; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0028896 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0028896
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationchr11:6530429..6532066
RNA-Seq ExpressionPI0028896
SyntenyPI0028896
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008448398.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490597 [Cucumis melo]5.4e-14593.92Show/hide
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XP_011657164.1 uncharacterized protein LOC101220684 [Cucumis sativus]1.1e-14895.61Show/hide
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XP_022148495.1 uncharacterized protein LOC111017117 [Momordica charantia]1.3e-11475.82Show/hide
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XP_023532268.1 uncharacterized protein LOC111794467 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-10975.74Show/hide
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XP_038902956.1 uncharacterized protein LOC120089527 [Benincasa hispida]1.7e-12783.12Show/hide
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         SP SEHI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEA0 Uncharacterized protein5.1e-14995.61Show/hide
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A0A1S3BJ04 uncharacterized protein LOC1034905972.6e-14593.92Show/hide
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A0A5A7V7S7 Uncharacterized protein2.6e-14593.92Show/hide
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A0A6J1D323 uncharacterized protein LOC1110171176.3e-11575.82Show/hide
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        ASSP S
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A0A6J1KZH4 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X12.3e-10975.41Show/hide
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        LFESS D DLNRL+SSPPPKF+FLREAEEKLYR+LMEE+QKK  KN GS+QN E  AIS P  A ++EED             H VS YSSSSSQ+LPLA
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Query:  SSPSS
        SSP S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39560.1 Putative membrane lipoprotein7.5e-2841.06Show/hide
Query:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSITSSQ--VEDEFTNYAKEFFHLICWNWKKGSSSSSSSSSLQQPNNSRENQRNLELRNQESDIEI
        M S S +G+ LS+VFGCLL AL+AELYYLLW KKRS T       D  T   +E   + C +     SSSS SSS        + Q+   L N       
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Query:  GCSKDLLLKSSGGEDGGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLKSTSPLNPL-
                        G E       N+ GP   PRFLFTI EET E++ESED  S KG   +SL+DL L +++     P+LTP  SP L  T PL PL 
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Query:  -NSFKHHGFSINPLFESSIDLDLNRLL------------SSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEE
          S       I+ LFESS D + NRL+            SSP  +FKFLR+AEEKLY+K + E
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AT5G59350.1 unknown protein4.1e-4245.3Show/hide
Query:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWK--KRSITSSQVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKKGSSSSSSSSSLQQPNNSRENQRNLELRNQ
        M + SGLGIGLSL+FG LL ALV E+YYLL  K  K+ + S + E+E         YAKE   L C+             SLQQ N  RE + ++   + 
Subjt:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWK--KRSITSSQVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKKGSSSSSSSSSLQQPNNSRENQRNLELRNQ

