; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028631 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028631
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT4
Genome locationchr06:28883429..28885492
RNA-Seq ExpressionPI0028631
SyntenyPI0028631
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR006712 - HD-ZIP protein, N-terminal
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577673.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-12989.96Show/hide
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XP_038906160.1 homeobox-leucine zipper protein HAT4 [Benincasa hispida]8.8e-13492.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6T6 Homeobox domain-containing protein4.6e-14496.36Show/hide
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A0A1S3BJZ9 homeobox-leucine zipper protein HAT41.0e-14397.08Show/hide
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A0A5D3CLM5 Homeobox-leucine zipper protein HAT41.0e-14397.08Show/hide
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A0A6J1E9Y0 homeobox-leucine zipper protein HAT41.0e-12789.61Show/hide
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A0A6J1HKW5 homeobox-leucine zipper protein HAT4-like4.6e-12888.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P46600 Homeobox-leucine zipper protein HAT11.1e-6555.78Show/hide
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P46601 Homeobox-leucine zipper protein HAT21.4e-6857.24Show/hide
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        LTEENRRLQKE  ELR LKLSPQFY  MTPPTTL MCPSCERV  P S++               H+ RP+  INPW +          F AL PRS
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P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT33.9e-6860.59Show/hide
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        D+EDG     ++SRKKLRL+K+Q+ VLEE+FKEH+TLNPKQK+ALAKQL LR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCCENLT+ENRRLQKEV EL
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        RALKLSP  YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  S+S+         A P  + + P+  ++PWA A+P R
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P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-41.7e-6658.48Show/hide
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        P K HN+  T         L  +S     +++R S+ G S LRG +VNR   S A  D EEEAA +SSPNS VSS+SG + +  +   G++ + +RA CS
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        KEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+         PST+  PTV  +G+  PQ         + PW +
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Q05466 Homeobox-leucine zipper protein HAT44.2e-7859.53Show/hide
Query:  NLGLTLGLSFDSPPLHL--------------------NSWTND-----ASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADC-EEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSE
        +LGL+LGL+F    ++L                    +SW         +SD + +  R+ +RGIDVNR PPSTA+  +E+A +SSPNSTVSS +GKRSE
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Query:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL
        RE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL+RCCENL
Subjt:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL

Query:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHH----INPWASAI---PARPFNALHPRS
        TEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP               PQP  A   HH    +N WA A        F+AL PRS
Subjt:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHH----INPWASAI---PARPFNALHPRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 41.2e-6758.48Show/hide
Query:  PSKHHNLGLTLGLSFDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTA--DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CS
        P K HN+  T         L  +S     +++R S+ G S LRG +VNR   S A  D EEEAA +SSPNS VSS+SG + +  +   G++ + +RA CS
Subjt:  PSKHHNLGLTLGLSFDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTA--DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CS

Query:  R----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ
        R    G SD+ED   G+ SRKKLRL+KDQ+ VLEE+FKEH+TLNPKQKLALAKQL LR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCC+NLTEENRRLQ
Subjt:  R----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ

Query:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVA-------VPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWAS
        KEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+         PST+  PTV  +G+  PQ         + PW +
Subjt:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVA-------VPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWAS

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 32.8e-6960.59Show/hide
Query:  SFDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-TADCEEE-AAMSSPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGIS
        +++ P    N+W N   S   +   RS LRGIDVNR P +   D E+E A +SSPNSTVSSV SGK+SERE+            ED + +RA CS  G S
Subjt:  SFDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-TADCEEE-AAMSSPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGIS

Query:  DEEDG-----ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQEL
        D+EDG     ++SRKKLRL+K+Q+ VLEE+FKEH+TLNPKQK+ALAKQL LR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCCENLT+ENRRLQKEV EL
Subjt:  DEEDG-----ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQEL

Query:  RALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWASAIPAR
        RALKLSP  YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  S+S+         A P  + + P+  ++PWA A+P R
Subjt:  RALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWASAIPAR

AT4G16780.1 homeobox protein 23.0e-7959.53Show/hide
Query:  NLGLTLGLSFDSPPLHL--------------------NSWTND-----ASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADC-EEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSE
        +LGL+LGL+F    ++L                    +SW         +SD + +  R+ +RGIDVNR PPSTA+  +E+A +SSPNSTVSS +GKRSE
Subjt:  NLGLTLGLSFDSPPLHL--------------------NSWTND-----ASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADC-EEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSE

Query:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL
        RE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL+RCCENL
Subjt:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL

Query:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHH----INPWASAI---PARPFNALHPRS
        TEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP               PQP  A   HH    +N WA A        F+AL PRS
Subjt:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHH----INPWASAI---PARPFNALHPRS

AT4G17460.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein7.6e-6755.78Show/hide
Query:  NLGLTLGLSF-DSPPLHLN--------------SWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SEREMN----
        +LGL+L L F  + PL LN               W N      + +  +  LR IDVN + P+T D EEE  +SSPNST+SS VSGKR  +ERE      
Subjt:  NLGLTLGLSF-DSPPLHLN--------------SWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SEREMN----

Query:  -GEDLD--GDRACSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCE
         G+DLD   DR+ SRG SDEE+   GET RKKLRL+KDQSAVLE++FKEHNTLNPKQKLALAK+LGL  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRC E
Subjt:  -GEDLD--GDRACSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCE

Query:  NLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWASAIPARPFNALHPRS
         LTEENRRL+KE  ELRALKLSP+ Y  M+PPTTL MCPSCERVA P S++               H+ R +  ++PW        F+ + PRS
Subjt:  NLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWASAIPARPFNALHPRS

AT5G47370.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein9.6e-7057.24Show/hide
Query:  MIPSKHHNLGLTLGLSFDSPPLHLNSWTNDASSDRTSE-------TGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSERE-------MN
        M+  +   L L+LG S +  PL +N   N + S+              S LR IDVN   PST +CEE+  +SSPNST+SS +SGKRSERE        +
Subjt:  MIPSKHHNLGLTLGLSFDSPPLHLNSWTNDASSDRTSE-------TGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSERE-------MN

Query:  GEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCEN
        G+D D    DR  SRG SDEE+  GETSRKKLRL+KDQSA LEE+FKEHNTLNPKQKLALAK+L L  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRC E 
Subjt:  GEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCEN

Query:  LTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWAS----AIPARPFNALHPRS
        LTEENRRLQKE  ELR LKLSPQFY  MTPPTTL MCPSCERV  P S++               H+ RP+  INPW +          F AL PRS
Subjt:  LTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWAS----AIPARPFNALHPRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCCCTTCAAAACACCATAATCTCGGCTTAACCCTTGGGTTAAGCTTCGATTCTCCTCCTCTACATCTCAATTCTTGGACTAATGACGCTTCTTCAGATCGGACATC
GGAAACAGGGAGATCGCTTCTCAGAGGCATCGATGTGAATCGGATGCCGCCGTCGACGGCGGATTGTGAAGAGGAGGCGGCGATGTCGAGCCCTAACAGTACGGTGTCGA
GTGTGAGTGGGAAACGGAGTGAACGTGAGATGAACGGTGAAGATCTGGATGGGGATAGAGCTTGTTCGAGAGGGATTAGTGATGAAGAAGATGGTGAAACTTCTAGAAAA
AAGCTCCGGCTTACTAAAGATCAGTCCGCCGTTTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACACAATACTCTCAATCCGAAGCAAAAGTTGGCGTTGGCGAAACAATTGGGTCTCCG
GCCTAGACAAGTCGAAGTTTGGTTCCAAAATAGAAGAGCAAGGACAAAGTTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGCGAATTCCTAAAGAGATGTTGTGAGAATCTAACGGAGG
AGAATAGACGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTGAAACTTTCCCCACAATTCTACATGCACATGACCCCACCCACCACCCTCACCATGTGCCCCTCATGT
GAGCGTGTCGCGGTCCCACCCTCCACATCAGCCCAGCCCACCGTCACACGAATGGGCCAGGCCCAACCTCAGCCCCACCACGCTCGCCCTATCCACCACATCAATCCCTG
GGCCTCCGCCATACCCGCCCGGCCCTTCAACGCCCTTCACCCTCGCTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTGGAGGGGCTTTTCCTCTGACACTCCTTCACTTGTTTCCTTTCCATCATTAATTTTGAGAAAAAACAATTAAATTAAATTCCCCCATTTATTTATTTATTTATTTTTC
CTATTTCCTCTTTCTATATAATCCCTCTTTTCTCCCCTTCTTCTTGGACCACAACTCTCTTCCTTCTTTCCTTCTTTCCTTCCTCCTTCCTCCTCCTTCTTCTTCAAATT
CTCTCTTCAAATTCATCTAAATCCAAAACCATGATCCCTTCAAAACACCATAATCTCGGCTTAACCCTTGGGTTAAGCTTCGATTCTCCTCCTCTACATCTCAATTCTTG
GACTAATGACGCTTCTTCAGATCGGACATCGGAAACAGGGAGATCGCTTCTCAGAGGCATCGATGTGAATCGGATGCCGCCGTCGACGGCGGATTGTGAAGAGGAGGCGG
CGATGTCGAGCCCTAACAGTACGGTGTCGAGTGTGAGTGGGAAACGGAGTGAACGTGAGATGAACGGTGAAGATCTGGATGGGGATAGAGCTTGTTCGAGAGGGATTAGT
GATGAAGAAGATGGTGAAACTTCTAGAAAAAAGCTCCGGCTTACTAAAGATCAGTCCGCCGTTTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACACAATACTCTCAATCCGAAGCAAAA
GTTGGCGTTGGCGAAACAATTGGGTCTCCGGCCTAGACAAGTCGAAGTTTGGTTCCAAAATAGAAGAGCAAGGACAAAGTTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGCGAATTCC
TAAAGAGATGTTGTGAGAATCTAACGGAGGAGAATAGACGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTGAAACTTTCCCCACAATTCTACATGCACATGACCCCA
CCCACCACCCTCACCATGTGCCCCTCATGTGAGCGTGTCGCGGTCCCACCCTCCACATCAGCCCAGCCCACCGTCACACGAATGGGCCAGGCCCAACCTCAGCCCCACCA
CGCTCGCCCTATCCACCACATCAATCCCTGGGCCTCCGCCATACCCGCCCGGCCCTTCAACGCCCTTCACCCTCGCTCGTAAATACCCATACCCTACTGACGAGGGCAAC
TCTGGGCCTATGTGTTTTGTAATGTTCGGCCCATCTTGTTATAATTAGGGGTTGAGTTAGTTAGTTTCTTTTGTCTTAGCGGCAACAAAGCAATACCCTTTTTTCTCTTC
TTTGTAATATTTAGGGGAGGAAAAAAAATTTATATATTTATATATATATGGTTGGAAGGTGATAGAAAAAGGGGTTTTGAGTTGTAAAGTGAAGAATGAGATGCCTAATT
TAATTTTTTCTTTTCAAATTTAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIPSKHHNLGLTLGLSFDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRK
KLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSC
ERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQPHHARPIHHINPWASAIPARPFNALHPRS