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PEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
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CSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLDFGMTPSRSPISGTPYHEGMMSPNYLLSPNLRLS
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PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
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Query: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
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PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAG
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Query: YSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDKDDRSRKDDRNNR
YSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDKDDRSRKDDRNNR
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|
|
| A0A6J1CV04 DNA-directed RNA polymerase subunit | 0.0e+00 | 97.15 | Show/hide |
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+ + +S RP+ I+ + ++ CRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWH+ESETG +TPG
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DTFVRIEKGEL+SGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETIS AKNEVKNLIKKAQERS
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LEPEPGRTMM+SFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
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NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
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EDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADR+QLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
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PGEDPLSVEAQKNATL FNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
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Query: LREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELNREMM
LREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEI+P+KISPWLLRIELNREMM
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VDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDE EGFK
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Query: PEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
PEMEWMLDTEGVNLLAV+CHEDVDA+RTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
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CSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLDFGMTPSRSPISGTPYHEGMMSP+YLLSPNLRLS
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PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
Subjt: PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
Query: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
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Query: PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAG
PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSP++SPSSPQYSPSAG
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YSPTAPGYSPSSTSQYTPQTS+KDDRSRKDDR+NR
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|
|
| A0A6J1ELE9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 0.0e+00 | 97.23 | Show/hide |
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+ + +S RP+ I+ + ++ CRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGK+PAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINL+RTSAWHSESE+G +TPG
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DTFVRIEKGELLSGTLCKK LGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKAQERS
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LEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
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NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMD+VWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
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EDENWKP+YMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
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PGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
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LREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEED+DFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELNREMM
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VDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGEL DESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDENEGFK
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Query: PEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
PEMEWMLDTEGVNLLAV+CHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
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CSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGL+FGMTPSRSPISGTPYHEGMMSP+YLLSPNLRLS
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PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
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Query: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
Subjt: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
Query: PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAG
PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTG SPDYSPSSPQYSPSAG
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YSPTAPGYSPSSTSQYT QT+DKDDRSRKDDR+NR
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P08775 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 | 0.0e+00 | 58.7 | Show/hide |
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+ T +S RP+ I+ + + RK TKRD F+ + MN+LM+ +DGK+P PAILKP+PLWTGKQ+F+LIIP IN RT + H + E H
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Query: VTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA
++PGDT V +E GEL+ G LCKK+LGTS GSL+H+ + E+G D R F + Q ++N WLL +IGIGD+IAD+ T + I TI AK +V +I+KA
Subjt: VTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA
Query: QERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESR
LEP PG T+ +FEN+VN++LN ARD GSSAQKSLSE NN K+MV +G+KGS INISQ+ A VGQQNVEGKRIPFGF RTLPHF KDDYGPESR
Subjt: QERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESR
Query: GFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIF
GFVENSYL GLTP EFFFHAMGGREGLIDTAVKT+ETGYIQRRL+K+ME +MVKYD TVRNS+ V+Q YGEDG+ +E Q L +LK K FE+ F
Subjt: GFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIF
Query: RYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQER
R+++ +E + + V+D+ + +N E E +++ DR L I TG++ +P NL R+I NAQK F I+ R SD+HP+++VE + +L ++
Subjt: RYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQER
Query: LKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
L +V G+DPLS +AQ+NATL FNI LRST S+R+ +E+RL+ EAF+W++GEIES+F Q++ PGEM+G +AAQS+GEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
Subjt: LKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
Query: GVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELN
GVPRL+E+IN++K+ KTPSL+V+L ++ + ERAK + C LE+TTLR VT T ++YDP+P ST++ ED ++V YYEMPD ++A +ISPWLLR+EL+
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Query: REMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDE---SAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNK-
R+ M D+KL+M IAEKIN F DDL CIFNDDNAEKL+LRIRIMN + K + +E +DDVFL+ IESNMLT+M L+GI I+KV++ + +
Subjt: REMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDE---SAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNK-
Query: ----FDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRH
E+ FK EW+L+T+GV+L+ V+ +DVD RTTSN ++E+ VLGIEAVR++L EL VISFDGSYVNYRHLA+LCDTMT RGHLMAITRH
Subjt: ----FDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRH
Query: GINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLD--------FGMTPSRSPISG-
G+NR DTGP+M+CSFEETVD+L++AA + E+D ++GV+ENIMLGQLAP GTG L L+ E K +E +P+ I GL FG P SP+ G
Subjt: GINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLD--------FGMTPSRSPISG-
Query: ----TPYHEGMMSPNYLLSPNLRL---------------------------------SPISDAQFSPYV--GGMAFSPTSSP-----------GYSPSSP
TP+++G SP++ SP S SPY+ G A SP+ SP GY+P SP
Subjt: ----TPYHEGMMSPNYLLSPNLRL---------------------------------SPISDAQFSPYV--GGMAFSPTSSP-----------GYSPSSP
Query: GYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY
YSP+SP YSPTSP YSPTSP YSPTSP YSPTSP+YSP+SP YSPTSP+YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP+Y
Subjt: GYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY
Query: SPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSP
SPTSP+YSPTSP+YSPTSPSYSPTSPSYSPTSP+YSPTSP+Y+PTSPSYSPTSPSYSPTSP Y+PTSP YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSY+P S +Y+P
Subjt: SPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSP
Query: -SQAYSPSSPRLSPSSP-YSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSA-GYSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDK
S Y+PSSP SPSSP YSPTSP Y+PTSPSYSP+SP Y+P+SP YSP+SP + SP YSP+SP YSP+ YSPT+P YSP+S YTP TS K
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|
|
| P11414 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 | 0.0e+00 | 58.7 | Show/hide |
Query: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETG----H
+ T +S RP+ I+ + + RK TKRD F+ + MN+LM+ +DGK+P PAILKP+PLWTGKQ+F+LIIP IN RT + H + E H
