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PI0028756 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028756
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
Genome locationtig00003624:1082967..1085658
RNA-Seq ExpressionPI0028756
SyntenyPI0028756
Gene Ontology termsGO:0022900 - electron transport chain (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001694 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H
IPR018086 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AZP40309.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Cucumis melo var. momordica]7.3e-46100Show/hide
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KAG6621729.1 hypothetical protein I3842_Q014300 [Carya illinoinensis]1.4e-4495.96Show/hide
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QMS45227.1 NADH dehydrogenase subunit 1, partial [Aletris obovata]1.4e-4495.96Show/hide
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YP_004849322.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Cucumis sativus]7.3e-46100Show/hide
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YP_009913626.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Luffa acutangula]8.1e-4596.97Show/hide
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A0A290WKZ7 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 16.7e-4595.96Show/hide
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A0A3Q9CX26 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.6e-46100Show/hide
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A0A7D6C5G1 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.9e-4596.97Show/hide
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G3EIX4 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.6e-46100Show/hide
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G3EU12 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.6e-46100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P26845 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.2e-3576.77Show/hide
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        MA +QRRKGP+VVG  GLLQPLADGLKLMIKEP+ PSSAN  +F MAPV TF L+L A AV+PFDYG+V SD NIG+LYLFAISSLGVYGII AGW+SN
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P31839 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 12.2e-4593.94Show/hide
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P92558 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.1e-4492.93Show/hide
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Q01148 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.1e-4492.93Show/hide
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Q01300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.8e-4795.96Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07785.1 NADH dehydrogenase family protein1.3e-4592.93Show/hide
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ATCG01100.1 NADH dehydrogenase family protein1.7e-1642.86Show/hide
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        A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG KL+ KE L PS  N  LF + P    +  L++ +V+PF   +VL+D NIG+    AISS+   G++++G+ SN
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ATMG00516.1 NADH dehydrogenase 1C1.3e-4592.93Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAGTGCTAATTTCTCCCTTTTTAGAATGGCTCCAGTGGCTACATTTATGTTAAGTCTGGTCGCTCGGGCCGTTGTACCTTTTGATTATGGTATTGTATTGTCAGATCCGA
ACATAGGGCTACTTTATTTGTTTGCCATATCTTCGCTAGGTGTTTATGGAATTATTATAGCGGGTTGGTCTAGTAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATTTATCCGTAGGACTCTAAAACTTGCACAAGATCAATATTTCTTTGAGCCTGAAATCTGATTGAATTATCTCAACTTCTTTCTCTCTCTTCTTTTCACCTCCTCCTCC
GCATATTTCTTCCCTTTCTTCTTCTGACTCAACCACAAATCTGTTGAATGAGGGTAGCTTGCTTACTCTCAGCCGCTAGGTTAGAAGGAAATCCGTTGACTGAGTTTATG
CCCTTATGCAGTAAAGAAAGCAAGTGAGGCGGGCTAAGCTTCCATTCTCAGTAGAGTTTCAGATAGAGGATTCGATCTTGCACCTCTCGGGATCCGGTCTTTTTCGAGAA
AAGGTCCGATCCATTAATATCATGATTGGGTCGACCAGGCCAGATCATGAGTGAATAGAAAATCGAAAACGTACATAGCAGTCCCAGCTGAAATACTTGGAATAATTCTA
CCACTTCTACTAGGAGTAGCCTTTTTAGTGCTAGCTGAACGTAAAGTAATGGCTTTTGTGCAACGTCGAAAGGGTCCTGATGTAGTGGGATCGTTCGGATTGTTACAACC
TCTAGCAGATGGTTTGAAATTGATGATAAAAGAACCTCTTTCACCAAGTAGTGCTAATTTCTCCCTTTTTAGAATGGCTCCAGTGGCTACATTTATGTTAAGTCTGGTCG
CTCGGGCCGTTGTACCTTTTGATTATGGTATTGTATTGTCAGATCCGAACATAGGGCTACTTTATTTGTTTGCCATATCTTCGCTAGGTGTTTATGGAATTATTATAGCG
GGTTGGTCTAGTAATTAGGGGGCGGCCGTTCGGTCGCCTATGATACTAGGACCAATAGGTCAAAAATGGGTTTGTGCCGCAGGTGTTGAACGATCTACTCTACACAGGTG
TGGGCTTACAGGGCTAGGGCTCATAAACCCTTTCTTTCATTCATCAATAGGGCCCTGGTCGGTCACTTTTCCGGGCCGGGATCGATAAGTGGAAGTCATAAAAAAGAGAT
CTTTCTCTTCGTACCGCGTAGTGGGAAGGGTAGCTTCTATAGCTATAGCTGGCCTATATATATTTCTATTGCTATAAAGATTCGCTGTCTTTTAACCCTCTCTTCTTCTT
TGTCAACGCTACCTTGGACCTAAAGGAAAAGGCCGACGCCCTACATTAGTAGAAGTAAGCGGCTGAGTTAGCCTAGCCTACCCTCTCAATGTATTGTATAGTAGGGTATA
GTAGGCGAGCGAGTTAGCGAAGACGCTTAGGCTAATAGATAAGAGAGCGTCGGTGCTGCGTAGCCTGAATTCTACTACGCTACGCAAAGGTTACGAAGTCACTTAGCTCG
ACGTTAGGAGAGTCAAGTCAAGGGGGAAGGCCATACCTAGATAGAAGAACCGCTCTTCGTTGACTTTCTAAGGTCGTCGCTTTCGCTCCCCTACTTCAAAGGAGCAAACT
TGACTGTCTTGACTTGAAAGAGGCAGCCCACTACGCTACAGAGAAGAAGAAAGAGAGAAAGAGAAGAAGAAAGTCTCAATATTCTTTGAACCGCGCAATATTCTTTGCAC
CTATTAATAAAGAGTGATTCATATCCTCTTCTTTCTTGAGAGGAGCGAAAGCGGCTCGACTAAAAGGTTCAGAGCGAAAGCGGCTCGACTAAAAGGTTCTTCGGATATTG
ACGAAAGCGGCTCGACTCCCACGGGGCGGTTCAGAGCGAAAGCGACGAGTCATTATCTATATTTTTAAGTCAAGGTGCAAAGAATATTGCGTGAGTTGAGTAAGATCTTG
TGCAAGGACTCTTTATTAATAGGAAAAAGAGGTGAAAAGTGACCTACTTAAGATTCAATTCAAAAGGTCCTACTTAGTTTCGTAAGCCTTTGTCATTCTCAGTCAACTAA
GTAGGGCCTGAGGCCCCCTGCGAATCCGTAAATCTCAGGAGCATGCCGCAACAAAAGGATGGTCCCCTATGCATTGAATTCTTTCCGGCAAAAAAATCAGTACCCCCATC
ATGGTGAACCTCTCCTTGTGATCGGGATGAGGTAGATGCCTCCCAGCCGGGGGGCGGATCGAATCGGAGTTTCCTTAGGTAGCCACCGACCTACAGTTATCCTTAAACTT
CCGTGCTTGGTGGAGAAGAAGCGAACAAAGGTACGCTCGCTTCCTGTCTTCTTCTCTGCTGCGAACTGGGATCGCTCGCCAGCTAGGTCAGATTGGAGCAACCTTTTATG
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CCGTAGCCTAGGGCCTTGTCTGGGCCAAGAGCCATAGTTAGTTCTTCCATTTGCTTCTTTTTTTTTCTTGTTGTTGATACCGGCAAGACCCAGCCAGATGATGTCTGCTG
GTTGGTAGTGAGAGGACTCTTAGTACCTGCATACCCAAAAGAAAGGGGGCGCTGATTACAATCATTTTCTTTTTTTTCTTGCTCTCCCTTAGCAGCGGGGAAGGAGTCCA
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GTCCGGTGGATCTGATCTATAGTTAGGGGGCAATACATACCAAAAGGTTCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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