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PI0029075 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0029075
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr01:10031039..10031242
RNA-Seq ExpressionPI0029075
SyntenyPI0029075
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043564.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.8e-2588.06Show/hide
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KAA0062747.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]9.7e-2688.06Show/hide
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KAA0063753.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-2586.57Show/hide
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TYK19779.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.8e-2588.06Show/hide
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]3.1e-2485.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TJS2 Retrotransposon protein2.3e-2588.06Show/hide
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A0A5A7V6M3 Putative nuclease HARBI11.8e-2586.57Show/hide
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A0A5D3CDG6 Putative nuclease HARBI11.5e-2485.07Show/hide
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A0A5D3D8J6 Retrotransposon protein2.3e-2588.06Show/hide
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A0A5D3DG22 Retrotransposon protein4.7e-2688.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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