CuGenDBv2

Gene ID	Pay0001701
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	AT-rich interactive domain-containing protein 5A, putative
Genome location	chr02:21935806..21937090
RNA-Seq Expression	Pay0001701
Synteny	Pay0001701
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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e value

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A0A1S3BW57 uncharacterized protein LOC103494120

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A0A5A7UV79 Putative AT-rich interactive domain-containing protein 5A

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A0A6J1BYA9 uncharacterized protein LOC111006843

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT1G73885.1 unknown protein

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                   + +LPGL+PD +EG +WD LGFF++YLWAFGI+FALI+ G+A  TYNEGATDFKETP YKE++Q+R++L E E+SN  DVFESNPTEVA
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTCTGACCATAACCAATGGCGGTGCCACCGCCGGCACCACTGGGGGAATTCTCTACAGAACCTTCACAAGAACTCCTCCTTCTAACTATTTCCTTTTCCGCCGCAA
CGCACTCTTTCATCCCTCAAAAGAAGCCCGCACCCTCCATGTCGTTCAAGCCAAGAAATCCTCCTTCCGAACAGGGCGATTCGACAGTAAGAACCGGAGGAGCTCGACGA
CGATCAAGGAACAGGATAAAGAAGAAGAAGAAGAACGAAATCGGACGGCTGGGATTGAAATGGGCAGTCCCATCGTTGAAAATGCCGGCGTAGTGTTTGATGTGGATGAG
AATTTGCCGGAGTTGCCTGGGCTTCAGCCAGATTTCTGGGAGGGTCCGCAGTGGGATGCCCTAGGCTTCTTCCTAGAGTATTTGTGGGCTTTTGGAATCGTTTTCGCGCT
TATTGCTTGTGGGATTGCTGTCACCACATATAATGAAGGAGCAACTGATTTCAAGGAGACACCTGCATATAAAGAATCAGTTCAAACTAGAGAGATTTTAGAACCAGAGG
CATCAAACCCAGATGTGTTTGAATCCAATCCAACTGAGGTGGCTCCAAGTTTGGAATGA

mRNA sequence

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GAAGCAAAAACAAAATCCTCTTCTCATTTTTCGGAGGGCTCAGAGCTCACTCTCCACCATTCAAATGCCTCTGACCATAACCAATGGCGGTGCCACCGCCGGCACCACTG
GGGGAATTCTCTACAGAACCTTCACAAGAACTCCTCCTTCTAACTATTTCCTTTTCCGCCGCAACGCACTCTTTCATCCCTCAAAAGAAGCCCGCACCCTCCATGTCGTT
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GGCTGGGATTGAAATGGGCAGTCCCATCGTTGAAAATGCCGGCGTAGTGTTTGATGTGGATGAGAATTTGCCGGAGTTGCCTGGGCTTCAGCCAGATTTCTGGGAGGGTC
CGCAGTGGGATGCCCTAGGCTTCTTCCTAGAGTATTTGTGGGCTTTTGGAATCGTTTTCGCGCTTATTGCTTGTGGGATTGCTGTCACCACATATAATGAAGGAGCAACT
GATTTCAAGGAGACACCTGCATATAAAGAATCAGTTCAAACTAGAGAGATTTTAGAACCAGAGGCATCAAACCCAGATGTGTTTGAATCCAATCCAACTGAGGTGGCTCC
AAGTTTGGAATGATGTTGATACTTAGATATCAAAAACAGATTACACATCTTGGATACATTATCATCCTCCCAAGCAGTTAAAGAAGTGAAAAAGAAAACAAAGGATACTG
TGTGAATTTGTAATGGCATATTTATCTAGGTATGTTATGACAACTTTATTCTATTGTATCTAGTTAAGATTTTGATCTTATGTCTTAGTTTTCTTGTCAATATGTTGTTT
TTTCTTTTAGGTCTTTCTTCTGTAGACTTAGATTGCTCTCCTTAGACTGACTGTTTTAGTGAGATTGGGGAATAAGGCATATCTATCTGCTAAGTGGATCGAATTGGTCC
GGTTCAAACGTTAAAATGCTAAAGAAACAACTATATTTTGTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPLTITNGGATAGTTGGILYRTFTRTPPSNYFLFRRNALFHPSKEARTLHVVQAKKSSFRTGRFDSKNRRSSTTIKEQDKEEEEERNRTAGIEMGSPIVENAGVVFDVDE
NLPELPGLQPDFWEGPQWDALGFFLEYLWAFGIVFALIACGIAVTTYNEGATDFKETPAYKESVQTREILEPEASNPDVFESNPTEVAPSLE

Pay0001701 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome