| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0050456.1 RNA polymerase sigma factor sigE [Cucumis melo var. makuwa] | 2.5e-297 | 100 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| TYK03136.1 RNA polymerase sigma factor sigE [Cucumis melo var. makuwa] | 5.6e-297 | 99.82 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSK+SDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| XP_008465379.1 PREDICTED: RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis melo] | 2.3e-266 | 91.22 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNK++
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
E K+ +++ KETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| XP_011651413.1 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial isoform X2 [Cucumis sativus] | 2.7e-283 | 95.43 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSS+AARTPFRL KFSNH STLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR KKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEAT CSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSD E KDGRSKRGQ+RSKKS RP DGIVRN+TKRIKRLDLDKRIALKNKKEG+AVALL+KQKDTKNEADEIDGL L+LEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKA PSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKAL+EVQEELQK LGREPTE ELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTE EI AKVGIS ERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| XP_031739380.1 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.7e-283 | 95.43 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSS+AARTPFRL KFSNH STLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR KKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEAT CSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSD E KDGRSKRGQ+RSKKS RP DGIVRN+TKRIKRLDLDKRIALKNKKEG+AVALL+KQKDTKNEADEIDGL L+LEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKA PSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKAL+EVQEELQK LGREPTE ELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTE EI AKVGIS ERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LCQ9 Uncharacterized protein | 1.3e-283 | 95.43 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSS+AARTPFRL KFSNH STLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR KKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEAT CSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSD E KDGRSKRGQ+RSKKS RP DGIVRN+TKRIKRLDLDKRIALKNKKEG+AVALL+KQKDTKNEADEIDGL L+LEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKA PSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKAL+EVQEELQK LGREPTE ELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTE EI AKVGIS ERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A1S3CQ87 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial | 1.1e-266 | 91.22 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNK++
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
E K+ +++ KETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A5A7U8E5 RNA polymerase sigma factor sigE | 1.2e-297 | 100 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A5D3BY73 RNA polymerase sigma factor sigE | 2.7e-297 | 99.82 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSK+SDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A6J1CHI4 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial | 4.3e-250 | 85.37 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTP RL AKFSNH STLKRP+IVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR+KKRSG TSK LKRVKAV DEA+ C+ ++DYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
LENIF LSPMT+D+D+ESKDGR + GQQR KKSDKR DGI+RN+TKRIKRLDLDKRIALKN
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKE KAAPSL+KQKETKNE DEID LVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALI+VQE+LQKELGREPTE ELANATNMNV+QVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKR+FRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELL ELHRLPTEEEI+AKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH+TTSEE INGITDVEG GGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P26683 RNA polymerase sigma factor SigA | 4.5e-39 | 32.95 | Show/hide |
Query: KEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRR
K GKAA S R+ + K E D + L +++ +L + E L + + + L V+E L ++L R+P ++E A A + + R
Subjt: KEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRR
Query: QLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQ
+L +GR A++K+++ NLRLV+ + KY G FQDL Q G GLI A ++F+ ++ ++ STYA +WIR AI R++ S T R+ L I+
Subjt: QLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
+ L E+ R PTEEEI ++ ++ E+ + ++ + SL + + + + +G +++ LLR L+ VLDSL P+E V+R RYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
D +TL EI N++RE +R+ E KAL KL+HP R L+ Y+
Subjt: DGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
|
|
| P38023 RNA polymerase sigma factor SigA1 | 2.9e-38 | 34.45 | Show/hide |
Query: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
+L + E L + + + AL +++EL ++L R P++AE A A + + + RR+L GR A++K+++ NLRLV+ + KY G FQDL Q G G
Subjt: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
Query: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
LI A ++F+ ++ ++ STYA +WIR AI R++ S T R+ L I++ L E+ R PTEEEI ++ ++ E+ + ++ + SL +
Subjt: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
Query: STTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
+ + + +G ++ LLR L+ VL +L P+E V+R RYGLD +TL EI N++RE +R+ E KAL KL+HP R L+ Y+
Subjt: STTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
|
|
| P52322 RNA polymerase sigma factor SigA | 7.4e-34 | 36.29 | Show/hide |
Query: RRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVE
+R+L GR A+ K+++ NLRLV+ + KY G FQDL Q G GLI A ++F+ ++ ++ STYA +WIR AI R++ S T R+ L
Subjt: RRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVE
Query: IQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRY
I++ L E+ R PTEEEI K+ ++ E+ + ++ + SL + + + + +G ++ LLR L++VLD+L P+E V+R RY
Subjt: IQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRY
Query: GLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
GLD +TL EI N++RE +R+ E KAL KL+HP R L+ Y+
Subjt: GLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
|
|
| P74565 RNA polymerase sigma factor SigA | 6.7e-35 | 35.74 | Show/hide |
Query: EAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSS
E E + N N RR+L + R A++K+++ NLRLV+ + KY G FQDL Q G GLI A ++F+ ++ ++ STYA +WIR AI R++ S
Subjt: EAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSS
Query: FT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVL
T R+ L I++ L E+ R PTEEEI K+ ++ E+ + ++ + SL + + + + +G ++ LLR L++VL
Subjt: FT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVL
Query: DSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
D+L P+E V+R RYGLD +TL EI N++RE +R+ E KAL KL+HP R L+ Y+
Subjt: DSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYL
|
|
| Q9ZNX9 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial | 1.0e-171 | 60.83 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTL-VSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
MGVV++SSSAAR+P L H S+LK+PSIVAFKAD +N+ L + P EQV +P E +N KKR KP K K L + A SCSL +DYNE
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTL-VSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
Query: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLE
AAA+LE+I+KLSP T + D+E ++K ++R +K +VRN K+ KR+ LDKRIALK + + V +K TK +
Subjt: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLE
Query: KRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATN
E+++I+RLVRDYSAS D+VSLDWKKMKIPPVL S+EH LFKL+QPMKAL+EV++ LQK LGREP EAE+A N
Subjt: KRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATN
Query: MNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLD
M +V++++E+GRAARNKLIKHNLRLVLFV+NKYF +F GPKFQDLCQAG++GLITAIDRFEPKRKFRLSTY LFWIRHAIIRSMT S+FTRV FGL+
Subjt: MNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLD
Query: SVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLV
SVRVEI +AK EL E+ R PTE+E++ ++ I+PERY EV+RA KPV SL+S+HS T EE INGITDV+G G +N RQPALLRLALDDVLDSLKPKESLV
Subjt: SVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLV
Query: IRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
IRQRYGLDGKG+RTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKH ARVDYLR+Y++
Subjt: IRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G08540.1 RNApolymerase sigma subunit 2 | 2.7e-31 | 27.96 | Show/hide |
Query: AKLENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSD------KRPSDGIVRNK-------TKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVAL-LKKQKDTKNEADE
AK +FK S T + D RSK Q K+ +GIV +K + I L+ +K+ ++ +E +V+L ++ + T+ +A
Subjt: AKLENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKKSD------KRPSDGIVRNK-------TKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVAL-LKKQKDTKNEADE
Query: IDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPT
GL + + S K G + R + + +D + R +R ++S+ L+++ E L +Q + L +Q EL + GR+PT
Subjt: IDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPT
Query: EAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMT-LS
A+ A+A ++ +R+++ G ++K+IK N+RLV+ + Y G QDL Q G +GL+ ++F+ + F+ STYA +WI+ A+ +S++ S
Subjt: EAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMT-LS
Query: SFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSE-ELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDV
R+ F + ++ A+ +L E + P EEI G+S +R + V+ + KP SL + + I D E ++ +R LD V
