; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0002541 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0002541
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionzinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Genome locationchr08:19687104..19688359
RNA-Seq ExpressionPay0002541
SyntenyPay0002541
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACX85638.1 putative transposase [Cucumis melo]2.2e-12973.04Show/hide
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ADN33674.1 transposase [Cucumis melo subsp. melo]2.2e-12973.04Show/hide
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KAA0058067.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-11989.33Show/hide
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XP_016899473.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X2 [Cucumis melo]2.1e-10864.9Show/hide
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XP_016903394.1 PREDICTED: zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo]9.1e-12089.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DU07 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like isoform X11.0e-10864.9Show/hide
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A0A1S4E592 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like4.4e-12089.92Show/hide
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A0A5A7UTL3 Putative transposase5.7e-12089.33Show/hide
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D0UIX2 Putative transposase1.0e-12973.04Show/hide
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E5GB32 Transposase1.0e-12973.04Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 12.8e-1524.44Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  ++ F  LE  D +Y   ++ P+ EDW   +    +LK   +   +              + W         T + +  F 
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Query:  RLCDDYYMRMSK----------------------------------------------------EKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEIPSISSSGFYK
         +  D + R  K                                                    E  +Q    TP    +G G  + +   S  ++    
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Query:  ARATVHDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPS-ESAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTA
            V      S        K+E+ +YLDE+    +  +  D+L WWK+N+ ++  +S++ARDI +IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSS  P+  
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Query:  EALIICAQNWIQSKP
        EAL +CA++W+Q  P
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P08770 Putative AC transposase8.2e-1524.83Show/hide
Query:  DVPTRWNSTFTMLDGAIKCQKTFERLEEHDPSYLPKDDI-PTTEDWDNAKVFVKFLKTFSE---------------------------------------
        DV TRWNST+ ML  A+  +    RL+  DP     D I P  E+W  A    K LK F +                                       
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Query:  -------EDGAKIWTNK---------VEEAFRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGF--GFQSQSEIPSISSSGFYKARATVHDRFKQSNKTCLDD--
               E   K W            ++  ++++  ++YM+    K+        ++ F    +   +  S  S    K + T +D    +     DD  
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Query:  -------------AKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALIICAQN
                        E+ +Y+ E  +   G    D+L+WW+   + + I++Q+ARD+ +I +STV SESAFS GGRV+D +R+ L  +  EAL IC ++
Subjt:  -------------AKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALIICAQN

Query:  WI
        W+
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Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 23.3e-1626.35Show/hide
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        +DV T+WN+T+ ML  A+  ++ F  LE  D +Y   ++ P+ EDW   +    +LK                                         FS
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Query:  ------EEDGAKIWTN----------------------------KVEEA-FRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEIPSISSSGFYK
               E   K W +                             VE A + ++ DD    + KE  +Q    TP    +G G  + +      ++    
Subjt:  ------EEDGAKIWTN----------------------------KVEEA-FRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPI---EGFGFQSQSEIPSISSSGFYK

Query:  ARATVHDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPS-ESAFS--TGGRVLDSFRSSLTPQTA
            V      S        K+E+ +YLDE+    +  +  D+L WWK+N+ +F  +S++ARDI +IP+S V S  S FS  TG R+LD +RSSL P+  
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Query:  EALIICAQNWIQSKP
        EAL +CA++W+Q  P
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Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 37.4e-1625.97Show/hide
Query:  MDVPTRWNSTFTMLDGAIKCQKTFERLEEHDPSYLPKDDIPTTEDWDNAKVFVKFL---------------------------------KTFSEEDGAKI
        +DV T+WN+T+ ML  A+  Q+ F  LE  D  Y   ++ P+TEDW   +    +L                                    + ED    
Subjt:  MDVPTRWNSTFTMLDGAIKCQKTFERLEEHDPSYLPKDDIPTTEDWDNAKVFVKFL---------------------------------KTFSEEDGAKI

Query:  WTNKV-EEAFRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGF-----------YKARATVHDRFKQSNKTCLDDAKT-----------
         T K+  E F +   D  + ++       +    +  F   S S+I S+ ++ +           Y   AT  +  + ++ T    A T           
Subjt:  WTNKV-EEAFRRLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFGFQSQSEIPSISSSGF-----------YKARATVHDRFKQSNKTCLDDAKT-----------

Query:  --------------EVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSE----SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALIICA
                      E+ +YL+EA +  + D   ++L WWK+N+ +F  +S++ARD+ +IP+S V S     SA +TG ++LD +RSSL P+T EAL  CA
Subjt:  --------------EVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSE----SAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALIICA

Query:  QNWIQSKP
        ++W+Q  P
Subjt:  QNWIQSKP

Q9M2N5 Zinc finger BED domain-containing protein DAYSLEEPER3.1e-1425.35Show/hide
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        +D  T+WN+T+ ML  A + ++ F  L+  DP Y      P+ EDW + +    FLK   E                                 ED    
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Query:  --AKIWTNKVEEAFR--------RLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFG-----------FQSQSEIPSISSSGFYKARAT-VHDRFKQSNKTCLDDA
          AK    KV++ +R         +  D   +M   ++S ++      G             F     +PS  ++     +A  + D      +T   + 
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Query:  KTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTPQTAEALIICAQNWI
        K+E+ +YLDE  +  +  +  D+L WWK N  ++  +S++ARDI SIP+S    +  F    R +D +++SL P+T EAL ICA+ W+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain7.7e-0830.68Show/hide
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        E+T+YL E+ +        D+L WWKVNS R+  +S +ARD  ++  ++   E  F   G  +D  +  + P  +   +IC ++WI++
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AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain2.2e-1525.35Show/hide
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        +D  T+WN+T+ ML  A + ++ F  L+  DP Y      P+ EDW + +    FLK   E                                 ED    
Subjt:  MDVPTRWNSTFTMLDGAIKCQKTFERLEEHDPSYLPKDDIPTTEDWDNAKVFVKFLKTFSE---------------------------------EDG---

Query:  --AKIWTNKVEEAFR--------RLCDDYYMRMSKEKYSQTQSCTPIEGFG-----------FQSQSEIPSISSSGFYKARAT-VHDRFKQSNKTCLDDA
          AK    KV++ +R         +  D   +M   ++S ++      G             F     +PS  ++     +A  + D      +T   + 
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        K+E+ +YLDE  +  +  +  D+L WWK N  ++  +S++ARDI SIP+S    +  F    R +D +++SL P+T EAL ICA+ W+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGTTCCGACACGATGGAATTCTACTTTTACTATGTTGGATGGAGCAATTAAGTGTCAAAAGACTTTTGAAAGATTGGAGGAGCATGACCCTAGTTATTTG
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AAGGTTGAAGAAGCATTTCGTCGATTGTGTGATGATTATTATATGAGAATGTCAAAAGAAAAATATTCACAAACACAATCATGTACACCTATCGAAGGATTTGGC
TTTCAAAGTCAAAGTGAAATACCTTCTATCTCATCTAGTGGATTTTACAAGGCACGTGCTACTGTTCATGATAGATTTAAACAAAGTAACAAAACATGTCTAGAT
GATGCTAAAACAGAGGTGACTCGTTATCTGGATGAGGCTCGTATAGATTGTATGGGCGATGAATATTTAGATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGA
TTTAAGATCATTAGCCAAGTAGCTAGGGACATCTACAGTATTCCTATATCAACTGTGCCTTCTGAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTT
CGAAGTTCTTTAACTCCTCAAACTGCAGAGGCACTCATTATTTGTGCTCAGAATTGGATTCAGTCTAAACCTTTGGATGACATGACTGAAGAAATTGACGGGGCT
GAAGAAATTGATGAAGGTAATATTCTTTTTGAAAGTCTTGAAGCTCAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FQSQSEIPSISSSGFYKARATVHDRFKQSNKTCLDDAKTEVTRYLDEARIDCMGDEYLDLLTWWKVNSSRFKIISQVARDIYSIPISTVPSESAFSTGGRVLDSF
RSSLTPQTAEALIICAQNWIQSKPLDDMTEEIDGAEEIDEGNILFESLEAQ