Subjt: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETG----H
Query: VTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA
++PGDT V +E GEL+ G LCKK+LGTS GSL+H+ + E+G D R F + Q ++N WLL +IGIGD+IAD+ T + I TI AK +V +I+KA
Subjt: VTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA
Query: QERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESR
LEP PG T+ +FEN+VN++LN ARD GSSAQKSLSE NN K+MV +G+KGS INISQ+ A VGQQNVEGKRIPFGF RTLPHF KDDYGPESR
Subjt: QERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESR
Query: GFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIF
GFVENSYL GLTP EFFFHAMGGREGLIDTAVKT+ETGYIQRRL+K+ME +MVKYD TVRNS+ V+Q YGEDG+ +E Q L +LK K FE+ F
Subjt: GFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIF
Query: RYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQER
R+++ +E + + V+D+ + +N E E +++ DR L I TG++ +P NL R+I NAQK F I+ R SD+HP+++VE + +L ++
Subjt: RYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQER
Query: LKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
L +V G+DPLS +AQ+NATL FNI LRST S+R+ +E+RL+ EAF+W++GEIES+F Q++ PGEM+G +AAQS+GEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
Subjt: LKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
Query: GVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELN
GVPRL+E+IN++K+ KTPSL+V+L ++ + ERAK + C LE+TTLR VT T ++YDP+P ST++ ED ++V YYEMPD ++A +ISPWLLR+EL+
Subjt: GVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELN
Query: REMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDE---SAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNK-
R+ M D+KL+M IAEKIN F DDL CIFNDDNAEKL+LRIRIMN + K + +E +DDVFL+ IESNMLT+M L+GI I+KV++ + +
Subjt: REMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDE---SAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNK-
Query: ----FDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRH
E+ FK EW+L+T+GV+L+ V+ +DVD RTTSN ++E+ VLGIEAVR++L EL VISFDGSYVNYRHLA+LCDTMT RGHLMAITRH
Subjt: ----FDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRH
Query: GINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLD--------FGMTPSRSPISG-
G+NR DTGP+M+CSFEETVD+L++AA + E+D ++GV+ENIMLGQLAP GTG L L+ E K +E +P+ I GL FG P SP+ G
Subjt: GINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLD--------FGMTPSRSPISG-
Query: ----TPYHEGMMSPNYLLSPNLRL---------------------------------SPISDAQFSPYV--GGMAFSPTSSP-----------GYSPSSP
TP+++G SP++ SP S SPY+ G A SP+ SP GY+P SP
Subjt: ----TPYHEGMMSPNYLLSPNLRL---------------------------------SPISDAQFSPYV--GGMAFSPTSSP-----------GYSPSSP
Query: GYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY
YSP+SP YSPTSP YSPTSP YSPTSP YSPTSP+YSP+SP YSPTSP+YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP+Y
Subjt: GYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY
Query: SPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSP
SPTSP+YSPTSP+YSPTSPSYSPTSPSYSPTSP+YSPTSP+Y+PTSPSYSPTSPSYSPTSP Y+PTSP YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSY+P S +Y+P
Subjt: SPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSP
Query: -SQAYSPSSPRLSPSSP-YSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSA-GYSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDK
S Y+PSSP SPSSP YSPTSP Y+PTSPSYSP+SP Y+P+SP YSP+SP + SP YSP+SP YSP+ YSPT+P YSP+S YTP TS K
Subjt: -SQAYSPSSPRLSPSSP-YSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSA-GYSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDK
|
|
| P18616 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 | 0.0e+00 | 86.25 | Show/hide |
Query: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETGHVTPG
+ + ++ RP+ I+ + ++ CRKITKRDTFI KDVFMN LMWWEDFDGK+PAPAILKP+PLWTGKQVFNLIIPKQINL R SAWH+++ETG +TPG
Subjt: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETGHVTPG
Query: DTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKAQERS
DT VRIE+GELL+GTLCKK LGTS GSL+HVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQN F+IGIGDTIAD++TMEKINETIS AK VK+LI++ Q +
Subjt: DTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKAQERS
Query: LEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
L+PEPGRTM D+FEN+VNQVLNKARDDAGSSAQKSL+E+NNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGF RTLPHFTKDDYGPESRGFVE
Subjt: LEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
Query: NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKK EF+R F+YE
Subjt: NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
Query: EDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
