; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028278 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028278
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionthioredoxin H1-like
Genome locationchr03:2072328..2073556
RNA-Seq ExpressionPI0028278
SyntenyPI0028278
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013766 - Thioredoxin domain
IPR017937 - Thioredoxin, conserved site
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004152676.1 thioredoxin H-type [Cucumis sativus]3.0e-5795.12Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNH  VMF+KVDVDELN IASEWKI AMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTS-TAAATSTA
        RAALLKKIEELKTS TAAATSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTS-TAAATSTA

XP_008444759.1 PREDICTED: thioredoxin H1-like [Cucumis melo]8.4e-6096.72Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        MGEEGQVIACHKQSEW+ALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHP VMFLKVDVDELN IASEWKINAMPTFVFVKGGET+HKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
        RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA

XP_023002551.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita maxima]6.9e-5486.07Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M EEGQVIACHK++EW+A LAKAKESGKL+VVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHP V+FLKVDVDELNT+A+EW+INAMPTFVF+K GETVHKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
        ++ALLKKIEELKT TAA TSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA

XP_023537338.1 thioredoxin H-type-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-5385.25Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M EEGQVIACHK++EW+A LAKAKESGKL+VVDFTASWCGPCR IAPYFSELAKNHP V+FLKVDVDELNT+A+EW+INAMPTFVF+K GETVHKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
        ++ALLKKIEELKT TAA TSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA

XP_038886211.1 thioredoxin H-type-like [Benincasa hispida]1.0e-5791.8Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        MGEEGQVIACHKQ EWEALLAK KESGKL+VVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHP V+FLKVDVDELNT+ASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
        + ALLKK+EELKT TAAATSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LRK2 Thioredoxin domain-containing protein1.4e-5795.12Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNH  VMF+KVDVDELN IASEWKI AMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTS-TAAATSTA
        RAALLKKIEELKTS TAAATSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTS-TAAATSTA

A0A1S3BB48 thioredoxin H1-like4.1e-6096.72Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        MGEEGQVIACHKQSEW+ALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHP VMFLKVDVDELN IASEWKINAMPTFVFVKGGET+HKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
        RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA

A0A5A7VIA6 Thioredoxin H-type 12.7e-4393.81Show/hide
Query:  SGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRAALLKKIEELKTSTAAATSTA
        S  +VVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHP VMFLKVDVDELN IASEWKINAMPTFVFVKGGET+HKIVGADRAALLKKIEELKTSTAAATSTA
Subjt:  SGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRAALLKKIEELKTSTAAATSTA

A0A6J1GHE8 thioredoxin H-type-like2.2e-5385.12Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M EEGQVIACHK++EW+A LAKAKESGKL+VVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHP V+FLKVDVDELNT+A+EW+INAMPTFVF+K GETVHKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAATST
        ++ALLKKIEELKT TAA TS+
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAATST

A0A6J1KLL7 thioredoxin H-type-like3.3e-5486.07Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M EEGQVIACHK++EW+A LAKAKESGKL+VVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHP V+FLKVDVDELNT+A+EW+INAMPTFVF+K GETVHKIVGAD
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA
        ++ALLKKIEELKT TAA TSTA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAATSTA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29448 Thioredoxin H11.6e-3261.32Show/hide
Query:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA
        EEGQVIACH    W   L KA ES  LVVVDFTASWCGPCR IAP+F++LAK  P+V+FLKVD DEL ++AS+W I AMPTF+F+K G+ + K+VGA + 
Subjt:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA

Query:  ALLKKI
         L   I
Subjt:  ALLKKI

P29449 Thioredoxin H-type 17.7e-3255.83Show/hide
Query:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA
        EEGQV  CHK  EW     K  E+ KLVVVDFTASWCGPCR IAP  +++AK  P V+FLKVDVDEL T+++EW + AMPTFVF+K G+ V ++VGA + 
Subjt:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA

Query:  ALLKKIEELKTSTAAATSTA
         L + I +     A AT TA
Subjt:  ALLKKIEELKTSTAAATSTA

Q0D840 Thioredoxin H11.7e-3154.24Show/hide
Query:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA
        EEG VIACH + E++A + KAKE+GK+V++DFTASWCGPCR IAP F+E AK  P  +FLKVDVDEL  +A ++ + AMPTF+F+K G    K+VGA + 
Subjt:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA

Query:  ALLKKIEELKTSTAAATS
         L   I +   +TAA+ S
Subjt:  ALLKKIEELKTSTAAATS

Q42403 Thioredoxin H31.6e-3255.08Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M  EG+VIACH   +W   L  A ES KL+V+DFTA+WC PCR IAP F++LAK H  V+F KVDVDELNT+A E+K+ AMPTF+F+K GE    +VGA 
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAA
        +  ++  +E+ KT  AAA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAA

Q96419 Thioredoxin H-type1.4e-3361.11Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M EE QVIACH   EW     KAK+SGKL+V+DFTASWCGPCR I PY SELAK  P V F KVDVD+L  +A E+K+ AMP+FV +K G+ V +IVGA 
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKI
        +  LL KI
Subjt:  RAALLKKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19730.1 Thioredoxin superfamily protein7.9e-3259.81Show/hide
Query:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNH-PSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADR
        EEGQVI CH    W   L KAKES KL+V+DFTASWC PCR IAP F++LAK    S +F KVDVDEL ++A E+ + AMPTFVF+K GE V K+VGA++
Subjt:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNH-PSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADR

Query:  AALLKKI
          L  KI
Subjt:  AALLKKI

AT1G45145.1 thioredoxin H-type 51.3e-2951.85Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M  EG+VIACH    W   +  A ES KL+V+DFTASWC PCR IAP F+E+AK   +V+F K+DVDEL  +A E+K+ AMPTFVF+K G  + ++VGA 
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKI
        +  + +K+
Subjt:  RAALLKKI

AT3G17880.1 tetraticopeptide domain-containing thioredoxin1.2e-2745.95Show/hide
Query:  EGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRAA
        +G+VI+ H  SE EA    AK++ +L+++ FTA+WCGPCR ++P +S LA  H  V+FLKVD+D+ N +A+ W I+++PTF F++ G+ V K+VGAD+ +
Subjt:  EGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRAA

Query:  LLKKIEELKTS
        L +KI +  +S
Subjt:  LLKKIEELKTS

AT3G51030.1 thioredoxin H-type 11.1e-3361.32Show/hide
Query:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA
        EEGQVIACH    W   L KA ES  LVVVDFTASWCGPCR IAP+F++LAK  P+V+FLKVD DEL ++AS+W I AMPTF+F+K G+ + K+VGA + 
Subjt:  EEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRA

Query:  ALLKKI
         L   I
Subjt:  ALLKKI

AT5G42980.1 thioredoxin 31.1e-3355.08Show/hide
Query:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD
        M  EG+VIACH   +W   L  A ES KL+V+DFTA+WC PCR IAP F++LAK H  V+F KVDVDELNT+A E+K+ AMPTF+F+K GE    +VGA 
Subjt:  MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGAD

Query:  RAALLKKIEELKTSTAAA
        +  ++  +E+ KT  AAA
Subjt:  RAALLKKIEELKTSTAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTGAAGAAGGTCAAGTTATTGCATGCCATAAGCAATCTGAATGGGAAGCTCTATTGGCCAAAGCCAAGGAATCTGGAAAATTGGTTGTGGTGGATTTTACTGCTTC
CTGGTGCGGTCCATGCCGTACAATTGCTCCATATTTCTCCGAATTGGCTAAGAATCATCCTAGTGTCATGTTCCTGAAAGTGGATGTGGATGAATTGAATACTATCGCTA
GCGAGTGGAAGATTAATGCAATGCCGACGTTTGTTTTCGTGAAAGGAGGGGAAACAGTTCACAAGATTGTTGGTGCTGATAGAGCGGCACTGTTGAAGAAAATAGAAGAG
CTTAAAACTTCAACAGCTGCTGCTACTTCTACTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCATCGCCATCATCTCTCTGCATTCTTGCGGTTTTTGATACGGAGAATAATATATTAGCAGAAAAGCGATTTGCGTTCCAACCAATGGGTGAAGAAGGTCAAGTTATTGC
ATGCCATAAGCAATCTGAATGGGAAGCTCTATTGGCCAAAGCCAAGGAATCTGGAAAATTGGTTGTGGTGGATTTTACTGCTTCCTGGTGCGGTCCATGCCGTACAATTG
CTCCATATTTCTCCGAATTGGCTAAGAATCATCCTAGTGTCATGTTCCTGAAAGTGGATGTGGATGAATTGAATACTATCGCTAGCGAGTGGAAGATTAATGCAATGCCG
ACGTTTGTTTTCGTGAAAGGAGGGGAAACAGTTCACAAGATTGTTGGTGCTGATAGAGCGGCACTGTTGAAGAAAATAGAAGAGCTTAAAACTTCAACAGCTGCTGCTAC
TTCTACTGCTTAGAGGAATGTGCCCTTCTTATTATTATCAGTATATGGTGTAATGTTGATTCTGGTTTCTAGTTTGCTCTTCTTATGAATTTCATAACAATAAGTTTGAA
GATATATACTGTTCTTGGTTTCCCTTTCAAGAAGTTTGGATAATACGTGCAACTCTCAAATATATGATTCTCTTTGGTGCTTGTTATACTATAGAATCTGCAGGTTTCAT
CATGGAATGAATGGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGEEGQVIACHKQSEWEALLAKAKESGKLVVVDFTASWCGPCRTIAPYFSELAKNHPSVMFLKVDVDELNTIASEWKINAMPTFVFVKGGETVHKIVGADRAALLKKIEE
LKTSTAAATSTA