; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028251 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028251
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionCentromere protein S-like
Genome locationchr12:3381726..3383756
RNA-Seq ExpressionPI0028251
SyntenyPI0028251
Gene Ontology termsGO:0000712 - resolution of meiotic recombination intermediates (biological process)
GO:0006312 - mitotic recombination (biological process)
GO:0007129 - synapsis (biological process)
GO:0031297 - replication fork processing (biological process)
GO:0036297 - interstrand cross-link repair (biological process)
GO:0043240 - Fanconi anaemia nuclear complex (cellular component)
GO:0071821 - FANCM-MHF complex (cellular component)
GO:0003682 - chromatin binding (molecular function)
GO:0046982 - protein heterodimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009072 - Histone-fold
IPR029003 - CENP-S/Mhf1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004154006.1 protein MHF1 homolog isoform X2 [Cucumis sativus]6.8e-6096.9Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        METGMEEDD ASELLRDRFRLS+ISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
        TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
Subjt:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

XP_008440142.1 PREDICTED: centromere protein S isoform X1 [Cucumis melo]4.6e-5693.08Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        MET MEEDD ASELLRDRFRLSTISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFK+ T+QLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
        K KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

XP_008440159.1 PREDICTED: centromere protein S isoform X2 [Cucumis melo]6.4e-5894.57Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        MET MEEDD ASELLRDRFRLSTISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFK+TKQLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
         KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

XP_011652290.1 protein MHF1 homolog isoform X1 [Cucumis sativus]4.9e-5895.38Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METGMEEDD ASELLRDRFRLS+ISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFKY T+QLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
        KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
Subjt:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

XP_038894699.1 protein MHF1 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]7.1e-5792.25Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        M+TG+EED  ASELLRDRFRLSTISIAEAEA +SGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVIL+AHRNEHL+AILTSICNDLK
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
        TKEPQSERKRKKAPKK+DRDRGAVHI DA
Subjt:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LR97 Uncharacterized protein3.3e-6096.9Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        METGMEEDD ASELLRDRFRLS+ISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
        TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
Subjt:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

A0A1S3B159 centromere protein S isoform X12.2e-5693.08Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        MET MEEDD ASELLRDRFRLSTISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFK+ T+QLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
        K KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

A0A1S3B173 centromere protein S isoform X23.1e-5894.57Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        MET MEEDD ASELLRDRFRLSTISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFK+TKQLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
         KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

A0A5A7UM53 Centromere protein S isoform X12.2e-5693.08Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        MET MEEDD ASELLRDRFRLSTISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFK+ T+QLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKY-TKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
        K KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  KTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

A0A5D3BHQ8 Centromere protein S isoform X23.1e-5894.57Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        MET MEEDD ASELLRDRFRLSTISIAEAEA KSGMEISEPVMTCVADLAFK+TKQLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA
         KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  TKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIADA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
E1BSW7 Centromere protein S4.1e-0726.61Show/hide
Query:  GMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKE
        G E+ +   + LR     +T  + +  A+  G+  S+  +  ++++ F+  +  A+DLE+F +HA R ++ +EDV L A R+  L   +T   ++L +  
Subjt:  GMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKE

Query:  PQSERKRKK
         + + K+KK
Subjt:  PQSERKRKK

Q2TBR7 Centromere protein S1.7e-0833.65Show/hide
Query:  IAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVH
        + E  A    M+ S+  +  ++++ F   +  AKDLE+F +HA R ++NTEDV L A R+  L   +T    D+   +   E+K KK  K +D +R +V 
Subjt:  IAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVH

Query:  IADA
         A+A
Subjt:  IADA

Q6NRI8 Centromere protein S1.2e-0625.89Show/hide
Query:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        M  G EE    ++ L+        S+ +  A    ++ S+  +  ++++ F+  +  AKDLE+F +HA R ++N +DV L A R+  L A ++   +++ 
Subjt:  METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  TKEPQSERKRKK
            + + K+KK
Subjt:  TKEPQSERKRKK

Q8N2Z9 Centromere protein S4.1e-0731.73Show/hide
Query:  IAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVH
        + E  A    M+ S+  +  +++L F+  +  AKDLE+F +HA R ++NTEDV L A R+  L   +T    ++   +   ERK +K  K +D  + +  
Subjt:  IAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVH

Query:  IADA
         A+A
Subjt:  IADA

Q9FI55 Protein MHF1 homolog9.3e-3668.42Show/hide
Query:  EDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQS
        E+    +L+RDRFRLS ISIAEAEAKK+GMEI  PV+ CVADLAFKY + +AKDLELF  HAGRK VN +DV+L+AHRN++LAA L S+CN+LK KEPQS
Subjt:  EDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQS

Query:  ERKRKK-APKKDDR
        ERKRKK + KK+D+
Subjt:  ERKRKK-APKKDDR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G50930.1 Histone superfamily protein6.6e-3768.42Show/hide
Query:  EDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQS
        E+    +L+RDRFRLS ISIAEAEAKK+GMEI  PV+ CVADLAFKY + +AKDLELF  HAGRK VN +DV+L+AHRN++LAA L S+CN+LK KEPQS
Subjt:  EDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQS

Query:  ERKRKK-APKKDDR
        ERKRKK + KK+D+
Subjt:  ERKRKK-APKKDDR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACTGGAATGGAAGAAGACGACTGCGCTTCCGAACTCTTGAGGGACAGGTTCCGGCTCTCCACCATTTCTATCGCTGAAGCCGAAGCGAAGAAAAGCGGCATGGA
AATTTCTGAACCCGTGATGACTTGTGTTGCTGATTTAGCATTCAAATATACAAAACAGTTGGCGAAGGACCTTGAGTTATTTGTTCAGCATGCTGGTCGGAAATCAGTAA
ATACAGAAGATGTAATACTAACAGCCCATAGAAACGAGCATTTAGCTGCCATATTAACATCCATCTGCAATGATCTAAAGACAAAAGAGCCTCAAAGTGAAAGAAAGCGT
AAAAAGGCACCAAAAAAGGATGATAGAGATAGAGGTGCCGTGCATATTGCTGACGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACTGGAATGGAAGAAGACGACTGCGCTTCCGAACTCTTGAGGGACAGGTTCCGGCTCTCCACCATTTCTATCGCTGAAGCCGAAGCGAAGAAAAGCGGCATGGA
AATTTCTGAACCCGTGATGACTTGTGTTGCTGATTTAGCATTCAAATATACAAAACAGTTGGCGAAGGACCTTGAGTTATTTGTTCAGCATGCTGGTCGGAAATCAGTAA
ATACAGAAGATGTAATACTAACAGCCCATAGAAACGAGCATTTAGCTGCCATATTAACATCCATCTGCAATGATCTAAAGACAAAAGAGCCTCAAAGTGAAAGAAAGCGT
AAAAAGGCACCAAAAAAGGATGATAGAGATAGAGGTGCCGTGCATATTGCTGACGCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METGMEEDDCASELLRDRFRLSTISIAEAEAKKSGMEISEPVMTCVADLAFKYTKQLAKDLELFVQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKTKEPQSERKR
KKAPKKDDRDRGAVHIADA