| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004146049.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Cucumis sativus] | 3.0e-71 | 85.87 | Show/hide |
Query: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
MAAAA+TCF+L SKF NLSLN SSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPK+K DSAAKRARQAEKRRIYNKA
Subjt: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
Query: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LDGLKKK EAQSEEVLPIE LIAEAYSVIDKAVR GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| XP_008463697.1 PREDICTED: 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Cucumis melo] | 1.2e-72 | 86.96 | Show/hide |
Query: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
MAAAAVTCFAL SKF NLSLN SSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTER+HRYSVVCEAAPKTK+DSAAKRARQAEKRRIYNKA
Subjt: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
Query: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LDGLKKK EAQSEEVLPIEKL+AEAYSVIDKAVR GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| XP_022976587.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 5.5e-65 | 79.78 | Show/hide |
Query: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
A A ++CFALPSKFRNLSLNASSSS+P +PSSSTLRSLSFSSN+S+SAFSNGCLS+ K +R RYSVVCEAAPK K+DSAAKRARQAEKRR+YNKA
Subjt: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
Query: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LD LKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAV+VGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| XP_023534903.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.5e-64 | 78.69 | Show/hide |
Query: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
A A ++CF+LPSKFRNLSLNASSSS+P +PSSSTLRSLSFSSN+S+SAFSNGCLS+ K +R RYSVVCEAAPK K+DSAAKRARQAEKRR+YNKA
Subjt: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
Query: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LD LKKKPE QSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAV+VGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| XP_038899721.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Benincasa hispida] | 8.2e-69 | 82.61 | Show/hide |
Query: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
MAA AV+CF+LPSKFRNLSLNASSS IPA+PSS TLRSLSFSSN S+SAFSNGCL+M K +R RYSVVCEAAPK K+DSAAKR RQAEKRRIYNKA
Subjt: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
Query: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KZK9 Uncharacterized protein | 1.4e-71 | 85.87 | Show/hide |
Query: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
MAAAA+TCF+L SKF NLSLN SSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPK+K DSAAKRARQAEKRRIYNKA
Subjt: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
Query: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LDGLKKK EAQSEEVLPIE LIAEAYSVIDKAVR GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| A0A1S3CJU9 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 5.9e-73 | 86.96 | Show/hide |
Query: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
MAAAAVTCFAL SKF NLSLN SSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTER+HRYSVVCEAAPKTK+DSAAKRARQAEKRRIYNKA
Subjt: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
Query: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LDGLKKK EAQSEEVLPIEKL+AEAYSVIDKAVR GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| A0A5A7VMD2 30S ribosomal protein S20 | 5.9e-73 | 86.96 | Show/hide |
Query: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
MAAAAVTCFAL SKF NLSLN SSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTER+HRYSVVCEAAPKTK+DSAAKRARQAEKRRIYNKA
Subjt: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
Query: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LDGLKKK EAQSEEVLPIEKL+AEAYSVIDKAVR GTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
Subjt: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| A0A6J1F6F1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 3.8e-64 | 79.23 | Show/hide |
Query: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
A A ++CFALPSKFRNLSLNASSSS+ +PSSSTLRSLSFSSN+S+SAFSNGCLS+ K +R RYSVVCEAAPK K+DSAAKRARQAEKRR+YNKA
Subjt: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
Query: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LD LKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAV+VGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| A0A6J1IG57 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 2.6e-65 | 79.78 | Show/hide |
Query: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
A A ++CFALPSKFRNLSLNASSSS+P +PSSSTLRSLSFSSN+S+SAFSNGCLS+ K +R RYSVVCEAAPK K+DSAAKRARQAEKRR+YNKA
Subjt: AAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA----
Query: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
LD LKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAV+VGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt: ---------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A7HJB0 30S ribosomal protein S20 | 7.8e-06 | 45.12 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRIYNKAGTLDGLKKKPE------AQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
SA KR R +EKRR+ NKA +K K + AQ + I +L +A S IDKA + G +H+N A+RRKSRLA + KA
Subjt: SAAKRARQAEKRRIYNKAGTLDGLKKKPE------AQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
|
|
| P62661 30S ribosomal protein S20 | 1.6e-06 | 48.75 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRIYNKA--GTLDGLKKK-----PEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARR
SA KR RQ+ KRR+ NKA + L KK E ++EE L K++ +A S+IDKA + TLH+N AARRKSRL R+
Subjt: SAAKRARQAEKRRIYNKA--GTLDGLKKK-----PEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARR
|
|
| P80380 30S ribosomal protein S20 | 1.6e-06 | 48.75 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRIYNKA--GTLDGLKKK-----PEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARR
SA KR RQ+ KRR+ NKA + L KK E ++EE L K++ +A S+IDKA + TLH+N AARRKSRL R+
Subjt: SAAKRARQAEKRRIYNKA--GTLDGLKKK-----PEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARR
|
|
| P82130 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.5e-36 | 55.06 | Show/hide |
Query: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
MA + C ++ SK NLS SS+ P +S+L+ L+FS+N+S FS GC S+ +R +SVVCE A K+DSAAKR RQAE RR+ NKA
Subjt: MAAAAVTCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAPSSSTLRSLSFSSNISLSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCEAAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA---
Query: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP
LD LKKK A +EE++PI+ LIAEAYS IDKAV GTLHRNTAARRKSRLAR KK VEIHHGWYTP
Subjt: ----------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP
|
|
| Q9ASV6 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.5e-36 | 55.08 | Show/hide |
Query: TCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAP------SSSTL-RSLSFSSNIS-LSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCE-AAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA
+C L S+F+ LSL S S P++ +S+TL SLSFS ++S AFS G L ++K R +VCE AAP K+DSAAKRARQAEKRR+YNK+
Subjt: TCFALPSKFRNLSLNASSSSIPAAP------SSSTL-RSLSFSSNIS-LSAFSNGCLSMRKTERLHRYSVVCE-AAPKTKSDSAAKRARQAEKRRIYNKA
Query: -------------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
L+GLKKK +AQ++E++ +EKLI EAYS IDKAV+V LH+NT ARRKSRLARRKKAVEIHHGWY PD+ AAA
Subjt: -------------GTLDGLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVRVGTLHRNTAARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPDSPAAA
|
|