+DENW P Y+ EH+EDLK IRE R+VF+AE KLE DR+QLGTEIAT G+++WP+PVN+KR I NAQKTFKID R+ SDMHP+EIV+A+DKLQERL VV
Subjt: EDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
Query: PGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
PG+D LSVEAQKNATLFFNILLRST ASKRVL+EY+L+REAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
Subjt: PGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
Query: LREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELNREMM
LREIINVAKRIKTPSLSVYL PEA+K+KE AKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEED +FV+SYYEMPDE+++P+KISPWLLRIELNREMM
Subjt: LREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELNREMM
Query: VDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDENEGFK
VDKKLSMA+IAEKINLEFDDDLTCIFNDDNA+KLILRIRIMNDE PKGEL DESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIK + ++FDE GFK
Subjt: VDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDENEGFK
Query: PEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
EWMLDTEGVNLLAVMCHEDVD +RTTSNHLIE+IEVLGIEAVRR+LLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGP+MR
Subjt: PEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
Query: CSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLDFGMTPSRSPISGTPYHEGMMSPNYLLSPNLRLS
CSFEETVDILLDAA YAETD LRGVTENIMLGQLAPIGTG C LYLNDEMLKNAIELQLPSY+DGL+FGMTP+RSP+SGTPYHEGMMSPNYLLSPN+RLS
Subjt: CSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLDFGMTPSRSPISGTPYHEGMMSPNYLLSPNLRLS
Query: PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
P+SDAQFSPYVGGMAFSP+ SSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
Subjt: PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
Query: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPA YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
Subjt: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
Query: PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAG
PTSPSYSPTSPSY PTSPSYNPQSAKYSPS AYSPS+ RLSP+SPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSP+YSPSSPTYSPSSPY++G SPD YSPSAG
Subjt: PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAG
Query: YSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDKDDRSRKDD
YSPT PGYSPSST QYTP DK D++ K D
Subjt: YSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDKDDRSRKDD
|
|
| P24928 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 | 0.0e+00 | 58.63 | Show/hide |
Query: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETG----H
+ T +S RP+ I+ + + RK TKRD F+ + MN+LM+ +DGK+P PAILKP+PLWTGKQ+F+LIIP IN RT + H + E H
Subjt: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETG----H
Query: VTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA
++PGDT V +E GEL+ G LCKK+LGTS GSL+H+ + E+G D R F + Q ++N WLL +IGIGD+IAD+ T + I TI AK +V +I+KA
Subjt: VTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA
Query: QERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESR
LEP PG T+ +FEN+VN++LN ARD GSSAQKSLSE NN K+MV +G+KGS INISQ+ A VGQQNVEGKRIPFGF RTLPHF KDDYGPESR
Subjt: QERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESR
Query: GFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIF
GFVENSYL GLTP EFFFHAMGGREGLIDTAVKT+ETGYIQRRL+K+ME +MVKYD TVRNS+ V+Q YGEDG+ +E Q L +LK K FE+ F
Subjt: GFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIF
Query: RYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQER
R+++ +E + + V+D+ + +N E E +++ DR L I TG++ +P NL R+I NAQK F I+ R SD+HP+++VE + +L ++
Subjt: RYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQER
Query: LKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
L +V G+DPLS +AQ+NATL FNI LRST S+R+ +E+RL+ EAF+W++GEIES+F Q++ PGEM+G +AAQS+GEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
Subjt: LKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTL
Query: GVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELN
GVPRL+E+IN++K+ KTPSL+V+L ++ + ERAK + C LE+TTLR VT T ++YDP+P ST++ ED ++V YYEMPD ++A +ISPWLLR+EL+
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Query: REMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDE---SAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNK-
R+ M D+KL+M IAEKIN F DDL CIFNDDNAEKL+LRIRIMN + K + +E +DDVFL+ IESNMLT+M L+GI I+KV++ + +
Subjt: REMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDE---SAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNK-
Query: ----FDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRH
E+ FK EW+L+T+GV+L+ V+ +DVD RTTSN ++E+ VLGIEAVR++L EL VISFDGSYVNYRHLA+LCDTMT RGHLMAITRH
