; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0006076 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0006076
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationchr09:6385846..6386645
RNA-Seq ExpressionPay0006076
SyntenyPay0006076
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648529.1 hypothetical protein Csa_008197 [Cucumis sativus]1.6e-7894.25Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP+LLTFLTRAADPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEK

TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-92100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]1.1e-8494.05Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP+LLTFLTRAADPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

XP_008463533.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501667 [Cucumis melo]4.3e-9299.46Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAV AVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]1.1e-7688.11Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLP      KP+LLTF+TRAADPES  +DSE  GSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST A SSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein5.6e-8594.05Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK  KP+LLTFLTRAADPES   DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GSTTAASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016672.1e-9299.46Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAV AVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein7.2e-93100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPL

Query:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
Subjt:  KEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061198.9e-7583.42Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAA--SSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSK HK + LTF+TRAADPE TP+   +PGSDGDDFE+RLAKVR +YRSGTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAA--SSVYLPPV

Query:  PLKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        PLKE VSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

A0A6J1FK14 uncharacterized protein LOC1114447341.3e-7385.48Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTT-AASSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL L  NSK HKP+ LTF+TRAADPES  +DSE P SDGDDFEDRLA  R + R GTGKKAEIRKARKS+KGSTT AASSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTT-AASSVYLPPVP

Query:  LKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS
        LKE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAA AA+YIKYEKEKVSVWP+DEIKS
Subjt:  LKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein5.4e-4865.52Show/hide
Query:  DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLV
        DPE+T S+S   G+D D FE RL+ +R RYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKE VSGGLKVE GFSP+SERING IA LG++AL+LV
Subjt:  DPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLV

Query:  ELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRD
        ELATGKSV++YHTP+++ +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP+D
Subjt:  ELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTACAATTCCCTAACTCTCTCACACTTCCTTCCAATTCAAAGTCTCACAAGCCCAGGCTTCTCACCTTCCTAACCAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCTACCCCCTCGGATTCAGAACAACCTGGATCTGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGCTTCCGATACCGAAGCGGAACAGGAAAGAAGG
CAGAGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGAAAGGTTCTACCACTGCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGCTGAAGGAGCCGGTCTCCGGCGGACTTAAAGTG
GAATTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGTTGGATTGCGATACTCGGAATTTCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCGACCGGAAAAAGCGTCATCAGTTA
TCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTGGCGGCGGTTGCTGCGGTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCGGGATGAAATCA
AAAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAACCAAAAATATAAGGCGGAAACGGTTACAGCGAGTTTATCTTGGAGCTCAGATTTCTCCTTCCATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTACAATTCCCTAACTC
TCTCACACTTCCTTCCAATTCAAAGTCTCACAAGCCCAGGCTTCTCACCTTCCTAACCAGAGCAGCAGATCCGGAATCTACCCCCTCGGATTCAGAACAACCTGGATCTG
ACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGCTTCCGATACCGAAGCGGAACAGGAAAGAAGGCAGAGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGAAAGGTTCTACC
ACTGCCGCCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGCTGAAGGAGCCGGTCTCCGGCGGACTTAAAGTGGAATTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGTTG
GATTGCGATACTCGGAATTTCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCGACCGGAAAAAGCGTCATCAGTTATCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTGG
CGGCGGTTGCTGCGGTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCGGGATGAAATCAAAAGTTAGTATGAATCTTTGTTTAACAAAATTTCAGTATTG
TTTTGGCTTGATTTTCATTTTCTGTTTCTGAATTTCTACATTTTATTTTGAGTTATGTATGAATGAACACTAGAACTAGAAATGTGCAGTGGTTCAAGTGTTTAATTTAA
TTGAAATCAATTCTTTTAAATATAATTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKSHKPRLLTFLTRAADPESTPSDSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTTAASSVYLPPVPLKEPVSGGLKV
EFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKSVISYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYIKYEKEKVSVWPRDEIKS