; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028217 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028217
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase Topors
Genome locationchr11:4349075..4352394
RNA-Seq ExpressionPI0028217
SyntenyPI0028217
Gene Ontology termsGO:0000209 - protein polyubiquitination (biological process)
GO:0006513 - protein monoubiquitination (biological process)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR017907 - Zinc finger, RING-type, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646983.1 hypothetical protein Csa_020881 [Cucumis sativus]6.9e-15394.77Show/hide
Query:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN
        MK SSST EPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCI CIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTT N
Subjt:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN

Query:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER
        CSDKLKVGVGSSQ DARGILQSTR ELNRERRSERSLTWRRSFGRRGP+SLP DVVVRRK QWRASIYNRCIQAVPSSVRS LE+N+LGSRGGKEVILER
Subjt:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER

Query:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV
        IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLV SLFVAR+EATSS LNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV
Subjt:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV

XP_004143083.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors [Cucumis sativus]1.1e-15394.79Show/hide
Query:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN
        MK SSST EPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCI CIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTT N
Subjt:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN

Query:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER
        CSDKLKVGVGSSQ DARGILQSTR ELNRERRSERSLTWRRSFGRRGP+SLP DVVVRRK QWRASIYNRCIQAVPSSVRS LE+N+LGSRGGKEVILER
Subjt:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER

Query:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG
        IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLV SLFVAR+EATSS LNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG
Subjt:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG

XP_008458477.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase Topors [Cucumis melo]3.3e-15595.49Show/hide
Query:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN
        MKPSSST EPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERL T N
Subjt:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN

Query:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER
        CS+KLKVGVGSSQTDARGILQSTR ELNRERRSERSLTWRRSFGRRGP+SLP DVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRS LE+NILG+RGGKEVILER
Subjt:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER

Query:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG
        IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLV SLFVARLEATSS LNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYR+VG
Subjt:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG

XP_022999966.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X1 [Cucurbita maxima]6.9e-13785.46Show/hide
Query:  STGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKL
        STGEPARKLNGENF+ KVISPAICG+TCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYC+GCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWF KINLSS+SFRKERL   NC+D L
Subjt:  STGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKL

Query:  KVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILERIKPWI
        K+G+GSS+TDAR ILQSTRNEL+R+RRSER LTWRRSFGRRGPES+P DV+  RKLQWRASIY+R IQAVPSSVRS L MN+ GS G KE ILERIKPWI
Subjt:  KVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILERIKPWI

Query:  QRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV
        QREL+ IL DPDPTIIVHLVTSLFVARLEA SS LNAE+DFLSPLRPFL+EKTDLFWHELRCFAGS LRMEEYDSVVEYRT+
Subjt:  QRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV

XP_038875512.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X1 [Benincasa hispida]9.3e-14288.19Show/hide
Query:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN
        MKP  ST EPA KLNGENFI+KVISPAICGETCPICL EL+DRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWF KINLSS+SFR ERL T N
Subjt:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN

Query:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER
        C DKLK+GVGSS+TDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPES+P DVV  R+LQWRASIYNRCIQA+PSSVRS LE+NILGSRG KE ILER
Subjt:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER

Query:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG
        IKPWI+RELQ ILEDPDPTIIVHLV SLFVARLE  S  LNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGS LRMEEYDSVVEYRT+G
Subjt:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD1 RING-type domain-containing protein5.1e-15494.79Show/hide
Query:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN
        MK SSST EPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCI CIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTT N
Subjt:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN

Query:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER
        CSDKLKVGVGSSQ DARGILQSTR ELNRERRSERSLTWRRSFGRRGP+SLP DVVVRRK QWRASIYNRCIQAVPSSVRS LE+N+LGSRGGKEVILER
Subjt:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER

Query:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG
        IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLV SLFVAR+EATSS LNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG
Subjt:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG

A0A1S3C7X8 E3 ubiquitin-protein ligase Topors1.6e-15595.49Show/hide
Query:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN
        MKPSSST EPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERL T N
Subjt:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN

Query:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER
        CS+KLKVGVGSSQTDARGILQSTR ELNRERRSERSLTWRRSFGRRGP+SLP DVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRS LE+NILG+RGGKEVILER
Subjt:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER

Query:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG
        IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLV SLFVARLEATSS LNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYR+VG
Subjt:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG

A0A6J1CAG7 E3 ubiquitin-protein ligase Topors1.1e-12478.4Show/hide
Query:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN
        MKP  +T EP RKLN ENF++KVISPAICGETCPICLREL+D T AVLT+CIHAYC+ CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWF+KIN SS SFRKE L T N
Subjt:  MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPN

Query:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER
        C DKL  GVGSS+ D+R +LQ  RNELNR RRSE  LTWRRSFGRRG E +P DV+ +RKLQWRASIYNR IQAVPSSVR   E+NI GS G KE ILE+
Subjt:  CSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILER

Query:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV
        IKPWIQRELQ ILEDPDPTIIVHLVTSLFV+RLEA SS LN EDDFL  L PFL+EKTDLFWHELRCFAGS LRMEEYDSVVEYRTV
Subjt:  IKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV

A0A6J1EQ79 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X11.8e-13584.75Show/hide
Query:  STGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKL
        ST EPARKLNGENF+ KVISPAICGETCPICLRELEDR AAVLTTCIHAYC+GCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWF+KI LSS+SFRKERL   NC+D L
Subjt:  STGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKL

Query:  KVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILERIKPWI
        K+G+GSS+TDAR ILQSTRNEL+R+RRSER LTWRRSFGRRGPES+P DV+  RKLQWRASIY+R IQAVPSSVRS L MN+ GS G KE ILERIKPWI
Subjt:  KVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILERIKPWI

Query:  QRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV
        QREL+ IL DPDPTIIVHLVTSLFVARLEA SS LNAE+DFLSPLRPFL+EKTDLFWHELRCFAGS LRMEEYDSVVEYRT+
Subjt:  QRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV

A0A6J1KEK6 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X13.3e-13785.46Show/hide
Query:  STGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKL
        STGEPARKLNGENF+ KVISPAICG+TCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYC+GCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWF KINLSS+SFRKERL   NC+D L
Subjt:  STGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKL

Query:  KVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILERIKPWI
        K+G+GSS+TDAR ILQSTRNEL+R+RRSER LTWRRSFGRRGPES+P DV+  RKLQWRASIY+R IQAVPSSVRS L MN+ GS G KE ILERIKPWI
Subjt:  KVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILERIKPWI

Query:  QRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV
        QREL+ IL DPDPTIIVHLVTSLFVARLEA SS LNAE+DFLSPLRPFL+EKTDLFWHELRCFAGS LRMEEYDSVVEYRT+
Subjt:  QRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08393 E3 ubiquitin-protein ligase ICP02.6e-0632.43Show/hide
Query:  PSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQ
        P S  G P R+  G +           G+ C +C  E+          C+H +CI C++ W  L+ TCPLCNA+
Subjt:  PSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQ

P28284 E3 ubiquitin-protein ligase ICP01.1e-0437.78Show/hide
Query:  GETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCN
        G+ C +C  E+          C+H +CI C++ W  L+ TCPLCN
Subjt:  GETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCN

Q5BIY5 RING finger protein 1451.1e-0440.82Show/hide
Query:  ETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDS
        + C IC    +D  +AV+T C H +  GC++KW  ++ TCPLC+ Q  S
Subjt:  ETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDS

Q80Z37 E3 ubiquitin-protein ligase Topors1.7e-1326.67Show/hide
Query:  CPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKI-----------------NLSSQSFRKERLTTPNCSDKLKVGVGSSQTD
        CPICL   ++   + L  C+H +C  C+++WS  K  CPLC   FDS F  +                 + ++   R+ R  T    ++       S T 
Subjt:  CPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKI-----------------NLSSQSFRKERLTTPNCSDKLKVGVGSSQTD

Query:  AR--------GILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASI-YNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGK-----EVILERI
        +R        G+L        R R  +    + R    RGP +   D    RK+Q +  I + R +      VRS  +         +        L R+
Subjt:  AR--------GILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASI-YNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGK-----EVILERI

Query:  KPWIQRELQVIL--EDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEY
         PW++REL V+         I+ H++ S  V R +  S        F+S LRPFL  +T+ F HE   FA SP  M  +D    Y
Subjt:  KPWIQRELQVIL--EDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEY

Q9NS56 E3 ubiquitin-protein ligase Topors2.6e-1428.23Show/hide
Query:  CPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERR
        CPICL   ++   + L  C+H +C  C+++WS  K  CPLC   FDS F  +   ++   KE +  P+ +       GS  T  R      R  L RER 
Subjt:  CPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERR

Query:  ----------SERSLTWRRS---FGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSR---------------GGK----------
                  + R+ T   S   F   G  + P DV + + +  R     R   A   S+R   E +I+  R               GG+          
Subjt:  ----------SERSLTWRRS---FGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSR---------------GGK----------

Query:  --EVILERIKPWIQRELQVIL--EDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEY
             L R+ PW++REL V+         I+ H++ S  V R +  S        F+S LRPFL  +T+ F HE   FA SP  M  +D    Y
Subjt:  --EVILERIKPWIQRELQVIL--EDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35330.1 RING/U-box superfamily protein6.7e-0542.55Show/hide
Query:  GETCPICLRELED-RTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNA
        G  C ICL E ED  T  ++  C HA+   CI  W + + TCP+C A
Subjt:  GETCPICLRELED-RTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNA

AT1G72220.1 RING/U-box superfamily protein3.9e-0545.45Show/hide
Query:  CPICLREL-EDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNA
        CP+CL E  ED +  +L  C HA+ I CI  W +    CPLC A
Subjt:  CPICLREL-EDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNA

AT2G35420.1 RING/U-box superfamily protein1.3e-0540Show/hide
Query:  GETCPICLRELEDR-TAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFD
        G  C ICL E  D  T  ++T C H +   CI  W  L +TCP+C  + D
Subjt:  GETCPICLRELEDR-TAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFD

AT2G39100.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-6646.44Show/hide
Query:  PSSSTGEPARKLNGENFITK----VISPAICGETCPICLREL-EDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLT
        PSS+    +R L     I K     I PA+ G++CPICL  L E R+AAV+T C H YC+ CIRKWS+ KR CPLCN +FDSWF   + +S+ + KE+L 
Subjt:  PSSSTGEPARKLNGENFITK----VISPAICGETCPICLREL-EDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLT

Query:  TPNCSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVI
             + L     ++ +D R I+Q +R+ L       R L WRRSFGR  P S+P  V+ +RKLQWRASIY + ++AV    R  LE+++  +   K  I
Subjt:  TPNCSDKLKVGVGSSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVI

Query:  LERIKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAE-----DDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV
         ERI+PWI+RELQ +L DPDP++IVH  ++LF+ RLE  ++    +     +D +S LR FL +K D+FWHELRCFA S L ME YD+VVEY  V
Subjt:  LERIKPWIQRELQVILEDPDPTIIVHLVTSLFVARLEATSSLLNAE-----DDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTV

AT5G12310.1 RING/U-box superfamily protein6.1e-0641.18Show/hide
Query:  GETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKR--TCPLCNAQFD
        G  C ICL  +  +  A++  C HAYC+ CI +W++ K   TCP C   FD
Subjt:  GETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKR--TCPLCNAQFD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGCCTTCGAGTTCGACCGGGGAACCGGCGCGAAAGCTCAACGGCGAAAACTTCATAACGAAGGTGATTTCGCCGGCGATTTGTGGAGAAACCTGCCCAATTTGCCT
CAGAGAATTGGAGGATCGTACCGCCGCTGTGCTTACAACGTGTATCCATGCCTATTGCATAGGCTGTATTCGTAAATGGAGCAATTTGAAGCGAACTTGCCCTCTTTGTA
ACGCTCAATTCGATTCATGGTTCACCAAAATCAACCTCTCATCGCAAAGCTTCCGCAAAGAACGGTTGACAACCCCGAATTGTTCCGATAAGCTCAAGGTTGGAGTTGGA
TCTTCCCAGACAGACGCTCGCGGGATTCTTCAGAGCACGAGGAATGAATTAAATAGAGAAAGACGGTCGGAAAGATCACTTACATGGCGGCGATCGTTTGGACGGCGAGG
GCCGGAATCTTTGCCTGTTGATGTTGTTGTCCGGCGAAAACTTCAGTGGCGTGCTAGCATATACAACCGATGTATACAAGCTGTTCCATCTTCGGTCAGATCATTTTTAG
AAATGAACATATTAGGAAGTCGTGGAGGCAAAGAAGTGATTCTAGAGAGGATTAAACCATGGATTCAAAGAGAGCTACAGGTCATCCTCGAGGACCCTGATCCAACCATA
ATTGTTCATCTGGTTACCTCACTATTTGTGGCAAGACTTGAAGCTACTTCCTCACTGCTTAATGCGGAAGATGACTTTCTTTCACCTTTGCGTCCCTTCCTCTTCGAAAA
GACTGATTTATTTTGGCATGAACTAAGATGTTTTGCAGGAAGTCCATTACGGATGGAAGAATATGATTCGGTGGTTGAATATAGAACAGTGGGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCGAAAGTCATGAAGCCTTCGAGTTCGACCGGGGAACCGGCGCGAAAGCTCAACGGCGAAAACTTCATAACGAAGGTGATTTCGCCGGCGATTTGTGGAGAAACCTGCCC
AATTTGCCTCAGAGAATTGGAGGATCGTACCGCCGCTGTGCTTACAACGTGTATCCATGCCTATTGCATAGGCTGTATTCGTAAATGGAGCAATTTGAAGCGAACTTGCC
CTCTTTGTAACGCTCAATTCGATTCATGGTTCACCAAAATCAACCTCTCATCGCAAAGCTTCCGCAAAGAACGGTTGACAACCCCGAATTGTTCCGATAAGCTCAAGGTT
GGAGTTGGATCTTCCCAGACAGACGCTCGCGGGATTCTTCAGAGCACGAGGAATGAATTAAATAGAGAAAGACGGTCGGAAAGATCACTTACATGGCGGCGATCGTTTGG
ACGGCGAGGGCCGGAATCTTTGCCTGTTGATGTTGTTGTCCGGCGAAAACTTCAGTGGCGTGCTAGCATATACAACCGATGTATACAAGCTGTTCCATCTTCGGTCAGAT
CATTTTTAGAAATGAACATATTAGGAAGTCGTGGAGGCAAAGAAGTGATTCTAGAGAGGATTAAACCATGGATTCAAAGAGAGCTACAGGTCATCCTCGAGGACCCTGAT
CCAACCATAATTGTTCATCTGGTTACCTCACTATTTGTGGCAAGACTTGAAGCTACTTCCTCACTGCTTAATGCGGAAGATGACTTTCTTTCACCTTTGCGTCCCTTCCT
CTTCGAAAAGACTGATTTATTTTGGCATGAACTAAGATGTTTTGCAGGAAGTCCATTACGGATGGAAGAATATGATTCGGTGGTTGAATATAGAACAGTGGGTTAAGTGA
AGAGAAGAATCTGTTTGAAGAAAATATTTTGTACTCATTACTTCTCCATTGTTGGTTGCTGGTTATTCTTTAAATGAATTGACATTAATATTAAGGAAAGATTTTGCTAG
AAAGGGAGGAGAGTTGTGGCTTGGATTCAACTTCCTTCTTACCTCCTGAATGAAAGAACCATTATATGAGACTAAGAAATCTTTGTGCTGCCAAGGATTTTAAAGAGGTA
TGCAGTTTGGATATGCTAGTTCGATCCAACCCATATGTCGCTTAACGTTTATAACTAAGTATTGTCGTCCTTCGATTTGAAGATCATCTCAAGAAGAGAAGATTCTTTAC
GAGGAAACATTATGTATTGGTTTCTCACACCGTCCGTGAAGGTATTCCTAACAACAAATTGATTATAGTTGTTGCTCGATCAGGTAGGTGTTGTTGCTCTGTCAGGGTCA
TTCTTTTCGAGCATGAACTGGAAGAGAGAAACATGAAGACAAAGAGTTTCGGACCCACATAAGGTTCTGAAGATGGTATCTGGTTTGGAGGTAGCAATATGATGAGCAAT
ATGATGGATCATTACAGTGGAAGTAGAACACAGTTGGGAGGATTGGAAATGGAATTTTTGTAGAATAATAAGCAATTTTTCCAATGTGGCACTTAGAGCATGTTGTAACA
AGCTAAAAAGAGTTTAGTTCATCTGGTAAATGTATGTTCATGTATTGAGAACCAAGAAGTTATACAGGTTCAATTCTCCCACCCCAAACTTCTATTAAAAAAGAGCATGT
TGTAACTACTTTCTTGAGTGGTTAGAAAAAAAAACAGCACCATTTAAATAATCAGAACGTTATTTCAAGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKPSSSTGEPARKLNGENFITKVISPAICGETCPICLRELEDRTAAVLTTCIHAYCIGCIRKWSNLKRTCPLCNAQFDSWFTKINLSSQSFRKERLTTPNCSDKLKVGVG
SSQTDARGILQSTRNELNRERRSERSLTWRRSFGRRGPESLPVDVVVRRKLQWRASIYNRCIQAVPSSVRSFLEMNILGSRGGKEVILERIKPWIQRELQVILEDPDPTI
IVHLVTSLFVARLEATSSLLNAEDDFLSPLRPFLFEKTDLFWHELRCFAGSPLRMEEYDSVVEYRTVG