETV++I Y+ RDQRRNRPPIRR +L K +V +MM E K F
Subjt:  MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETK-F

Query:  DPADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        D +DFPKVYLT  +EED++ RGGGY+K
Subjt:  DPADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAAGCTGCTTCTTCTTTATTGCAAACCCTAAAGCGCTACATCAAGAAACCTTGGGAGATCACTGGACCGTGTGCAGATCCAGAGTACAGATCAGCCGTTCCGAG
CGCATTAGAGTACAGGGTCGTTTGCCCCGCCACCATAAAGGAGAAAGCCATTATCCCTACATCCAATCCCGAAACAGTTTTTGACATTAAGTATTACACTCGCGACCAGC
GTCGCAATCGCCCTCCAATTCGACGCACCATCCTCAAGAAACCCGACGTCGAGAAGATGATGAAGGAGACCAAATTCGACCCTGCTGACTTCCCCAAAGTTTATCTCACT
GCCGCGATTGAGGAGGATATCAATGCCCGTGGAGGTGGTTATCAGAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTTTAAAAAAAAAATTATAAAATTACCCCATAAAAAATTAGAAAATCATTTCACAAATTTGTGGGATAACTTTAAGCACTTCGTTGTTGTTTCGTCGGAAGAATTTTG
GGTTTCTCCGCTGAACTTCGCTGTCGTTCACCATGGCCAAAGCTGCTTCTTCTTTATTGCAAACCCTAAAGCGCTACATCAAGAAACCTTGGGAGATCACTGGACCGTGT
GCAGATCCAGAGTACAGATCAGCCGTTCCGAGCGCATTAGAGTACAGGGTCGTTTGCCCCGCCACCATAAAGGAGAAAGCCATTATCCCTACATCCAATCCCGAAACAGT
TTTTGACATTAAGTATTACACTCGCGACCAGCGTCGCAATCGCCCTCCAATTCGACGCACCATCCTCAAGAAACCCGACGTCGAGAAGATGATGAAGGAGACCAAATTCG
ACCCTGCTGACTTCCCCAAAGTTTATCTCACTGCCGCGATTGAGGAGGATATCAATGCCCGTGGAGGTGGTTATCAGAAGTAGAAAGGTTCTTTGTGCTCTGGGCAACGC
TCTCTTCAGCATGTATTCTTCAACTCTGCTTCTCTTTCAATGTTAACCTGAGAGTGGGTTATTTAGGTATAGAAGTTTGTATGCCTAGCCTATACATCAATACAAGACAT
GGGATTTGGCATCAATAAAATACATCTTTTGAACTCCTCAATTTTTTGTTTCTTTTGTAATGTTCTGTGCTTGTATTACAACCATTTGCACACTCTTGCTTTTCCATTGC
TCCTGAATTTTAGGACATTTTGCTTGCATATCATTATTGCTATATTCTCAGCTTTGTGTTATTTGTCTTTGACTTCAGCAATAGTAAAGCTGGGATCTTAATCCCATGGA
CATATGAATAAAGAAGTGAAATTTCCCTTGTCTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKAASSLLQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVVCPATIKEKAIIPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFDPADFPKVYLT
AAIEEDINARGGGYQK