Subjt: SFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSE-ELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDV
Query: LDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
LDSL +E VIR R+G++ +TL EI + +SRE VR+ E A KLK+ R ++L++YL+
Subjt: LDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| AT1G64860.1 sigma factor A | 1.7e-20 | 30.77 | Show/hide |
Query: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
VL E RL K ++ L + + L+ LG EP++ +LA + ++ +++ L AR KL N+RLV+ + +Y G + DL Q G+ G
Subjt: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
Query: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
L+ I++F+ + FR+STY +WIR + R++ +S T R+ L I+ AKL L E P+ + I + +S ++ A V+SL R
Subjt: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
Query: STTSEELINGITD---VEGTGGDNRRQPALLRLALDD-----VLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPAR
+ S + G T + T +N LAL + + +L +E +IR YGLD K T +I+ + +SRE VR+ + AL KLKH AR
Subjt: STTSEELINGITD---VEGTGGDNRRQPALLRLALDD-----VLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPAR
|
|
| AT2G36990.1 RNApolymerase sigma-subunit F | 8.2e-28 | 27.99 | Show/hide |
Query: EKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDE--------IDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPT
EK ++S ++ + R+ ++ + DDE + + + + D + L + +L + E L +Q + L +V+ +L+ + G EPT
Subjt: EKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDE--------IDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPT
Query: EAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSS
E A A ++ ++ + GR++R KLI NLRLV+ + +Y G FQDL Q G GL+ ++++F+P+ R +TYA +WIR +I +S+ +S
Subjt: EAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSS
Query: FT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLH----SRHSTTSEELI--NGITDVEGTGGDNRRQPALLRL
T R+ + + ++ A+ + E + P++EE+ VG+S E+ +++ T+ S+ S TT +E+ +GI + G L+R
Subjt: FT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLH----SRHSTTSEELI--NGITDVEGTGGDNRRQPALLRL
Query: ALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRY
+ ++L+ L PKE +I+ R+G+DG R+L EI +S+E VR+ E +AL +LK L Y
Subjt: ALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRY
|
|
| AT3G53920.1 RNApolymerase sigma-subunit C | 9.1e-19 | 29.14 | Show/hide |
Query: SSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLIT
S T + V+ + + ++ +L++E G+ + + A A MN + R L G R++L+K LVLF+ Y G +DL QAG G++
Subjt: SSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLIT
Query: AIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTR-VSFGLDSVRV--EIQRAKLELLCELH-RLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
+RF+ R ++ STY +WIR ++ S +S R V +R IQ+A+ L + +EEI G S ++ + K V S+ +
Subjt: AIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTR-VSFGLDSVRV--EIQRAKLELLCELH-RLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
Query: S---TTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRR
TT T +E RQ A R + D+L+ L+P+E V+ RYGL ++L EI L +S+E +RK E +A+ KL+ + LR
Subjt: S---TTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRR
Query: YL
YL
Subjt: YL
|
|
| AT5G24120.1 sigma factor E | 7.1e-173 | 60.83 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTL-VSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
MGVV++SSSAAR+P L H S+LK+PSIVAFKAD +N+ L + P EQV +P E +N KKR KP K K L + A SCSL +DYNE
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLSAKFSNHGSTLKRPSIVAFKADKHTNTTL-VSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
Query: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLE
AAA+LE+I+KLSP T + D+E ++K ++R +K +VRN K+ KR+ LDKRIALK + + V +K TK +
Subjt: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKKSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAVALLKKQKDTKNEADEIDGLRLDLE
Query: KRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATN
E+++I+RLVRDYSAS D+VSLDWKKMKIPPVL S+EH LFKL+QPMKAL+EV++ LQK LGREP EAE+A N
Subjt: KRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLVRDYSASTDLVSLDWKKMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATN
Query: MNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLD
M +V++++E+GRAARNKLIKHNLRLVLFV+NKYF +F GPKFQDLCQAG++GLITAIDRFEPKRKFRLSTY LFWIRHAIIRSMT S+FTRV FGL+
Subjt: MNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLD
Query: SVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLV
SVRVEI +AK EL E+ R PTE+E++ ++ I+PERY EV+RA KPV SL+S+HS T EE INGITDV+G G +N RQPALLRLALDDVLDSLKPKESLV
Subjt: SVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLV
Query: IRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
IRQRYGLDGKG+RTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKH ARVDYLR+Y++
Subjt: IRQRYGLDGKGNRTLGEIAGNLNISREMVRKHEVKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
