| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0039788.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like [Cucumis melo var. makuwa] | 9.4e-184 | 98.9 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKN
GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKN
Subjt: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEER
VGDEKPIQENDTSGANTD+PAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEER
Subjt: VGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEER
Query: TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN+AAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| KAG7011066.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein B [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 6.0e-162 | 88.09 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KKG AQTKP+ S +QQNKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRD ANSEN +APEDG GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE+KREG+GRGNWGR DEFAEVAEE VNE EKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
GDEKP+QE DTSG N +NPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+L+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGY GSS+SN+AAPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| XP_004140509.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A [Cucumis sativus] | 8.6e-177 | 94.74 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVA ETVNETEKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
GDEKPIQE+DTSG NT+NPAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEERT
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPA+GERHY PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSN+AAPSI DPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| XP_008459799.1 PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like [Cucumis melo] | 3.8e-185 | 99.17 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
GDEKPIQENDTSGANTD+PAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN+AAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| XP_038874269.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like [Benincasa hispida] | 7.8e-162 | 89.2 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAA A AP SKKGPAQTKP+ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRD AN+E+ NAPEDG GGKT ERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE A+GERPRRAFERHSGTGRGNEFKREG+GRGNWGRSTDEFAEV EE VNETEKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
GDEKPIQE+DTSG NT+NPAKEPEE PEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNN+IFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPAEGERHY PGGRGRGRGRG RGGYSGSSMSN+AAPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K9Z4 HABP4_PAI-RBP1 domain-containing protein | 4.1e-177 | 94.74 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVA ETVNETEKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
GDEKPIQE+DTSG NT+NPAKEP+ETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEERT
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPA+GERHY PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSN+AAPSI DPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A1S3CBH1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like | 1.9e-185 | 99.17 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
GDEKPIQENDTSGANTD+PAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN+AAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A5A7TA33 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like | 4.6e-184 | 98.9 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKN
GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKN
Subjt: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEER
VGDEKPIQENDTSGANTD+PAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEER
Subjt: VGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEER
Query: TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN+AAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A6J1EYL1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X2 | 8.4e-162 | 88.09 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KKG AQTKP+ S +QQNKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRD ANSEN +APEDG GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE KREG+GRGNWGR DEFAEVAEE VNE EKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
GDEKP+QE DTSG N++NPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+L+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERT
Query: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGY GSS+SN+AAPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: KKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| A0A6J1F3H7 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X1 | 2.1e-160 | 87.85 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KKG AQTKP+ S +QQNKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
FNRD ANSEN +APEDG GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE KREG+GRGNWGR DEFAEVAEE VNE EKNV
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNV
Query: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL-GSEKDKRKEIADKEER
GDEKP+QE DTSG N++NPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRK+L+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKL GSEKDKRKEIADKEER
Subjt: GDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL-GSEKDKRKEIADKEER
Query: TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGY GSS+SN+AAPSIEDPGQFPTLGAK
Subjt: TKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23523 RGG repeats nuclear RNA binding protein A | 7.0e-73 | 55.38 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLL DDDAEDPSQL AVA + K K Q LP+ LPSKPLPPAQAVRE+R++ RG GGGRG G+ RGR G
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
G+NRD N S P E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ E +GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E
Subjt: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
Query: FAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
A E ETEK+VG EKP ++ + AN ++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LE+K+K+L +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKL
Subjt: FAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NIAAPSIEDPGQFPTLGAK
GS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S N AAP+I D QFP+LG K
Subjt: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| O23593 RGG repeats nuclear RNA binding protein B | 2.0e-64 | 49.22 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA++NPFDLL DDDAEDPSQ++A+K PL P QT K +P+KP PP+QAVRE+RN G GRG GRG YGRG GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEET
NRDS N++ A E+G GG ++ E G GGP G RG RRG + N G++ + ERPR+ ++RHS T GNE KR+G+GR NWG + D+ V EE+
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEET
Query: VNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
+KN+ EK E + + A + PA++ EE +PEDKEMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F +MQQLSSKK NND +FIKLG+EKDKR
Subjt: VNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
Query: EIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
I ++EE+T+KSLSINEFL+PA+G+ +Y P GGR GR G R G + + P+I D QFPTLG
Subjt: EIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
|
|
| Q9LVT8 RGG repeats nuclear RNA binding protein C | 1.4e-57 | 49.47 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA+LNPFDLLG DDAEDPSQL AVA + +K A +P K A P+KP PP+QAVRESRN +GGRG GGRG G+ RGR GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
+NRD+ N++ N N G + + G GG R GG RRGG +GE+ + ERP R ++RHS TG G KR G GRGNWG + D+
Subjt: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
Query: VAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
+EE E EK+ EK E++T A + A+E + E E+ +EMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F SMQQLS+KK+ + +IFIKL
Subjt: VAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
GS+K+KRK D E+ KKSLSINEFL+PA+G+R+ GG RGR GRG RG G + AAP+I D QFP+LG
Subjt: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
|
|
| Q9SQ56 RGG repeats nuclear RNA binding protein A (Fragment) | 2.3e-68 | 59.87 | Show/hide |
Query: GGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSANSEN-----------INAPEDGVGGKTTERR-GYGGPRG--RGGRRGGFNDGENA--EGERPRRAFERHSG
GGRG RGGGRG G GRGR GFN++SA+ EN EDG GK +ERR GYGGPRG GGRRGGFN+G+ A EGERPRR F+R SG
Subjt: GGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSANSEN-----------INAPEDGVGGKTTERR-GYGGPRG--RGGRRGGFNDGENA--EGERPRRAFERHSG
Query: TGRGNEF-KREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVD
TGRGNE+ KREGSGRGNWG D+ A+ E VN+ EK V EK + + N D+ A EPEE EPE+KEMTLEEYEKL+E+KRK+LLALK EERKV+
Subjt: TGRGNEF-KREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVD
Query: -PKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN--IAAPSIEDPGQFPT
KE SMQ LS+KK++++IFIKLGSEK+KRKE +K +T+ SINEFL+PAEGE + GGRGRG GRG RGG+ G N +APSIED GQFP+
Subjt: -PKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN--IAAPSIEDPGQFPT
Query: LGAK
L AK
Subjt: LGAK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G16830.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 5.0e-74 | 55.38 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLL DDDAEDPSQL AVA + K K Q LP+ LPSKPLPPAQAVRE+R++ RG GGGRG G+ RGR G
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
G+NRD N S P E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ E +GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E
Subjt: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDE
Query: FAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
A E ETEK+VG EKP ++ + AN ++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LE+K+K+L +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKL
Subjt: FAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NIAAPSIEDPGQFPTLGAK
GS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S N AAP+I D QFP+LG K
Subjt: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NIAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G16830.2 Hyaluronan / mRNA binding family | 8.3e-53 | 59.63 | Show/hide |
Query: EGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKR
+GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E A E ETEK+VG EKP ++ + AN ++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LE+K+
Subjt: EGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKR
Query: KSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---N
K+L +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKLGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S N
Subjt: KSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---N
Query: IAAPSIEDPGQFPTLGAK
AAP+I D QFP+LG K
Subjt: IAAPSIEDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G16830.3 Hyaluronan / mRNA binding family | 5.4e-60 | 54.95 | Show/hide |
Query: VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERP
VRE+R++ RG GGGRG G+ RGR GG+NRD N S P E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ E +GERP
Subjt: VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERP
Query: RRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLA
RRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNWG +E A E ETEK+VG EKP ++ + AN ++ EE EPEDKEMTL+EYEK+LE+K+K+L +
Subjt: RRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEETVN-ETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLA
Query: LKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NIAAPS
L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKLGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S N AAP+
Subjt: LKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NIAAPS
Query: IEDPGQFPTLGAK
I D QFP+LG K
Subjt: IEDPGQFPTLGAK
|
|
| AT4G17520.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 1.5e-65 | 49.22 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA++NPFDLL DDDAEDPSQ++A+K PL P QT K +P+KP PP+QAVRE+RN G GRG GRG YGRG GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEET
NRDS N++ A E+G GG ++ E G GGP G RG RRG + N G++ + ERPR+ ++RHS T GNE KR+G+GR NWG + D+ V EE+
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAEVAEET
Query: VNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
+KN+ EK E + + A + PA++ EE +PEDKEMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F +MQQLSSKK NND +FIKLG+EKDKR
Subjt: VNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPEDKEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKDKRK
Query: EIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
I ++EE+T+KSLSINEFL+PA+G+ +Y P GGR GR G R G + + P+I D QFPTLG
Subjt: EIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
|
|
| AT5G47210.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 1.0e-58 | 49.47 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA+LNPFDLLG DDAEDPSQL AVA + +K A +P K A P+KP PP+QAVRESRN +GGRG GGRG G+ RGR GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
+NRD+ N++ N N G + + G GG R GG RRGG +GE+ + ERP R ++RHS TG G KR G GRGNWG + D+
Subjt: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWGRSTDEFAE
Query: VAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
+EE E EK+ EK E++T A + A+E + E E+ +EMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F SMQQLS+KK+ + +IFIKL
Subjt: VAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGANTDNPAKEPEETEPED---KEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIKL
Query: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
GS+K+KRK D E+ KKSLSINEFL+PA+G+R+ GG RGR GRG RG G + AAP+I D QFP+LG
Subjt: GSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNIAAPSIEDPGQFPTLG
|
|
