CuGenDBv2

Gene ID	Pay0003132
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Nuclear pore complex protein NUP1-like
Genome location	chr03:21639305..21647698
RNA-Seq Expression	Pay0003132
Synteny	Pay0003132
Gene Ontology terms	GO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process) GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process) GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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XP_008456625.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo]

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XP_011656578.1 nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus]

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        IFGFGEK PS+KE +S  PTFAF +K TT TNEQNAIPVVTSE N +PT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+ GS   F SPLVNEKEGA  
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Query:  GGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSVST--STPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVT
        GGSASVFKAE+SSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS G   GTSG+LFSSSVST  STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPS  PTPATTFSNN+T
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Query:  SQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQF
        +QNSSIKPS  AA SNSEPVT+TS P SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSA ALSAPSGVGS+E+KTK ETTFGNLSG+PPSD +AVKV+STGSSVFQF
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Query:  GAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSV
        GAAST SD+NK PANSTF  +N+P FGA  S  SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASN F SG TFGLASSSSS NNSV
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Query:  SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA
        SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFGLSSSS+ASNSAP++FGSSSTG+   SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
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Query:  SMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVP---QNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVK
        +MEDSMAEDTVQT  SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNVP    NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VK
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Query:  VKSKSRKK
        VKSKSRKK
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XP_038884355.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida]

0.0e+00

83.99

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        MATEREEV+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+EME+RNQEEVA
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Query:  ADPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAP
        ADP  TQEGTNV FVPSINS+NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV S+G QEG PKFP QSQDGVSPHM  
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Query:  THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA------------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
        THV    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA            GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
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Query:  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPF
        PSIKNS+ATTDAYRA TSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRRNSVLDD+MGSVGPIRR R KSNHLFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPF
Subjt:  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPF

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        SS GGK LYSSET+RN SK SAES+N M PSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL
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Query:  ENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF
        ENVEGI+SNDACD TS+KNDKFEESSP K  VPNDKSIST +GVGSSVP K+  SGSG QVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Subjt:  ENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF

Query:  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAP
        E +EKV +SLV+VSKP NTEAITV K + SIEAKP  VS MNKINDQGKSDVP TTEKSPIFSFPTTSSPS TANV GPES++RPEK+AS E+PKAAT P
Subjt:  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAP

Query:  IFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANV
        IFGFGEK PS+KE +S  PTFAF +K TT TNEQNAIPVVTSE N +PT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+ GS   F SPLVNEKEGA  
Subjt:  IFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANV

Query:  GGSASVFKAENSSS----SIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSVST--STPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFS
        GGSASVFKAE+SSS    SIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS G   GTSG+LFSSSVST  STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPS  PTPATTFS
Subjt:  GGSASVFKAENSSS----SIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSVST--STPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFS

Query:  NNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSS
        NN+T+QNSSIKPS  AA SNSEPVT+TS P SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSA ALSAPSGVGS+E+KTK ETTFGNLSG+PPSD +AVKV+STGSS
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Query:  VFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSA
        VFQFGAAST SD+NK PANSTF  +N+P FGA  S  SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASN F SG TFGLASSSSS 
Subjt:  VFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSA

Query:  NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANN
        NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFGLSSSS+ASNSAP++FGSSSTG+   SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA N
Subjt:  NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANN

Query:  NEQASMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVP---QNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
        N+QA+MEDSMAEDTVQT  SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNVP    NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR
Subjt:  NEQASMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVP---QNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNR

Query:  KYVKVKSKSRKK
        K+VKVKSKSRKK
Subjt:  KYVKVKSKSRKK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K9E4 Uncharacterized protein

0.0e+00

93.03

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        MATERE+VQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLS LVDPA KLI S+AH LFSTVFRKRLPPPPPSF LSREAN+EMEHRNQEEVA
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Query:  ADPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAP
        ADPSGTQEGTN+GFVPSINS+NTQGLSDLEKIL EKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQVPSTPVTSHG+QEGSPK PTQSQDGVSPHMA 
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Query:  THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA
        THVV ANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIAT DA
Subjt:  THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA

Query:  YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSE
        YR+TT SSSQSAWEQG LLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLF T L LPSSSTSI ASGI SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYS+E
Subjt:  YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSE

Query:  TQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDAC
         QRNFSK +AESKNAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDA 
Subjt:  TQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDAC

Query:  DPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS
        D TSQKNDKFEESSPSK NVPNDKSIST DGVGSSV TKD GSGSGMQVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEM+ KVDDSLVS
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Query:  VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRK
        VSKPKNTE ITV KSK SIEAKP VVSVMNKINDQGKSDVP+TTEKSPIFSFPT SSPS TANVKG ESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+K
Subjt:  VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRK

Query:  ETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
        E  S PPTFAFGSKATTTNEQN I VVTSEAN EPT+ AS PTTFKFGDKASF IPANAATENGNKSAGSLFKF SPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
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Query:  SSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSV--STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA
        SSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSSPGLIFGTSGN FSSSV  STSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVS TPSTLPTPATTFSNNVTSQNSS+KPS  AA
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Query:  TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGP
        TSNSEPV+STSPP SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPS VGSVE KTKPETTFGNLSG P SDT+AVKVASTG+SVFQFGAASTTSDANKGP
Subjt:  TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGP

Query:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW
        ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLA STQSTPALQF SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSA+NSVSSSAGTSSSFFNW
Subjt:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNW

Query:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQT
        QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA  ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDT+QT
Subjt:  QPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQT

Query:  ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
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A0A1S3C4Z3 nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

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        MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVA
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Query:  ADPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAP
        ADPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAP
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Query:  THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA
        THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA
Subjt:  THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA

Query:  YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSE
        YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSE
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Query:  TQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDAC
        TQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDAC
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Query:  DPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS
        DPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS
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Query:  VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRK
        VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+K
Subjt:  VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRK

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        ETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
Subjt:  ETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS

Query:  SSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS--SVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA
        SSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS  S STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA
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Query:  TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGP
        TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGP
Subjt:  TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGP

Query:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQ
        ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQ
Subjt:  ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQ

Query:  PSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA
        PSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA
Subjt:  PSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA

Query:  SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
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A0A5A7SNY9 Nuclear pore complex protein NUP1-like

0.0e+00

99.69

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        MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVA
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        ADPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAP
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        YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSE
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        TQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDAC
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        VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+K
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        ETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSS
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        SSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS  S STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA
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        TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGP
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        ANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQ
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        PSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA
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Query:  SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
        SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
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A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

78.77

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Query:  MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS  KGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  +SREAN+EME +NQEEVA
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        ADP GTQEGTN  FVPSINS+N  G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ +QEGSPKFP  +Q+GV PHM P
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        THV+NANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM             GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
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Query:  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPF
        PSIKNS+ATTD+YRAT +SSSQSAWEQG LL S QGALKRR+SVLDD++GSVGPIRR R KSN LFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPF
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Query:  SSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYL
        SS  GK  YSSET+RN SK SAES+N  TPSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLD LTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL
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Query:  ENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF
        ENVE I+SND  D TS+K DKFE+SS  KS VP+DKSIST  GVGSSVP+KD  S SG+QVSFVGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E +SNGPV+ KSF
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Query:  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAP
        E REKVDDSLV+V KP +TEAITV K + SI+AKPS VS M KINDQ KSDVP TTEKS IFSFPT S  S+TANV  PES+ RPEK+AS E+PKAA AP
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Query:  IFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANV
        IFGFGEK PS+K+ +   PTF FG+K TT TNEQNA+P VTSE N  PT  AS PTTFKFGDKA+F IPA+ ATENGN  AGS FKF S LVNEKEGA  
Subjt:  IFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANV

Query:  GGSASVFKAENSSSSIP----SFGVPKESMSEKAGD-KSSSPGLIFGTSGNLFSSSVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSN
         GSASVFK+E+SSSS      SFGVPKESMSEKAGD KSSS GL  GTSGNL  SSVS STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL S TPST P+P+ TF +
Subjt:  GGSASVFKAENSSSSIP----SFGVPKESMSEKAGD-KSSSPGLIFGTSGNLFSSSVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSN

Query:  NVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT-FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSS
        N+T+QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS   SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPSGVGSVE KTK ETT FGN+SG+ PSDT+A KV STGSS
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Query:  VFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSA
        VFQFGAASTTSD+NK P  STFA  ++P+FGAPV  +SSG+ASSTQSTP   F SSSTSFGLTGNTGLASG+SL GSSAPASN FTSGATFG   SSSSA
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Query:  NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTG-ASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPAN
        NNSVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFGL+SSS+AS+S+PM+FGSS+TG AS  SMFSFTSAA+A  SQPAFG SN+ FTFGSTPPA 
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Query:  NNEQASMEDSMAEDTVQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKS
        NN+ A+MEDSMAEDTVQT    +PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKS
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Query:  NRKYVKVKSKSRKK
        NRK+VKVKSKSRKK
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A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

0.0e+00

79.01

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Query:  MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVA
        MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS  KGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  +SREAN+EME +NQEEVA
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Query:  ADPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAP
        ADP GTQEGTN  FVPSINS+N  G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ +QEGSPKFP  +Q+GV PHM P
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Query:  THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA------------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
        THV+NANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM             GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Subjt:  THVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA------------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT

Query:  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPF
        PSIKNS+ATTD+YRAT +SSSQSAWEQG LL S QGALKRR+SVLDD++GSVGPIRR R KSN LFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPF
Subjt:  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPF

Query:  SSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYL
        SS  GK  YSSET+RN SK SAES+N  TPSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLD LTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL
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Query:  ENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF
        ENVE I+SND  D TS+K DKFE+SS  KS VP+DKSIST  GVGSSVP+KD  S SG+QVSFVGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E +SNGPV+ KSF
Subjt:  ENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF

Query:  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAP
        E REKVDDSLV+V KP +TEAITV K + SI+AKPS VS M KINDQ KSDVP TTEKS IFSFPT S  S+TANV  PES+ RPEK+AS E+PKAA AP
Subjt:  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAP

Query:  IFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANV
        IFGFGEK PS+K+ +   PTF FG+K TT TNEQNA+P VTSE N  PT  AS PTTFKFGDKA+F IPA+ ATENGN  AGS FKF S LVNEKEGA  
Subjt:  IFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANV

Query:  GGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGD-KSSSPGLIFGTSGNLFSSSVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTS
         GSASVFK+E+SSSS  SFGVPKESMSEKAGD KSSS GL  GTSGNL  SSVS STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL S TPST P+P+ TF +N+T+
Subjt:  GGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGD-KSSSPGLIFGTSGNLFSSSVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTS

Query:  QNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT-FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQF
        QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS   SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPSGVGSVE KTK ETT FGN+SG+ PSDT+A KV STGSSVFQF
Subjt:  QNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT-FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQF

Query:  GAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSV
        GAASTTSD+NK P  STFA  ++P+FGAPV  +SSG+ASSTQSTP   F SSSTSFGLTGNTGLASG+SL GSSAPASN FTSGATFG   SSSSANNSV
Subjt:  GAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSV

Query:  SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTG-ASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQ
        SS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFGL+SSS+AS+S+PM+FGSS+TG AS  SMFSFTSAA+A  SQPAFG SN+ FTFGSTPPA NN+ 
Subjt:  SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTG-ASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQ

Query:  ASMEDSMAEDTVQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKY
        A+MEDSMAEDTVQT    +PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+
Subjt:  ASMEDSMAEDTVQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKY

Query:  VKVKSKSRKK
        VKVKSKSRKK
Subjt:  VKVKSKSRKK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q555D2 Nuclear pore complex protein DDB_G0274915

5.9e-05

26.46

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Query:  VPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHA
        +PTT++K  I   P+T++ ++T ++ G                   T+ +F     +PS   T S   +   GS A+T++   A  + ++   T      
Subjt:  VPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHA

Query:  STPTTFKFG----DKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLF
        +TPTT  FG      +S S  ++++T +    + SLF  +S        ++   S+S+F +  S+++  S      + S+   +  ++P L   +SG LF
Subjt:  STPTTFKFG----DKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLF

Query:  SSSVSTSTPTPSLFSFSS--PSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVP
        S++ ++    PS  S S    STN   +  +  + T +T  TP+T+   + T+ ++S   SS+  T    P T      SS  PS        FGS++ P
Subjt:  SSSVSTSTPTPSLFSFSS--PSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVP

Query:  STSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDT-------AAVKVASTGSSVFQFGAA-STTSDANKGPANSTFAQN--NIPAFGAPVSFSSSGLA
        ST     S+ S   S+ + +   TT    +GL  S T       +    A+T  S   FG+  S+T+     P N  F     +   FG     ++S L 
Subjt:  STSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDT-------AAVKVASTGSSVFQFGAA-STTSDANKGPANSTFAQN--NIPAFGAPVSFSSSGLA

Query:  SSTQSTPAL-QFSSSTS----------FGLTGN--TGLASGSSLFGS--SAPASNPFTSGAT------FGLASSSSSANNSVSSSAGTS-SSFFNWQPSS
        +ST +TP+   F SS+S          FG T +  T  A  + LFGS  ++  + PF S ++      FG +SSS+S++ S SS+  T  +  F     S
Subjt:  SSTQSTPAL-QFSSSTS----------FGLTGN--TGLASGSSLFGS--SAPASNPFTSGAT------FGLASSSSSANNSVSSSAGTS-SSFFNWQPSS

Query:  TPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTP--------PANNNEQASMEDSMAED
        T  F +  ++ PS G     +++S+ +  +  +FGSSS+  S   +F  +S+ +++T+ P+ G   +A    S+P        PA +N   S     +  
Subjt:  TPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTP--------PANNNEQASMEDSMAED

Query:  TVQTASPMPS-FGQQPLTPPPSSGFMFG--------STAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGS
        T  +++P  + FG   L+   SS  +FG        +T PS  G++PF    S  + P   SPF A  S
Subjt:  TVQTASPMPS-FGQQPLTPPPSSGFMFG--------STAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGS

Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP1

4.0e-110

36.49

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------AKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRL--------PPPPPSFSLSREANEEMEHRNQE
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+          GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF ++ RKRL         P        R  N+E +  ++E
Subjt:  GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------AKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRL--------PPPPPSFSLSREANEEMEHRNQE

Query:  EVA--ADPSG--TQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDG
        +V+  +  +G    E TN    P        G +DLEKIL+ KTF+R E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E      V  H       +  T   +G
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            +  T   +   LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L + G               P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRGRSA+YSM
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        AR PYSR +++  I            +   +S S WE+    GS+QG    LKRR+SVLD+D+GSVGP+RR RQKSN L    L+LP S + +       
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                       +NGG      E   + SK SAE      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD            KL+S R  SP KLSPSML GP
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        AL+SL+NV++ K+L N+   ++N   D + QK +   ES   +    ++K+    DG   +  +KD    G G+ +       +    K +F+MSAHEDF
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        +++D++ G ++ P  VA+K  +FE+ +        +S P   + +T     PS EA PS   + N    QG S+    TE++   +FP         +S 
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         ++  ++G E    SS +P   EK    E PK  AA  P   F   SP     L+Q    +   K   T   ++     SEA  +PT+   T +    G 
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Query:  KAS-----------FSIPANAAT-ENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASV---FKAENSSSSIPSFGV-----PKESMSEKAGDKSSSPGLIFG
        ++S           FS  ANA T    N S  S   F   + N     +VG   S    F A ++SSSI  FG         S S  A   SS+    FG
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Query:  TSGNLFSS-SVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNN---GSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIF
             FS+ +VS S+   S  +    +T  N +    G + S   ST        + N +        SS+   S   P T+     ++  P  S + IF
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Query:  KFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASS
           SSS P T  S +SA S   +        ++F   S    S       ASTGSSVF F A S+ S      ++ + A N   A  A    + SG  +S
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Query:  TQSTPALQFSSS---TSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGF
        TQS P  QF SS    SFGL+GN+ LAS SS FG S      FTS +T  L+S++SSA++S + S+   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTP+  F
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Query:  SFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA-SPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGSTPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTVQ---TAS
        SFG SS+++ S++   +FG+S+    SP+ +F F S    T  QP FGNS   +   FG++ P             NNN+Q SMEDSMAEDT Q    + 
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Query:  PMPSFGQQPLT-PPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS-QQNVPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
          P FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQFGG    +  QN SPFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)

2.8e-111

36.49

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------AKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRL--------PPPPPSFSLSREANEEMEHRNQE
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+          GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF ++ RKRL         P        R  N+E +  ++E
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Query:  EVA--ADPSG--TQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQEGSPKFPTQSQDG
        +V+  +  +G    E TN    P        G +DLEKIL+ KTF+R E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E      V  H       +  T   +G
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Query:  VSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP--LSMAGN--------------PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSM
            +  T   +   LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L + G               P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRGRSA+YSM
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Query:  ARVPYSRVRATPSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQG---ALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRS
        AR PYSR +++  I            +   +S S WE+    GS+QG    LKRR+SVLD+D+GSVGP+RR RQKSN L    L+LP S + +       
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Query:  ETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGP
                       +NGG      E   + SK SAE      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD            KL+S R  SP KLSPSML GP
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Query:  ALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIG-SGSGMQVSFVGPSVQ---TKCAFQMSAHEDF
        AL+SL+NV++ K+L N+   ++N   D + QK +   ES   +    ++K+    DG   +  +KD    G G+ +       +    K +F+MSAHEDF
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        +++D++ G ++ P  VA+K  +FE+ +        +S P   + +T     PS EA PS   + N    QG S+    TE++   +FP         +S 
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Query:  SSTANVKGPE----SSLRP---EKVASPELPK--AATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGD
         ++  ++G E    SS +P   EK    E PK  AA  P   F   SP     L+Q    +   K   T   ++     SEA  +PT+   T +    G 
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Query:  KAS-----------FSIPANAAT-ENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASV---FKAENSSSSIPSFGV-----PKESMSEKAGDKSSSPGLIFG
        ++S           FS  ANA T    N S  S   F   + N     +VG   S    F A ++SSSI  FG         S S  A   SS+    FG
Subjt:  KAS-----------FSIPANAAT-ENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASV---FKAENSSSSIPSFGV-----PKESMSEKAGDKSSSPGLIFG

Query:  TSGNLFSS-SVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNN---GSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIF
             FS+ +VS S+   S  +    +T  N +    G + S   ST        + N +        SS+   S   P T+     ++  P  S + IF
Subjt:  TSGNLFSS-SVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNN---GSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIF

Query:  KFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASS
           SSS P T  S +SA S   +        ++F   S    S       ASTGSSVF F A S+ S      ++ + A N   A  A    + SG  +S
Subjt:  KFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASS

Query:  TQSTPALQFSSS---TSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGF
        TQS P  QF SS    SFGL+GN+ LAS SS FG S      FTS +T  L+S++SSA++S + S+   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTP+  F
Subjt:  TQSTPALQFSSS---TSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGF

Query:  SFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA-SPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGSTPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTVQ---TAS
        SFG SS+++ S++   +FG+S+    SP+ +F F S    T  QP FGNS   +   FG++ P             NNN+Q SMEDSMAEDT Q    + 
Subjt:  SFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA-SPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGSTPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTVQ---TAS

Query:  PMPSFGQQPLT-PPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS-QQNVPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGA-GGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
          P FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQFGG    +  QN SPFQAS SL+F    GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
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AT5G20200.1 nucleoporin-related

1.3e-15

24.84

Show/hide

Query:  GGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHR-----------------
        GG GGK +++  RR   TPY RP         + W+S++VDPA ++I+  A R+    F      P    +L+    ++ +H+                 
Subjt:  GGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHR-----------------

Query:  -NQEEVAA----DPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSD------LEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ-EG
         N+ E A+     PSGT       F  S        L+D      LE++++ KTFS+ EIDRL E++ SR  D+P      +  ++P        +    
Subjt:  -NQEEVAA----DPSGTQEGTNVGFVPSINSSNTQGLSD------LEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ-EG

Query:  SPKFPTQSQDGVSPHMA-PTHVVNANVLDEDV------ASPAEIAKAYMGSRPPKAT-------------PLSMAGNPSKSSTLSLVPRS--PGNFDVVE
          K P   +D  S   A PT +  + +LD D        SPAE+AKAYMG +   ++               SM    S  ++ S  P +  PG     +
Subjt:  SPKFPTQSQDGVSPHMA-PTHVVNANVLDEDV------ASPAEIAKAYMGSRPPKAT-------------PLSMAGNPSKSSTLSLVPRS--PGNFDVVE

Query:  NGFVTPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIA---TTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPT
        +GF TP+SR  S  L +  R PYSR   + S    +     +  + +   S SQS   + G L   +            D G  GP RRTRQ +     +
Subjt:  NGFVTPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIA---TTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPT

Query:  GLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQ-RNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLD---ILTPPKEKSSE
          S PS   S      R E +  ++       SS  G+  Y S +Q   + K        +T       +P  SS++A  IL+ L+     + PK K++E
Subjt:  GLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQ-RNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLD---ILTPPKEKSSE

Query:  LKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPN--DKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVS
        LKL +   + P            + +++   SAK  E+++ I S       +Q +   +  + +  ++ N  +K+ S ++G+         G G+ +Q  
Subjt:  LKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPN--DKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVS

Query:  FVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIE-AKPSVVSVMNKINDQG------KSDVPTT
        F  P    K +   S H      DE G S+    D +  +         ++ KP +          PSI  AKP     +   ++ G       SD  T+
Subjt:  FVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIE-AKPSVVSVMNKINDQG------KSDVPTT

Query:  TEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSP-------SRKETLSQPPTFAFGSKATTTNEQ
        +E +     P T+SP   A+  G   +   E     E+P+ +       G+KSP         +E +S+     FG K T  +E+
Subjt:  TEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSP-------SRKETLSQPPTFAFGSKATTTNEQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCAATATGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGGCCTATTAGAAGGTCTCATACCACGCCCTATGATCGGCCGCCGACTGC
TCTTAGGAACTCTGCTGCTAAAGGATGGCTTTCTAAGCTTGTCGATCCTGCGCAGAAGCTAATTACTTCCAGCGCCCATAGGCTTTTTTCTACTGTCTTTCGTAAACGCC
TTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTTTCACTTTCTCGAGAGGCTAATGAAGAGATGGAACATAGGAATCAGGAAGAAGTTGCAGCTGATCCGTCTGGAACTCAAGAAGGGACT
AATGTCGGTTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAGTAACACCCAAGGGTTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTTCTAGATTTGAGATTGATCGCTTGAC
TGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGACGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGGTCCCTTCAACCCCTGTTACCAGTCATGGATTGCAGGAAGGATCTC
CAAAATTTCCAACTCAGAGTCAGGATGGAGTTAGCCCGCATATGGCTCCAACTCATGTTGTGAATGCAAATGTCCTCGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCTGAGATTGCA
AAAGCATACATGGGCAGCAGACCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCAGGCAATCCTTCGAAATCCTCTACCTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTGA
TGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACGCCGAGATCTCGTGGTAGATCTGCCCTATACAGCATGGCTCGAGTTCCATATTCCAGAGTTCGTGCAACCCCCAGCATAAAGAATA
GTATAGCCACAACAGATGCTTACAGGGCCACAACATCCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGAGCAAGGGGGACTTTTGGGGTCTAAACAAGGAGCTTTGAAACGCCGAAAC
TCAGTTTTAGATGATGATATGGGATCTGTTGGTCCTATCCGAAGAACTCGTCAGAAATCCAATCACCTATTCCCAACAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTAT
TCCAGCAAGTGGCATTCGTTCGGAGACTGCTCGGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTAATGGTGGGAAGCCACTTTATTCAAGTGAGACACAGCGTA
ATTTCTCCAAAACGTCTGCAGAGTCCAAAAATGCTATGACACCTAGTTCAAGTTTTCCTCGAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTT
GATATATTGACCCCTCCAAAGGAAAAATCTTCGGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGGAATAACTCACCCATGAAGTTATCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAG
GAGCCTGGAAAATGTGGATTCAGCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGGCATTCAGTCTAACGATGCCTGTGATCCTACTTCTCAAAAGAATGATAAGTTCGAGGAAAGTA
GTCCGTCAAAATCTAATGTACCCAATGATAAATCTATTTCTACCAGTGATGGTGTAGGTTCTTCTGTTCCTACTAAGGATATCGGATCTGGTTCTGGTATGCAAGTTTCA
TTTGTTGGTCCTTCCGTACAAACAAAATGTGCCTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATGGATGAAGAAGGATTTTCTAATGGACCAGTAGCTGATAAATC
GTTTGAGATGCGAGAAAAAGTTGATGACTCATTAGTGTCTGTGAGTAAGCCGAAGAATACTGAAGCCATTACAGTAGTTAAATCGAAGCCTTCAATTGAGGCTAAACCAT
CTGTGGTATCTGTAATGAACAAAATAAATGACCAAGGAAAATCTGATGTTCCCACGACTACTGAAAAGAGTCCCATTTTTTCCTTTCCAACAACATCTTCACCTAGCAGT
ACAGCCAACGTGAAGGGTCCTGAATCAAGCTTGAGACCTGAAAAAGTTGCTTCACCCGAGTTACCAAAAGCAGCCACTGCCCCTATTTTTGGCTTTGGAGAAAAGTCGCC
TTCACGGAAGGAAACATTGTCTCAACCCCCCACCTTTGCCTTTGGAAGCAAGGCTACCACAACGAATGAACAAAATGCTATTCCTGTTGTAACTTCAGAAGCCAACACCG
AACCAACTAAACATGCTTCTACTCCTACCACCTTTAAATTTGGAGACAAAGCTTCGTTTTCTATTCCAGCAAATGCCGCTACAGAAAATGGAAATAAGAGTGCGGGGTCT
CTATTTAAGTTCACATCACCTTTGGTTAACGAAAAAGAAGGTGCTAATGTTGGCGGTAGTGCTTCAGTTTTTAAAGCAGAGAATTCTAGCAGCAGCATACCATCATTTGG
AGTTCCAAAAGAGTCCATGTCAGAGAAAGCTGGTGATAAGAGTTCAAGTCCTGGTCTTATATTTGGTACATCTGGGAATTTGTTTTCGTCATCTGTCTCAACATCAACAC
CAACTCCGAGTTTGTTTTCTTTTAGCTCCCCTAGCACTAATTCAAATCTCAACAACGGATCTCTTGTTTCTATTACTCCATCTACGTTGCCAACTCCAGCCACCACCTTT
TCTAATAATGTAACAAGTCAGAATTCATCCATCAAACCTTCTTCCATTGCTGCCACTAGCAACAGTGAACCTGTCACTTCTACGAGTCCTCCTATGTCCTCTCCTATGCC
ATCCTTTTCAGCTGCACCAATTTTTAAATTTGGAAGCTCTAGTGTTCCATCTACTTCTGCTTCAGCTCTATCAGCACCAAGTGGAGTTGGATCCGTAGAAGCCAAGACCA
AGCCAGAGACAACCTTCGGCAATTTAAGTGGCCTTCCTCCAAGTGACACAGCTGCCGTTAAAGTTGCTAGTACTGGAAGCAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCATCTACT
ACTTCAGATGCCAATAAAGGACCAGCAAATTCAACTTTTGCTCAAAACAACATTCCTGCATTTGGTGCTCCGGTTTCATTTTCTAGTAGCGGGCTTGCATCATCTACTCA
GAGTACACCTGCTTTGCAATTCAGTTCATCTACGTCATTTGGTTTGACTGGGAATACGGGTTTGGCATCTGGCAGTTCTCTATTTGGTTCTTCAGCTCCAGCATCTAATC
CGTTCACTTCCGGTGCTACTTTTGGGCTTGCTTCCTCCAGTTCTTCTGCTAACAATTCTGTCAGCTCCAGTGCTGGTACTAGTTCTAGCTTCTTTAACTGGCAGCCTTCC
TCAACACCATCGTTTTCTACTGGCTTCAGCTCAACTCCAAGCGGAGGATTCTCATTTGGTCTTTCGTCATCATCTTCTGCTTCTAATAGTGCTCCTATGGTCTTTGGATC
ATCATCAACCGGTGCATCGCCAGCCTCTATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCAAGTGCGACGACGTCACAACCTGCTTTTGGTAATTCTAATAATGCCTTCACTTTTGGTT
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CCACCTCCATCGTCAGGGTTTATGTTCGGTTCAACAGCTCCATCTCCGCTAGGAGCAAATCCTTTTCAATTCGGTGGTAGCCAGCAAAATGTACCACAGAATCCCTCCCC
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Pay0003132 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome