CuGenDBv2

Gene ID	Pay0006546
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]
Genome location	chr02:13582110..13583332
RNA-Seq Expression	Pay0006546
Synteny	Pay0006546
Gene Ontology terms	GO:0006782 - protoporphyrinogen IX biosynthetic process (biological process) GO:0004852 - uroporphyrinogen-III synthase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR003754 - Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase IPR036108 - Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6587847.1 hypothetical protein SDJN03_16412, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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A0A0A0LZ08 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

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A0A1S3BA78 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

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A0A5A7U8V3 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

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A0A5D3BX13 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

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A0A6J1KXQ2 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]

3.2e-146

84.36

Show/hide

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SwissProt top hits

e value

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Alignment

Q8KCJ3 Uroporphyrinogen-III synthase

2.0e-04

21.29

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        +TV  T P++ A      L+  G + +  PT+ ++P      +    P L  F+ + FTS + +   L+   E     LP+      + A+GK +     
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Query:  EFLTTICPNTSRIRVVVPEIATPTGLVEALGVGN-HRRVLCPVPRVVGLNEPPVVPNFLRDLEAKGWVPVRVDAYETRWAGPDCARKLVERGKDEKLDAI
        +   +I P        +P+ A    L+  +       +    V   + L   P V      +  +G + V +  Y+      +  +K+     + K+D +
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Query:  VFTSTGEVEGLLKSLEHLGLEWDMMKKRWPEMVVAAHGPVTAAGAERLGVKVDLVSPKFDSFN
         FTS        ++++         K+   ++++AA G  T++  E+LGVKVD++   FD  N
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Arabidopsis top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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CTCATCTCCTTCCGCCCATTCTGCATTCCTTCTCCGCCGTCGCCTTCACTTCCCGCTCCGGCATTACAGCCCTCCTCGACGCTGCTACTGAAATTGGCGAGCCCTTGCTA
CCGTCGCACGGCGATACTTTCTTAATCGCAGCCCTAGGTAAGGACTCCGAGCTTCTCGACCATGAATTTCTTACCACAATTTGCCCTAACACGAGTCGAATTAGAGTTGT
GGTACCTGAAATTGCAACTCCAACTGGTTTAGTTGAAGCTCTTGGAGTTGGAAACCACCGTCGGGTTTTATGTCCGGTTCCTCGCGTCGTGGGACTCAACGAACCCCCGG
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AGAGGGAAGGATGAGAAATTGGATGCCATTGTGTTTACAAGTACTGGGGAAGTGGAGGGGCTGCTTAAAAGCTTGGAGCATTTGGGTTTGGAGTGGGATATGATGAAAAA
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mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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CTTCCCGCTCCGGCATTACAGCCCTCCTCGACGCTGCTACTGAAATTGGCGAGCCCTTGCTACCGTCGCACGGCGATACTTTCTTAATCGCAGCCCTAGGTAAGGACTCC
GAGCTTCTCGACCATGAATTTCTTACCACAATTTGCCCTAACACGAGTCGAATTAGAGTTGTGGTACCTGAAATTGCAACTCCAACTGGTTTAGTTGAAGCTCTTGGAGT
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AGGAGCTGAGAGACTCGGCGTTAAGGTTGATTTGGTGAGTCCTAAGTTTGATAGCTTCAATGGTGTGGTTGATTCTCTTCATTGGAGATGGCAGAGCTTAGATTAGAACA
CTTTCTAAATTCTTAAACATTTCAAGTTCTTTACGGTAACTTTAATCGCCATTTTATATATGCACTTGAAGCTGAATAATCTTCTTGTATACAATAATTTAGAAGGAATC
GTTTCATCTTTATTCATTCAAACCAGCGCTTTGCTTTTGAATTGCTTTGGTTATCTTCACCATTTGTATCATTCTTTTAAGAATATCATTCTTTTAATACAAAAATTTAT
TAGTTTTCCCTTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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RGKDEKLDAIVFTSTGEVEGLLKSLEHLGLEWDMMKKRWPEMVVAAHGPVTAAGAERLGVKVDLVSPKFDSFNGVVDSLHWRWQSLD

Pay0006546 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome