; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0000196 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0000196
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptiontranscription factor MYB108-like
Genome locationchr03:13318963..13321452
RNA-Seq ExpressionPay0000196
SyntenyPay0000196
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain
IPR044676 - MYB-like transcription factor EOBI/EOBII-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
No hits found
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BDB1 transcription factor MYB108-like3.8e-9797.8Show/hide
Query:  GLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNFTPQEQLIILELHSKWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWRTRVEKQAKQLNIESNSKKFLETVRDLWIPMLLQKM
        GLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNFTPQEQLIILELHSKWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWRTRVEKQAKQLNIESNSKKFLETVRDLWIPMLLQKM
Subjt:  GLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNFTPQEQLIILELHSKWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWRTRVEKQAKQLNIESNSKKFLETVRDLWIPMLLQKM

Query:  DQKPSSPSSSNFSPLSLGETFYQNSCDSSSSEHTIEAKQNSNQSCGGYYQWPESYARVSEEFGNNSDVRNNNNGGFLQMDQL
        DQKPSSPSSSN+SPLSLGETFYQNSC SSSSEHTIEAKQNS QSCGGYYQWPESYARVSEEF NNSDVRNNNNGGFLQMDQL
Subjt:  DQKPSSPSSSNFSPLSLGETFYQNSCDSSSSEHTIEAKQNSNQSCGGYYQWPESYARVSEEFGNNSDVRNNNNGGFLQMDQL
A0A1S3BDB1 transcription factor MYB108-like4.4e+0085.19Show/hide
Query:  MESVRRSPINNNNNHNASAENETHTPP
        MESVRRSPINNNNNHNASAENE    P
Subjt:  MESVRRSPINNNNNHNASAENETHTPP
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAGTGTTAGAAGAAGTCCAATTAATAACAACAATAATCATAATGCATCAGCTGAAAATGAGACACACACTCCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTTC
TCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTT
CTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTTTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTTTCCTCCTCCTCCT
TCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTC
TCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTC
CTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCT
CCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCC
TTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTT
CTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC
CTCCTCCTCCTCCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC
TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTAGGCCTCAAGAGAACAGGAAAAAGCTGCAGATTGAGATGGCTAAACTACTTAAAACCAGACATCAAGCGTGGGAATTTCACCCCTC
AAGAACAGCTCATCATCCTTGAACTCCATTCCAAGTGGGGCAACCGATGGTCAAAGATTGCACAACAATTACCCGGAAGAACAGATAATGAAATAAAGAATTACTGGAGA
ACAAGGGTAGAAAAACAAGCAAAACAACTAAACATTGAATCAAACAGCAAGAAATTCTTGGAGACAGTTCGTGATTTGTGGATTCCAATGTTGCTTCAAAAAATGGACCA
AAAACCATCATCACCAAGCTCCTCAAACTTCAGTCCTCTATCTTTAGGAGAAACTTTTTATCAAAACTCATGTGATTCATCCTCATCAGAACACACCATTGAAGCCAAAC
AGAACTCAAATCAGAGCTGTGGAGGATATTATCAATGGCCAGAATCATATGCAAGGGTTTCAGAAGAGTTTGGGAATAATTCTGATGTGCGGAATAATAATAATGGTGGG
TTCCTTCAGATGGACCAATTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAAGTGTTAGAAGAAGTCCAATTAATAACAACAATAATCATAATGCATCAGCTGAAAATGAGACACACACTCCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTTC
TCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTT
CTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTTTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTTTCCTCCTCCTCCT
TCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTC
TCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTC
CTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTTCTTCTTCT
CCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTCC
TTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTTCTTCTCCTTCTT
CTTCTCCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC
CTCCTCCTCCTCCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC
TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTAGGCCTCAAGAGAACAGGAAAAAGCTGCAGATTGAGATGGCTAAACTACTTAAAACCAGACATCAAGCGTGGGAATTTCACCCCTC
AAGAACAGCTCATCATCCTTGAACTCCATTCCAAGTGGGGCAACCGATGGTCAAAGATTGCACAACAATTACCCGGAAGAACAGATAATGAAATAAAGAATTACTGGAGA
ACAAGGGTAGAAAAACAAGCAAAACAACTAAACATTGAATCAAACAGCAAGAAATTCTTGGAGACAGTTCGTGATTTGTGGATTCCAATGTTGCTTCAAAAAATGGACCA
AAAACCATCATCACCAAGCTCCTCAAACTTCAGTCCTCTATCTTTAGGAGAAACTTTTTATCAAAACTCATGTGATTCATCCTCATCAGAACACACCATTGAAGCCAAAC
AGAACTCAAATCAGAGCTGTGGAGGATATTATCAATGGCCAGAATCATATGCAAGGGTTTCAGAAGAGTTTGGGAATAATTCTGATGTGCGGAATAATAATAATGGTGGG
TTCCTTCAGATGGACCAATTATAACTACAATTACAACACCCATTTTCTTTGTTGGGTGCTACCTGTGGAGGTGCAGAGTTTGATGGGCATATGGTTGCATCTGATTGGGT
GTTCCAGGATGATGTGTCAGAGACCTTCTGGAATTTCTAGAGTAAATTAATACACAGGTTCTCTCAGTCTCGATACATCCTTTACTCGCAAAAGAAAAAAAAACTATATT
AAAAAATTATTATTTTTCATTTGGCAGTTTGTAACAGAGTAATTAGGTAGATTGTAAAAATGATGAGTGCAACTCAAATGCACCCAAATAATTAGTTGCACAGGTTATTG
GATTTTTTCGCTAATTGTAAGACAAAACCCCATTTTATAAGATGAAGATTTTGTTCCACTTCAGTGGAGCTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESVRRSPINNNNNHNASAENETHTPPPSSPPPSSSSPSPPPPSPPPPSSPPSPSPPSPSSSSPPSSSSPPSPSSPSPSSPSPSSSSSPPSPSSPFPPPPSPSSPFPPPP
SPPPPSPPPPSSPPPPSPSSSSSPPPSSSPPPSSSSSPSPPPPSPPPPPSPPPPSPSPSPSPPSPSPPSPSPSPPSPSPSPSSSSPSSSSSPSPSSSSPSPSSSPPPSSS
PPSSSSPPSSSSPPSPSSSPPSPSSSPPPPSPSPPSPSPSSPSPSPSSPSSPSSPSPSSPSPSSPSSSPSSPSSSPSSPSPSSSSSSSSSSSSSSSSLLLLLLLLLLLLL
LLLLLSPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLGLKRTGKSCRLRWLNYLKPDIKRGNFTPQEQLIILELHSKWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWR
TRVEKQAKQLNIESNSKKFLETVRDLWIPMLLQKMDQKPSSPSSSNFSPLSLGETFYQNSCDSSSSEHTIEAKQNSNQSCGGYYQWPESYARVSEEFGNNSDVRNNNNGG
FLQMDQL