Subjt: ----FDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRH
Query: GINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLD--------FGMTPSRSPISG-
G+NR DTGP+M+CSFEETVD+L++AA + E+D ++GV+ENIMLGQLAP GTG L L+ E K +E +P+ I GL FG P SP+ G
Subjt: GINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLD--------FGMTPSRSPISG-
Query: ----TPYHEGMMSPNYLLSPNLRL---------------------------------SPISDAQFSPYV--GGMAFSPTSSP-----------GYSPSSP
TP+++G SP++ SP S SPY+ G A SP+ SP GY+P SP
Subjt: ----TPYHEGMMSPNYLLSPNLRL---------------------------------SPISDAQFSPYV--GGMAFSPTSSP-----------GYSPSSP
Query: GYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY
YSP+SP YSPTSP YSPTSP YSPTSP YSPTSP+YSP+SP YSPTSP+YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP+Y
Subjt: GYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY
Query: SPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSP
SPTSP+YSPTSP+YSPTSPSYSPTSPSYSPTSP+YSPTSP+Y+PTSPSYSPTSPSYSPTSP Y+PTSP YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSY+P S +Y+P
Subjt: SPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSP
Query: -SQAYSPSSPRLSPSSP-YSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSA-GYSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDK
S Y+PSSP SPSSP YSP SP Y+PTSPSYSP+SP Y+P+SP YSP+SP + SP YSP+SP YSP+ YSPT+P YSP+S YTP TS K
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|
|
| P35084 DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb1 | 0.0e+00 | 62.97 | Show/hide |
Query: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETGHVTPG
+ + +S RP+ I+ + ++ R TKRD F+ KD+ MNILMW +DGK+P PAILKP+ LWTGKQ+F+LIIP INL R ++ H++ E + G
Subjt: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETGHVTPG
Query: DTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKAQERS
DT V IE+GELL+G LCK++LG + GS+IHV+ E G D R F+ TQ +VN+WL+ F++GIGDTIAD+ATM K+ TIS+AKN+VK LI KAQ +
Subjt: DTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKAQERS
Query: LEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
E +PG++++++FE KVNQVLNKARD AGSSAQ SLSE NNLKAMVTAGSKGSFINISQM ACVGQQNVEGKRIPFGF RTLPHFTKDDYGPESRGFVE
Subjt: LEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
Query: NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMED+ +KYD TVRNSLGDVIQF YGEDG+D ++E+Q +DSL+ E ER++R++
Subjt: NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
Query: EDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
+ ++ +M P +E ++ R+ E E +++++DR L EI +GE +WP+PVNL+RLI NAQK F ID RR SD++P +V I+KL RLK++
Subjt: EDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
Query: PGEDPLS---------VEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSA
D E NAT+ F+IL+RSTFASKRVL E+RLT +AF WV GEIES+FLQ+L PGEM+G +AAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVS+
Subjt: PGEDPLS---------VEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSA
Query: KNVTLGVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLL
KNVTLGVPRL+EIIN+AK++KTPSL++YLKP + +RAK V+ LEYTTL +VT ATE++YDPDP +TII ED +FV SY+E+PDEEI +SPWLL
Subjt: KNVTLGVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLL
Query: RIELNREMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKC-GKV
RIEL+R M+ DKKL+MA+I + + +F L CIF+DDNAEKLILRIR++ + KG D +DD FL++IESNML+EM LRGI I KVF++ K+
Subjt: RIELNREMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKC-GKV
Query: NKFDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGI
K EN GF EW+LDT+GV+LL VM H DVD RTTSN ++E+I+VLGIEAVR +LL ELR VISFDGSYVNYRHLAIL D MTYRGHLMAITRHGI
Subjt: NKFDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGI
Query: NRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLP-----SYIDGLDFGMTPSRSPISG--TPYH
NR +TGP+MRCSFEETV+IL+DAA+++ETD ++GVTENI+LGQL P+GTG ++LN +M+KNA + LP SY D TPS S G TP+H
Subjt: NRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLP-----SYIDGLDFGMTPSRSPISG--TPYH
Query: EGMMSPNYLLSPNLRLSPISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPT
+P LSP ++ + G + S +SPGY+ ++ Y SS Y P SP YSPTSP YSPTSP YSPTSP+YSP+SP YSPTSP+YSPT
Subjt: EGMMSPNYLLSPNLRLSPISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPT
Query: SPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP
SPSYSPTSP YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP+YSPTSP+YSPTSP+YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSP+SP
Subjt: SPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSP
Query: SYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTS
SYSP+SP+YSP+SP YSP+SP+++ +Y P +
Subjt: SYSPTSPAYSPTSPGYSPTSPSYSPTSPSYSPTS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G57660.1 nuclear RNA polymerase A1 | 1.9e-68 | 25.02 | Show/hide |
Query: NGLSTLATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNIL-------MWWEDFDGK---------------IPAPAILKPQPLWTGKQVFN
N + A +G P+++ L+ ++ IV +TKRDTF+ KD F +L M F G+ PAILKP PLWTGKQV
Subjt: NGLSTLATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNIL-------MWWEDFDGK---------------IPAPAILKPQPLWTGKQVFN
Query: LIIPK----------------QINLTRTSAWHSESETGHVTP------------GDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFL
++ + ++ + + + +G +T + + I K E + G + K + L+H + E G +AA L
Subjt: LIIPK----------------QINLTRTSAWHSESETGHVTP------------GDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFL
Query: GHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA----QERSLEPEPGRTMMD----------------SFENKVNQVLNK-A
L +L + F+ G+ D I E+ + + +N + +++K + ++P+ R+ ++ S N +NQ +K
Subjt: GHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKA----QERSLEPEPGRTMMD----------------SFENKVNQVLNK-A
Query: RDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLI
+D S N + M +G+KGS +N Q+++ +GQQ++EGKR+P +TLP F D+ P + GF+ + +L GL PQE++FH M GREGL+
Subjt: RDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLI
Query: DTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREF
DTAVKTS +GY+QR L+K +E + V YD TVR++ G +IQF YGEDG+D F +F++ + +L + ED+
Subjt: DTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREF
Query: RNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSW--PMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILL
+G +S+ +P++LK+ A+K VEA+ + ER+
Subjt: RNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSW--PMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILL
Query: RSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLREII-NVAKRIKTPSLSVYLK
ASK V E L ++S+F SL PGE +G +AAQS+GEP+TQMTLNTFH AG NVTLG+PRL+EI+ A IKTP ++ L
Subjt: RSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLREII-NVAKRIKTPSLSVYLK
Query: PEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEV---------------------WYDPD--PMST-IIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRI----
KTKE A + L T+ + ++ E+ Y P+ P T I EED + + E A E L RI
Subjt: PEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEV---------------------WYDPD--PMST-IIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRI----
Query: ----------ELNREMMVDKKLS---------------MANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNM
E + + V K + + + A+K + D++ N ++ I + D E D + + E +M
Subjt: ----------ELNREMMVDKKLS---------------MANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNM
Query: LTEMALRGIPDINK-----------------VFIKCGKVNKFD---------------------------ENEG----------FKPEMEW---------
+ ++G+ ++ + +F+K G+ KF+ +N G P++ +
Subjt: LTEMALRGIPDINK-----------------VFIKCGKVNKFD---------------------------ENEG----------FKPEMEW---------
Query: -----------MLDTEGVNLLAVMCHED-VDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRN
L GV+ A+ +D +D R SN + +++ + G+EA R +++ E+ V G V+ RHL ++ D MT+ G ++R G
Subjt: -----------MLDTEGVNLLAVMCHED-VDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRN
Query: DTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTG
T P R +FE ++ AA Y E D L + I LG A GTG
Subjt: DTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTG
|
|
| AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein | 9.4e-07 | 42.54 | Show/hide |
Query: TSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPT---SPSYSPTSPS--YSPTSPSYSPT---SPSYSP
T SPG SP SP SPS P P+ P + SPG SP SP P+ P+ +P SPG PTSP +PT SP SPT+P+ SP S +PT SP SP
Subjt: TSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPT---SPSYSPTSPS--YSPTSPSYSPT---SPSYSP
Query: TSPS--YSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY-SPTSPGYSPTSPSYS
T+PS SP SPS SP+ P P SP +PTSP P+ S +P+SP SP +PS PT S SP P+ P P+ P+ SP P P+ P
Subjt: TSPS--YSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAY-SPTSPGYSPTSPSYS
Query: PTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSP--RLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSP-AYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAGYSPT
PT S P++P+ P + PS Y P P SP SP P P +SP SPS P P YSP P P P T P SPS P SP G P
Subjt: PTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSP--RLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSP-AYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAGYSPT
Query: AP-GYSPSSTSQYTP
+P Y PS +P
Subjt: AP-GYSPSSTSQYTP
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 0.0e+00 | 86.25 | Show/hide |
Query: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETGHVTPG
+ + ++ RP+ I+ + ++ CRKITKRDTFI KDVFMN LMWWEDFDGK+PAPAILKP+PLWTGKQVFNLIIPKQINL R SAWH+++ETG +TPG
Subjt: LATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKIPAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINLTRTSAWHSESETGHVTPG
Query: DTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKAQERS
DT VRIE+GELL+GTLCKK LGTS GSL+HVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQN F+IGIGDTIAD++TMEKINETIS AK VK+LI++ Q +
Subjt: DTFVRIEKGELLSGTLCKKALGTSTGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISAAKNEVKNLIKKAQERS
Query: LEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
L+PEPGRTM D+FEN+VNQVLNKARDDAGSSAQKSL+E+NNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGF RTLPHFTKDDYGPESRGFVE
Subjt: LEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVE
Query: NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKK EF+R F+YE
Subjt: NSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEF
Query: EDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
+DENW P Y+ EH+EDLK IRE R+VF+AE KLE DR+QLGTEIAT G+++WP+PVN+KR I NAQKTFKID R+ SDMHP+EIV+A+DKLQERL VV
Subjt: EDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVV
Query: PGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
PG+D LSVEAQKNATLFFNILLRST ASKRVL+EY+L+REAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
Subjt: PGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPR
Query: LREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELNREMM
LREIINVAKRIKTPSLSVYL PEA+K+KE AKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEED +FV+SYYEMPDE+++P+KISPWLLRIELNREMM
Subjt: LREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPEKISPWLLRIELNREMM
Query: VDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDENEGFK
VDKKLSMA+IAEKINLEFDDDLTCIFNDDNA+KLILRIRIMNDE PKGEL DESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIK + ++FDE GFK
Subjt: VDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDENEGFK
Query: PEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
EWMLDTEGVNLLAVMCHEDVD +RTTSNHLIE+IEVLGIEAVRR+LLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGP+MR
Subjt: PEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMR
Query: CSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLDFGMTPSRSPISGTPYHEGMMSPNYLLSPNLRLS
CSFEETVDILLDAA YAETD LRGVTENIMLGQLAPIGTG C LYLNDEMLKNAIELQLPSY+DGL+FGMTP+RSP+SGTPYHEGMMSPNYLLSPN+RLS
Subjt: CSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTGGCALYLNDEMLKNAIELQLPSYIDGLDFGMTPSRSPISGTPYHEGMMSPNYLLSPNLRLS
Query: PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
P+SDAQFSPYVGGMAFSP+ SSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
Subjt: PISDAQFSPYVGGMAFSPTSSPGYSPSSPGYSPSSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPGYSPTSPTYSPSSPGYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS
Query: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPA YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
Subjt: YSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPGYS
Query: PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAG
PTSPSYSPTSPSY PTSPSYNPQSAKYSPS AYSPS+ RLSP+SPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSP+YSPSSPTYSPSSPY++G SPD YSPSAG
Subjt: PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYNPQSAKYSPSQAYSPSSPRLSPSSPYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPAYSPSSPTYSPSSPYNTGPSPDYSPSSPQYSPSAG
Query: YSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDKDDRSRKDD
YSPT PGYSPSST QYTP DK D++ K D
Subjt: YSPTAPGYSPSSTSQYTPQTSDKDDRSRKDD
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 1.2e-110 | 30.96 | Show/hide |
Query: STLATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKI--PAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINL-----------TRT
+ L T ++G I++ S + IT++DTF + F I + D I P P ILKP LWTGKQ+F++++ ++
Subjt: STLATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKI--PAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINL-----------TRT
Query: SAWHSESETGHVTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGT-STGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISA
H ET + G +V EL+SG L K LG + L ++ + AA + L W+ + FSIGI D ++ ++I
Subjt: SAWHSESETGHVTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGT-STGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEKINETISA
Query: AKNEVKNLIKKAQERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLP
++ I++ +L+ + G S E ++ +LN R+ G + L N+ M GSKGS INISQM ACVGQQ V G R P GFIDR+LP
Subjt: AKNEVKNLIKKAQERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFGFIDRTLP
Query: HFTKDDYGPESRGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDS
HF + P ++GFV NS+ GLT EFFFH MGGREGL+DTAVKT+ TGY+ RRL+KA+ED++V YD TVRN+ G ++QF YG+DGMD +E +
Subjt: HFTKDDYGPESRGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWIESQKLDS
Query: LKMKKKEFERIFRYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPM
L F R+F + + P P + E FE E+ + D+ ++ T+
Subjt: LKMKKKEFERIFRYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRRASDMHPM
Query: EIVEAIDKLQERLKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTF
V+++ + L V P +L +++ + + L+ + + R+ + + G IG + AQSIGEP TQMTL TF
Subjt: EIVEAIDKLQERLKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPATQMTLNTF
Query: HYAGVSAKNVTLGVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPE
H+AGV++ N+T GVPR+ EIIN +K I TP +S L+ T A+ V+ +E TTL V ++ EV S I D + E A
Subjt: HYAGVSAKNVTLGVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMPDEEIAPE
Query: KISPWLLRIELNREMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVF
I+PW ++ + + + K+N D+D IR+++ + D+S F N+L + + GI + +V
Subjt: KISPWLLRIELNREMMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESNMLTEMALRGIPDINKVF
Query: IKCGKVNKFDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMA
+ D+++ + +W L EG NLLAVM ++ R TTSN+++EV + LGIEA R +++DE+ V+ G ++ RH+ +L D MTYRG ++
Subjt: IKCGKVNKFDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYRHLAILCDTMTYRGHLMA
Query: ITRHGINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTG
I R GI + D +M+ SFE T D L AA + D++ GVTE +++G +GTG
Subjt: ITRHGINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTG
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 6.3e-104 | 30.52 | Show/hide |
Query: STLATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKI--PAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINL-----------TRT
+ L T ++G I++ S + IT++DTF + F I + D I P P ILKP LWTGKQ+F++++ ++
Subjt: STLATQRSGRPIKSIILVSEYFIIVRCRKITKRDTFITKDVFMNILMWWEDFDGKI--PAPAILKPQPLWTGKQVFNLIIPKQINL-----------TRT
Query: SAWHSESETGHVTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGT--------STGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEK
H ET + G +V EL+SG L K L + L ++ + AA + L W+ + FSIGI D ++
Subjt: SAWHSESETGHVTPGDTFVRIEKGELLSGTLCKKALGT--------STGSLIHVIWEEVGPDAARKFLGHTQWLVNYWLLQNAFSIGIGDTIADAATMEK
Query: INETISAAKNEVKNLIKKAQERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFG
++I ++ I++ +L+ + G S E ++ +LN R+ G + L N+ M GSKGS INISQM ACVGQQ V G R P G
Subjt: INETISAAKNEVKNLIKKAQERSLEPEPGRTMMDSFENKVNQVLNKARDDAGSSAQKSLSESNNLKAMVTAGSKGSFINISQMTACVGQQNVEGKRIPFG
Query: FIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWI
FIDR+LPHF + P ++GFV NS+ GLT EFFFH MGGREGL+DTAVKT+ TGY+ RRL+KA+ED++V YD TVRN+ G ++QF YG+DGMD +
Subjt: FIDRTLPHFTKDDYGPESRGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTSETGYIQRRLVKAMEDIMVKYDGTVRNSLGDVIQFLYGEDGMDAVWI
Query: ESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRR
E + L F R+F + + P P + E FE E+ + D+ ++ T+
Subjt: ESQKLDSLKMKKKEFERIFRYEFEDENWKPNYMLPEHVEDLKTIREFRNVFEAEVQKLEADRYQLGTEIATTGENSWPMPVNLKRLIQNAQKTFKIDFRR
Query: ASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPAT
V+++ + L V P +L +++ + + L+ + + R+ + + G IG + AQSIGEP T
Subjt: ASDMHPMEIVEAIDKLQERLKVVPGEDPLSVEAQKNATLFFNILLRSTFASKRVLDEYRLTREAFEWVIGEIESRFLQSLVAPGEMIGCVAAQSIGEPAT
Query: QMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMP
QMTL TFH+AGV++ N+T GVPR+ EIIN +K I TP +S L+ T A+ V+ +E TTL V ++ EV S I D +
Subjt: QMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLREIINVAKRIKTPSLSVYLKPEANKTKERAKTVQCALEYTTLRSVTQATEVWYDPDPMSTIIEEDIDFVKSYYEMP
Query: DEEIAPEKISPWLL--------RIELNRE--MMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESN
E A I+PW + RI+LN ++D L + + +K FN N + ++ I I+N +K +E
Subjt: DEEIAPEKISPWLL--------RIELNRE--MMVDKKLSMANIAEKINLEFDDDLTCIFNDDNAEKLILRIRIMNDEAPKGELTDESAEDDVFLKKIESN
Query: MLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYR
++ E D++K+ K P W NLLAVM ++ R TTSN+++EV + LGIEA R +++DE+ V+ G ++ R
Subjt: MLTEMALRGIPDINKVFIKCGKVNKFDENEGFKPEMEWMLDTEGVNLLAVMCHEDVDARRTTSNHLIEVIEVLGIEAVRRSLLDELRVVISFDGSYVNYR
Query: HLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTG
H+ +L D MTYRG ++ I R GI + D +M+ SFE T D L AA + D++ GVTE +++G +GTG
Subjt: HLAILCDTMTYRGHLMAITRHGINRNDTGPMMRCSFEETVDILLDAAVYAETDHLRGVTENIMLGQLAPIGTG
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