; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0005554 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0005554
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionprotein TIFY 5A-like
Genome locationchr12:21366695..21367648
RNA-Seq ExpressionPay0005554
SyntenyPay0005554
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
GO:0031347 - regulation of defense response (biological process)
GO:2000022 - regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR018467 - CO/COL/TOC1, conserved site
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7019513.1 Protein TIFY 5A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.4e-3273.73Show/hide
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XP_022927150.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita moschata]3.6e-3172.88Show/hide
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XP_023520316.1 protein TIFY 5A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.5e-3273.73Show/hide
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A0A0A0LX13 Uncharacterized protein3.7e-4284.03Show/hide
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A0A1S3BA64 protein TIFY 5A-like1.1e-5498.33Show/hide
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A0A6J1CG02 protein TIFY 5A-like1.6e-1651.69Show/hide
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A0A6J1EN30 protein TIFY 5A-like1.7e-3172.88Show/hide
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A0A6J1KQP6 protein TIFY 5A-like5.6e-3072.03Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCACTTCCCCAACTTCAACTTGGAACTTTGTCTCTCTCCTCCTTCCTCCTCTCCTTCCACCACCACCACTACCGCTGCCGCCGCCTCCAATTCATCTTCA
CAACACAACCATATCACTCCCATCGGTGTCCCCACGCCTGATCTTACCGAGATCCAGGCAAAGGCAATAATAGTAGAAGCCACGAGACAAATGGAGGCCGAGAGA
AGATGGACGACATGTCGGATTAGTTCATCAGCAGAGAGAGTATGGATGAGGAGCGGGGAAGCTAGCCCCTCCATGAGGAGATCATTGCAGAGGTTTTTACAAAAG
AGAAAGCTTCGCATTCAAACACTTTCACCCTACACTCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAATTTATGTTTTAACATTTAATCTCTTCTTCTTCACCGCCATTTCTCCCCCTCTCCAATGGAGCACTTCCCCAACTTCAACTTGGAACTTTGTCTCTCTCCTCC
TTCCTCCTCTCCTTCCACCACCACCACTACCGCTGCCGCCGCCTCCAATTCATCTTCACAACACAACCATATCACTCCCATCGGTGTCCCCACGCCTGATCTTAC
CGAGATCCAGGCAAAGGCAATAATAGTAGAAGCCACGAGACAAATGGAGGCCGAGAGAAGATGGACGACATGTCGGATTAGTTCATCAGCAGAGAGAGTATGGAT
GAGGAGCGGGGAAGCTAGCCCCTCCATGAGGAGATCATTGCAGAGGTTTTTACAAAAGAGAAAGCTTCGCATTCAAACACTTTCACCCTACACTCACTAACTTTC
CAAATTTTGGAATAATCGTGGCTTCTTTATAATTCTCTCTTCCCTTTTGTCATTTTTCTTCTTTAGCTTTTAGGAGCTATAAGTTTGTGTTTGGATTGTATTTGT
ACATACTTGGAGCTTATTAATTTTCCAATACATTACCTACTTACATTTCTCAATTAGGATGCAGTGATGTTCTTAATATAACTAAAATAGTCTGATGCTCGTAGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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