; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0006488 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0006488
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionMYB transcription factor
Genome locationchr03:28663525..28664900
RNA-Seq ExpressionPay0006488
SyntenyPay0006488
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033571.1 transcription factor MYB44-like [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-12899.16Show/hide
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KAE8652097.1 hypothetical protein Csa_022277 [Cucumis sativus]2.3e-12296.27Show/hide
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XP_008444647.1 PREDICTED: transcription factor MYB44-like [Cucumis melo]3.0e-130100Show/hide
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XP_038885826.1 transcription factor MYB25-like [Benincasa hispida]5.4e-11191.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKY3 Uncharacterized protein1.1e-12296.27Show/hide
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A0A1S3BAB9 transcription factor MYB44-like1.5e-130100Show/hide
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A0A5A7SVX1 Transcription factor MYB44-like1.8e-12899.16Show/hide
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A0A6J1CRX2 transcription factor MYB1-like1.4e-10485.83Show/hide
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A0A6J1KMR9 transcription factor MYB44-like1.8e-9680Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04192 Transcription factor MYB251.3e-3554.89Show/hide
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O23160 Transcription factor MYB731.3e-4373.64Show/hide
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Q42575 Transcription factor MYB12.0e-3966.07Show/hide
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Q9FDW1 Transcription factor MYB443.8e-4376.92Show/hide
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Q9SN12 Transcription factor MYB777.7e-4475.96Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G23290.1 myb domain protein 702.1e-4471.43Show/hide
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AT3G09230.1 myb domain protein 11.4e-4066.07Show/hide
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AT3G50060.1 myb domain protein 775.5e-4575.96Show/hide
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AT4G37260.1 myb domain protein 739.3e-4573.64Show/hide
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AT5G67300.1 myb domain protein r12.7e-4476.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGAGTGCGGAGGAGGATCGGATTTTAACTCAGCTTGTGGATCGTTATGGAGCGAGAAATTGGTCGTTGATTAGCCGTTACATTAAAGGCCGGTCTGGAAAATCG
TGCCGGCTTAGATGGTGTAACCAGTTGAGTCCGAATGTTGAGCATCGCCCATTTTCTCCCACGGAGGATGAGACGATTTTAGCGGCTCATGCCCGGTTTGGGAAC
CGGTGGGCCACTATTGCTCGGTTGCTTCCCGGTCGGACCGATAATGCCGTTAAGAATCACTGGAACTCGACGCTAAAACGACGGGCGAGGGAACAACAGCAGCAA
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CTGGAGGACGATCCATTGACCGCGTTGACTCTAGCGCCGCCGGGAATCGGCGGCGTTAGGACGACGGCGGTGGATGAACGGCTGGTCGAGAGTTTTCCGGCGGGG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTTTCCCATTTCTGTTTCAATTTGCAGTTAAATTACAATGATGAGAAGTTCGTCTTCTAATTCCTCCTCCTCCGATTCCACGTCATCTGATTCTTCCTTCTCCGG
CAAGGGATTGCGACGCCCGGAAAAAATTAAAGGGCCATGGAGTGCGGAGGAGGATCGGATTTTAACTCAGCTTGTGGATCGTTATGGAGCGAGAAATTGGTCGTT
GATTAGCCGTTACATTAAAGGCCGGTCTGGAAAATCGTGCCGGCTTAGATGGTGTAACCAGTTGAGTCCGAATGTTGAGCATCGCCCATTTTCTCCCACGGAGGA
TGAGACGATTTTAGCGGCTCATGCCCGGTTTGGGAACCGGTGGGCCACTATTGCTCGGTTGCTTCCCGGTCGGACCGATAATGCCGTTAAGAATCACTGGAACTC
GACGCTAAAACGACGGGCGAGGGAACAACAGCAGCAACAATTAGTAATGGACGGAATTACCCCTGAGTGTCATGGTAGCAATAATAATAATAACAATGCCGTGAA
CATTGCTAGTGATTTGAAGCTCTCCGTGTCCGTACCTCTGGAGGACGATCCATTGACCGCGTTGACTCTAGCGCCGCCGGGAATCGGCGGCGTTAGGACGACGGC
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AAATCCGGAGTTTCACTAACTGAAATGCCAGACTCCTATCTGTCTGTCCCCTTCTTTCTTTCTCTTTTTCTTTTTCTTTTTGGCCCATAGAAAGTTGTATTATTA
AATCTCTTGTTAATATAATGATTCATTAAAGAAAAAAAGAAAATCCAACGTGGCATTACAGCCTGGCATGGCTTGGCATATTCTAATTTCCAACTGCCCTTTTCT
TTTTGGGTATGATATTATTATTTATAAAAGCACGTTTGGATGGAATTAGATTATGTATGATTTGAAGGTCGGTCTTGTTGTTATATATAAGATAAGGTCGTCAAC
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TTCCTTCCCTTTATAATTTCAAGAATAATCTTTATTTTAATCGCAAATGGTGGGGGAGAAGGAGAGAGATTCCTTCTGTTTGGATTGCAGATTTTAATTGAGATA
CGAGATATAGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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