Query:  ESDIEIGCSKDLLLKSSGGEDGGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKSTSPLNPL
          D+E+G     L+K   G D G E ELM+LHN     RFLFTI EETK DLESED  +SR GSR+  RSLSD+    +TP  TPL SP   S    +PL
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Query:  NSFKHHGFSINPLFESSIDLDLNRLL---SSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEEAQKKPNK--NDGSVQNSEIRAISIPKEAVQEEEDHRVSPYSSSSS
         S+ HHGF  NPLFES  +L+ N+     SSPPPKFKF+R+AEEKL ++L+EEA+++      +GS       A++  K+   +E D  VS   SSSS
Subjt:  NSFKHHGFSINPLFESSIDLDLNRLL---SSPPPKFKFLREAEEKLYRKLMEEAQKKPNK--NDGSVQNSEIRAISIPKEAVQEEEDHRVSPYSSSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTCTTTTAGTGGATTAGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGGTGTCTTCTGTTTGCTCTTGTTGCTGAGCTTTACTATTTGCTATGGTGGAAGAAAAGAAGTAT
AACTTCTTCACAAGTTGAAGATGAATTCACCAATTATGCTAAAGAGTTTTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAAAAAGGGTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAT
TACAACAACCCAACAATTCTAGAGAAAATCAAAGGAATCTAGAACTGAGGAATCAAGAATCTGATATTGAAATTGGTTGTAGTAAAGATTTGTTGTTGAAATCATCTGGT
GGAGAAGATGGAGGAGTTGAGTTAGAGTTGATGAGACTGCATAATCTTGCAGGTCCACCAAGGTTTCTTTTCACCATTAAAGAGGAAACTAAAGAAGATTTAGAATCTGA
AGATAGAAGCAGAAAAGGATCAAGAACAAGAAGTTTAAGTGATCTTATATTAACTGTCGATACTCCTTTTCTTACTCCTTTGCCTTCTCCTCCATTGAAGTCAACATCTC
CATTAAATCCTTTGAATTCTTTCAAACACCATGGATTCAGTATAAATCCTCTCTTTGAATCATCAATTGATTTGGATTTGAATAGGCTCTTATCTTCACCTCCCCCAAAA
TTTAAGTTCTTAAGAGAGGCAGAAGAGAAACTGTACAGAAAATTAATGGAAGAAGCTCAGAAGAAGCCCAATAAAAATGATGGGTCAGTTCAAAATTCTGAAATTAGAGC
CATCTCCATTCCTAAAGAAGCAGTTCAAGAAGAAGAAGATCATCGCGTCTCACCATATTCTTCAAGTTCATCACAGGTTCTTCCTTTAGCTTCTTCTCCATCTTCAGAGC
ACATATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGAGCTGCCATCCAAGCAACTCCCACAAAATACAATCCCAAACCCCAAATTTTATATTTTCATATATAAATTTCCTTTTTCTTCATCTTCCCTTTCTTAATTTAATCAAT
TGTTCATCTTTTTGGATTCTTTCTCATTTTAAAATTTTACAAATTGGGTTTTTGTTCGCATCTCTTGATTGTGGCTGCTCCTTCATTCTCTTCCCTTTCTAAAGGCCACA
ATCTACAGATTCTTAAGTGATTTGAGTTCTGATTTTGGGGATTTCAACAATTTCTGTTCATGGGGTTTTAGATTTTGGATTGTGGAGTGGGGTTTTTGGTAATTAATGGT
AGGGATTTGAGATTGTTCCCAATTCAAAGGGGAATGACTTCTTTTAGTGGATTAGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGGTGTCTTCTGTTTGCTCTTGTTGCTGAGCT
TTACTATTTGCTATGGTGGAAGAAAAGAAGTATAACTTCTTCACAAGTTGAAGATGAATTCACCAATTATGCTAAAGAGTTTTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAAAA
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TAAAGAGGAAACTAAAGAAGATTTAGAATCTGAAGATAGAAGCAGAAAAGGATCAAGAACAAGAAGTTTAAGTGATCTTATATTAACTGTCGATACTCCTTTTCTTACTC
CTTTGCCTTCTCCTCCATTGAAGTCAACATCTCCATTAAATCCTTTGAATTCTTTCAAACACCATGGATTCAGTATAAATCCTCTCTTTGAATCATCAATTGATTTGGAT
TTGAATAGGCTCTTATCTTCACCTCCCCCAAAATTTAAGTTCTTAAGAGAGGCAGAAGAGAAACTGTACAGAAAATTAATGGAAGAAGCTCAGAAGAAGCCCAATAAAAA
TGATGGGTCAGTTCAAAATTCTGAAATTAGAGCCATCTCCATTCCTAAAGAAGCAGTTCAAGAAGAAGAAGATCATCGCGTCTCACCATATTCTTCAAGTTCATCACAGG
TTCTTCCTTTAGCTTCTTCTCCATCTTCAGAGCACATATAGATTTGATAATGTTATTTTTTCTTTTATTAGATAGGTGTTTATGATTCAATTGATATTTCAGCTTTTTAG
TTGATTTGCATTATGTATCAAAATGCAAACAACTTTCTCACTTTGGGTTTGATTCAACGAGTTAATTAATTTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTCCTTTTTCTTT
TCAAATTCCATTGAAATGTTGTCCTAGCATTGATGAAATTTGGAAATCTGACACTCTTTCATTAGTGGACAAAAGCCAATTATTACATTGTCTTCACGATCACCAAAGAT
AATAATATATTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GEDGGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESEDRSRKGSRTRSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKSTSPLNPLNSFKHHGFSINPLFESSIDLDLNRLLSSPPPK
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