; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0004183 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0004183
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptiontetrapyrrole-binding protein, chloroplastic
Genome locationchr03:11727919..11729149
RNA-Seq ExpressionPay0004183
SyntenyPay0004183
Gene Ontology termsGO:0010019 - chloroplast-nucleus signaling pathway (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0046906 - tetrapyrrole binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008629 - GUN4-like
IPR037215 - GUN4-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140886.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis sativus]4.6e-12493.85Show/hide
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XP_008445737.1 PREDICTED: tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Cucumis melo]2.2e-134100Show/hide
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XP_022953248.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]6.6e-10781.71Show/hide
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XP_023547651.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-10781.54Show/hide
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XP_038884158.1 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic [Benincasa hispida]1.9e-12291.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD2 GUN4 domain-containing protein2.2e-12493.85Show/hide
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A0A1S3BE43 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic1.1e-134100Show/hide
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A0A5A7SPC7 Tetrapyrrole-binding protein1.1e-134100Show/hide
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A0A6J1GMW2 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like3.2e-10781.71Show/hide
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A0A6J1JPI7 tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic-like1.2e-10680.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O19887 Uncharacterized protein ycf534.4e-2134.51Show/hide
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        ++ L+ LL+A +F +A++ T+++L+ LAG+ + +R ++YF++V  I  + +  ++ LW+ +S G FG+S+QKRI+  VNK++ K + K+GW+        
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           +  +P EF+W +    P GHLPL N LRG  ++  I ++
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P51202 Uncharacterized protein ycf534.0e-2237.5Show/hide
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        ++  + + +L  LL   +   AD+ T++ LI LAG     R ++YF++++ I  EDL+ ID LW  HS GKFG+ VQ++I+  + K++ + + K+GW   
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           EI +   R +P EF W  T   P+GHLPL N LRG Q++S + +H A++
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P72583 Ycf53-like protein4.3e-2439.75Show/hide
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        G F L S  +  I +  L   L ++DF  ADE TR  L  LAG GA +R ++YF+EV+   A DL  I+ LW  HS+G FG+SVQ+R++    K+FTKL+
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Query:  MKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGTQLMSNILNHPAFEE
         K+GW            +  +P  F W+L+   P+GHLPL N LRG ++  ++  HP + +
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Q1XDT5 Uncharacterized protein ycf532.3e-2540.79Show/hide
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        ++  +++ +L  LL  +D  KAD+ T++ LI LAG  A  R ++YF++++ I A+DL+ ID LW  HS GKFG  VQ++I+  V KD+ K + K+GW   
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Query:  LDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRGTQLMSNILNHPAFE
           E+++   R +P EF W      P GHLPL N LRG Q++S +  H A+E
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Q9LX31 Tetrapyrrole-binding protein, chloroplastic6.1e-5550Show/hide
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        PS  H HR NL   S    ++L LK  ++AA        ++T+++T+++SA +  + S ++  ++ I FD L+  L  ++FR+ADEETRRLLI ++G+ A
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Query:  LKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRG
        +KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPLTNALRG
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        TQL+  +L+HPAF   A +  GE +   +    + K    +   +R+FK +YSF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G59400.1 enzyme binding;tetrapyrrole binding4.4e-5650Show/hide
Query:  PSLRHPHRPNLSPTSFSSSSTLFLKPASTAAV------TTTTTAATSSLSAAAAGSFSLSSDTSSAISFDELDRLLAAKDFRKADEETRRLLIALAGDGA
        PS  H HR NL   S    ++L LK  ++AA        ++T+++T+++SA +  + S ++  ++ I FD L+  L  ++FR+ADEETRRLLI ++G+ A
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Query:  LKRGYVYFSEVQFIAAEDLKAIDDLWQKHSDGKFGYSVQKRIFEKVNKDFTKLFMKLGWMKKLDTEIEQYNYRAFPTEFIWELTEETPEGHLPLTNALRG
        +KRGYV+FSEV+ I+ EDL+AID+LW KHSDG+FGYSVQ++I+ KV KDFT+ F+K+ WMK LDTE+ QYNYRAFP EF WEL +ETP GHLPLTNALRG
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Query:  TQLMSNILNHPAFEEDAIEEKGEEKIAGDENGGLKKGLKSI--TERLFKRDYSF
        TQL+  +L+HPAF   A +  GE +   +    + K    +   +R+FK +YSF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGCCCCTCTCTCCGCCACCCTCACCGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCCACTCTCTTCCTCAAACC
AGCTTCCACCGCCGCCGTCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACACCTCCTCCGCCATCTCTT
TCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGCCGCCAAAGACTTCCGGAAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTTGCCGGCGACGGCGCCCTGAAAAGAGGGTAC
GTCTATTTCTCTGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATTTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTACAGCGTACAGAAACGGAT
TTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTATGAAACTTGGGTGGATGAAGAAGCTGGATACTGAAATTGAGCAGTACAATTACAGAGCATTTCCGACGGAGT
TTATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCGGAAGGGCATCTGCCATTGACTAATGCTTTGAGAGGGACACAGTTAATGAGCAATATTTTGAACCATCCGGCGTTTGAGGAG
GACGCCATTGAAGAGAAAGGTGAAGAAAAAATTGCAGGGGATGAAAATGGAGGATTGAAGAAAGGATTGAAATCGATTACTGAGAGGCTTTTCAAAAGGGATTATAGCTT
TTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTCACTTCCACTCATTCCTTATCTCTCAATCAAAATTCTCTCAAAACCCCAAAACCCCTCTTTTTCACATTTTCAATTTTCATTAACTTTCTCTCTCTCTCTCTCCCT
CTCCCTCTCCCTCTCTCATGGCAGCTTCCCACTCTCTCCCATCTCTCCGCCCCTCTCTCCGCCACCCTCACCGCCCTAACCTCTCTCCCACCTCCTTCTCCTCTTCCTCC
ACTCTCTTCCTCAAACCAGCTTCCACCGCCGCCGTCACCACCACCACTACCGCCGCCACTTCCTCTCTCTCCGCCGCAGCTGCCGGCTCCTTCTCTCTCTCCTCAGACAC
CTCCTCCGCCATCTCTTTCGACGAGCTCGACCGCCTCCTAGCCGCCAAAGACTTCCGGAAAGCCGACGAGGAGACCCGCCGGCTTCTGATCGCCCTTGCCGGCGACGGCG
CCCTGAAAAGAGGGTACGTCTATTTCTCTGAAGTTCAATTCATTGCCGCCGAGGATCTGAAAGCCATTGACGATTTGTGGCAGAAACACAGCGATGGGAAATTTGGGTAC
AGCGTACAGAAACGGATTTTCGAGAAAGTGAACAAAGATTTCACGAAATTGTTTATGAAACTTGGGTGGATGAAGAAGCTGGATACTGAAATTGAGCAGTACAATTACAG
AGCATTTCCGACGGAGTTTATTTGGGAGCTGACGGAGGAGACGCCGGAAGGGCATCTGCCATTGACTAATGCTTTGAGAGGGACACAGTTAATGAGCAATATTTTGAACC
ATCCGGCGTTTGAGGAGGACGCCATTGAAGAGAAAGGTGAAGAAAAAATTGCAGGGGATGAAAATGGAGGATTGAAGAAAGGATTGAAATCGATTACTGAGAGGCTTTTC
AAAAGGGATTATAGCTTTTGAAATTGGGGATTTTGGAGAGTACCCATTGGAATTTACATCGAATTCCCAATTGGGTTGTTTCGATTTGGGATGAATTCGGTTCATTTTGT
TCTTCACACTTCTTTCTCTCTCTCTCTGACGGGTGACTTTTCAGTGTATTTTAAAGGATAAAAATATGAAATTTATTGGTAATAGTATCATCTTAATGTGATTTTGGCTT
CTTTAGGGTGTTTGGGGTGAAAAAAAACACTTACGTTTAATAACTAAACTTGAACACAAAGCTAGTTGAAGTTAACACATTTATCTACGAAAATTGTTAAACAGAGATTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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