| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0037745.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-134 | 82.83 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDI K TKQDKEDD KFIERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
Query: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHN+LVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQA IS+DHLR IKVLMGLR EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEE+RLGIN
Subjt: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSD VLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFI+CPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPR+YSTRAKNFTKP NSS LD T QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| KAA0063009.1 Integrase, catalytic core [Cucumis melo var. makuwa] | 4.2e-139 | 86.53 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDIAK TKQDKEDD KF ERLEEWD+K HQIITWLSNTSI AIHTQFDAFE+
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
Query: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKIS+DHLR IKVLMGL EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Subjt: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSDVVLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPRSYSTRAKNFTK RN SVVAATLDNPTT QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| KAA0064060.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.2e-139 | 85.86 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDIAK TKQDKEDD KFIERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE+
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
Query: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYL VLQPIWTQLDQA IS+DHLR IKVLMGLR EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Subjt: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LS +SDVVLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDN P KPP+PRSYSTRAK FTKPRNS VVAATLDNPTT QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| TYK16338.1 uncharacterized protein E5676_scaffold21G001200 [Cucumis melo var. makuwa] | 7.9e-138 | 85.52 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIV GDIAK TKQDKEDD KF ERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE+
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
Query: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLD+AKIS+DHLR IKV MGL EYESV+AALLHRSPL SLDAAIQEILFEEKRLGIN
Subjt: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSDVVLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPRSYS RAKNFTKPRN SVVAATLDNPTT QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| TYK19656.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.2e-133 | 82.49 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDI K TKQDKEDD KFIERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
Query: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHN+LVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQA IS+DHLR IKVLMGLR EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEE+RLGIN
Subjt: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSD VLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFI+CPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPR+YSTRAKNFTKP NSS D T QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7T8F2 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 8.8e-135 | 82.83 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDI K TKQDKEDD KFIERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
Query: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHN+LVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQA IS+DHLR IKVLMGLR EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEE+RLGIN
Subjt: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSD VLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFI+CPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPR+YSTRAKNFTKP NSS LD T QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| A0A5A7V9Z8 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.0e-139 | 85.86 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDIAK TKQDKEDD KFIERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE+
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
Query: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYL VLQPIWTQLDQA IS+DHLR IKVLMGLR EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Subjt: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LS +SDVVLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDN P KPP+PRSYSTRAK FTKPRNS VVAATLDNPTT QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| A0A5A7VBM6 Integrase, catalytic core | 2.0e-139 | 86.53 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDIAK TKQDKEDD KF ERLEEWD+K HQIITWLSNTSI AIHTQFDAFE+
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
Query: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKIS+DHLR IKVLMGL EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Subjt: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSDVVLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPRSYSTRAKNFTK RN SVVAATLDNPTT QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| A0A5A7VIT8 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 5.7e-134 | 82.49 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIVTGDI K TKQDKEDD KFIERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE---------
Query: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHN+LVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQA IS+DHLR IKVLMGLR EYESV+AALLHRSPLPSLDAAIQEILFEE+RLGIN
Subjt: ---------THYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSD VLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFI+CPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPR+YSTRAKNFTKP NSS D T QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
| A0A5D3CYJ2 Uncharacterized protein | 3.8e-138 | 85.52 | Show/hide |
Query: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
MEKSEIARPISTILDGSNYITW N++KSFLIGRKLWRIV GDIAK TKQDKEDD KF ERLEEWD+K HQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFE+
Subjt: MEKSEIARPISTILDGSNYITWTNKIKSFLIGRKLWRIVTGDIAKRTKQDKEDDEKFIERLEEWDNKYHQIITWLSNTSIPAIHTQFDAFET--------
Query: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLD+AKIS+DHLR IKV MGL EYESV+AALLHRSPL SLDAAIQEILFEEKRLGIN
Subjt: ----------HYYQLHNNLVNLNQEAGQSVNEYLAVLQPIWTQLDQAKISQDHLRFIKVLMGLRSEYESVKAALLHRSPLPSLDAAIQEILFEEKRLGIN
Query: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
LSKHSDVVLASTYS GASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDN P KPPRPRSYS RAKNFTKPRN SVVAATLDNPTT QFQISDL
Subjt: LSKHSDVVLASTYSSLGASSTFCKNCKLTGHKFIDCPKIECRYCHKPGHILDNYPTKPPRPRSYSTRAKNFTKPRNSSVVAATLDNPTTLQFQISDL
|
|
