CuGenDBv2

Gene ID	Pay0004174
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr08:28603034..28609049
RNA-Seq Expression	Pay0004174
Synteny	Pay0004174
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAA0047278.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold908G00710 [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_011657645.1 uncharacterized protein LOC101220918 [Cucumis sativus]

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XP_038880947.1 uncharacterized protein LOC120072617 isoform X1 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KF21 Uncharacterized protein

2.2e-155

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A0A1S3BLN6 uncharacterized protein LOC103491201

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A0A5A7TWJ8 Uncharacterized protein

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A0A6J1E431 uncharacterized protein LOC111429751

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         VSLS
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A0A6J1JD30 uncharacterized protein LOC111485701

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81.31

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        HVSLS
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G07950.1 unknown protein

1.4e-77

53.77

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        M    F  P S      S S+++   SP    S  RLWRPAAQRN+RNQWS L++ +QQW  + S+GRSHAT +VN+YLS+KYMP MELG L DM DI  
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Query:  KACLKLSKQQELYRSKLLSSYKEMVDVVVQMVNTSRRMKCYFKRSSNSALIEFSTSSEDNHNEDAGDGGGISVFTLLTIPCFEKLAEELIHMFELELNLK
        KA  KL  QQ  YR KLLSSYKEMV VVV+MVN SR ++CY K S+ S LI+FS + ED++  DAGD GGI VF    +  FEK+AEEL+ MF+ E+ LK
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Query:  RLLLMELLSLSSE-SSPKSLVWSEELYSGEFNNLRSCNLWSKETDELLHPTLKGHQSNAPIVSRNQLPNAEVLQVYLVTWLAEVNIHTKRVDEIFELVSQ
        RLL+MEL+SLS+E   P +  WS+ELY GEF++L  C+L+S E  + + P +K +   +  +S    P AE+LQ+YL TWLAEVNI T RVDEI  LV +
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Query:  EIHVS
        EI V+
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGACACACAATATTTCTCTACGCCTCCCTCTAAAGGAACTAATTTAAAATCTGGAAGCATTTCAACACCAGGCTCATCGCCTTTGCTTCCATCCATTACAAGGCTATG
GAGGCCAGCAGCACAAAGGAACATTAGGAATCAATGGTCTAAGCTGGCTTCACTCAAACAACAATGGGCTTCTTCTTCTTCAAGCGGGAGATCTCATGCTACCTCCATTG
TCAATGCCTATTTATCTGAAAAGTACATGCCTTCTATGGAGCTGGGCTCTCTCTGTGATATGATTGATATACGAAACAAAGCATGTTTGAAATTGTCTAAGCAGCAGGAA
CTCTATCGAAGTAAACTCTTATCATCGTACAAGGAAATGGTTGATGTTGTAGTTCAAATGGTCAACACTAGCAGACGTATGAAGTGTTATTTCAAGAGATCAAGTAATAG
TGCACTCATAGAATTTTCTACTAGCTCTGAGGACAATCACAACGAAGATGCTGGAGATGGTGGTGGCATCTCAGTGTTTACATTATTGACAATCCCTTGCTTTGAGAAAT
TGGCAGAGGAGCTTATTCATATGTTTGAGTTGGAGCTAAATCTGAAGCGGCTACTTTTGATGGAACTACTTTCTCTTAGTTCTGAATCCTCACCAAAAAGCTTGGTCTGG
TCGGAAGAGCTTTACTCAGGGGAATTCAACAACTTGCGTTCGTGTAACCTGTGGTCCAAGGAAACCGATGAGTTGCTCCATCCGACCTTGAAAGGTCATCAATCCAATGC
ACCTATTGTCAGTCGTAACCAACTCCCAAATGCAGAAGTTTTGCAGGTTTATCTTGTCACGTGGCTTGCAGAAGTAAACATACACACAAAAAGAGTAGATGAAATATTTG
AACTAGTTAGTCAGGAGATTCATGTCAGCCTATCCTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAAAAGAAGAAAAATTATAAAAAAATCGATTGGAAAAAAAAAAGGAAAACGAAAAGATGGAAAAAAATAAACAGAAAAGAAAAAGAGGAAAGAATAGACGAAATTGAGGA
GGAAAACAAATGGGTGTGAAGAAAAAATGGTGGATGGACAAATGTGTAATATTTATATACTTATTAATTTGGGAAATACTTAATAGAAAAGAGTTCAAGTTCACGGCGAC
TGTATCATCTCTCTAACTCACCCTCTCGTTTCCGCCTCTTATCTCACGGCCGTTGCCGGCGTTCAATCGTCTCTCCTTCCCAGTCTCCGGCGTTCACATCCGATCGTCTC
TCCTTGTCAGAAGTCTCCGATCGTCGCTCCTGTTCGGCTCTCCCTCACCGTTGCGTTGCGTTGTTGTGTTGCCAACGGCTACGATATACTTTGTTGTGTACAACTTATTC
TCAAGCACCAACGTTTACACGCCGTTGCCGTTGACTACTCTGCCACTGCCACCGTCTCCGTCCGCTTCTTGCGCCGTTGCTGCAGCGAAGAAGGAACTATTCATCACAAC
AACTGCAAAGAACCAACCATCTTGTGGGTTTTGTTTGAGGTCCTTGGAATTGTGGCTTCTTTTGTTGCTTCGGCTCTGGCATCACGGGGACTTATGCCCTCAACTCCATG
GACACACAATATTTCTCTACGCCTCCCTCTAAAGGAACTAATTTAAAATCTGGAAGCATTTCAACACCAGGCTCATCGCCTTTGCTTCCATCCATTACAAGGCTATGGAG
GCCAGCAGCACAAAGGAACATTAGGAATCAATGGTCTAAGCTGGCTTCACTCAAACAACAATGGGCTTCTTCTTCTTCAAGCGGGAGATCTCATGCTACCTCCATTGTCA
ATGCCTATTTATCTGAAAAGTACATGCCTTCTATGGAGCTGGGCTCTCTCTGTGATATGATTGATATACGAAACAAAGCATGTTTGAAATTGTCTAAGCAGCAGGAACTC
TATCGAAGTAAACTCTTATCATCGTACAAGGAAATGGTTGATGTTGTAGTTCAAATGGTCAACACTAGCAGACGTATGAAGTGTTATTTCAAGAGATCAAGTAATAGTGC
ACTCATAGAATTTTCTACTAGCTCTGAGGACAATCACAACGAAGATGCTGGAGATGGTGGTGGCATCTCAGTGTTTACATTATTGACAATCCCTTGCTTTGAGAAATTGG
CAGAGGAGCTTATTCATATGTTTGAGTTGGAGCTAAATCTGAAGCGGCTACTTTTGATGGAACTACTTTCTCTTAGTTCTGAATCCTCACCAAAAAGCTTGGTCTGGTCG
GAAGAGCTTTACTCAGGGGAATTCAACAACTTGCGTTCGTGTAACCTGTGGTCCAAGGAAACCGATGAGTTGCTCCATCCGACCTTGAAAGGTCATCAATCCAATGCACC
TATTGTCAGTCGTAACCAACTCCCAAATGCAGAAGTTTTGCAGGTTTATCTTGTCACGTGGCTTGCAGAAGTAAACATACACACAAAAAGAGTAGATGAAATATTTGAAC
TAGTTAGTCAGGAGATTCATGTCAGCCTATCCTAGGACAATATTATAGGAATGCTCTTCCTCATGATACTGAAGCTATGGAGCTTTGTAATTCTTCATCGTGGATTGATC
AGCATTGGCGCCCCCATACAGAAACAGAAGACGGTTTGTGAGAATTCTGAATCAAACTCTCAGCACAGATTATGGGAGAATTGTTGTTTATGCCAGGGATCAACAAACAA
TTTATGCATAAGTTGGTGCTCGTTTTTCTGGGCCAGTTTGGAATTCGATTTTTCAAGATTTTTCACTTAAAAAACACTTTTTCAAGCACTTAAAAAGTTGTTCAAAACAG
GCTCTTCTTAAGCATTTATCGATAATCCAGCTTAAAATGTTATTTGATTAGTTAAGATTTAGAATGGCTAATGAAAAGCTTTATCATCCAATTGCTGGAAAATGATTTCT
TTCTATTTATTGTATATTTTATTTGCGCATTAGGTAACTAAACTGGAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDTQYFSTPPSKGTNLKSGSISTPGSSPLLPSITRLWRPAAQRNIRNQWSKLASLKQQWASSSSSGRSHATSIVNAYLSEKYMPSMELGSLCDMIDIRNKACLKLSKQQE
LYRSKLLSSYKEMVDVVVQMVNTSRRMKCYFKRSSNSALIEFSTSSEDNHNEDAGDGGGISVFTLLTIPCFEKLAEELIHMFELELNLKRLLLMELLSLSSESSPKSLVW
SEELYSGEFNNLRSCNLWSKETDELLHPTLKGHQSNAPIVSRNQLPNAEVLQVYLVTWLAEVNIHTKRVDEIFELVSQEIHVSLS

Pay0004174 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome