; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0007931 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0007931
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 39-like
Genome locationchr05:2733985..2735899
RNA-Seq ExpressionPay0007931
SyntenyPay0007931
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000571 - Zinc finger, CCCH-type
IPR036855 - Zinc finger, CCCH-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599412.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-15384.18Show/hide
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KAG7030401.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-15384.18Show/hide
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XP_004139420.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 39 [Cucumis sativus]8.3e-17293.35Show/hide
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XP_008457806.1 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like [Cucumis melo]1.8e-17494.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKX6 Uncharacterized protein4.0e-17293.35Show/hide
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A0A1S3C7N3 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like8.7e-17594.94Show/hide
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A0A5A7V7E5 Zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like8.7e-17594.94Show/hide
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A0A6J1G2M8 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.9e-15384.18Show/hide
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A0A6J1KJ53 zinc finger CCCH domain-containing protein 39-like1.2e-15284.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5PP65 Zinc finger CCCH domain-containing protein 281.4e-1234.21Show/hide
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        K KLC KF  G  CPY    C+F H           P  +++   ++ R RES A+S+G  G                     +V+  L++        W
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        KT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SEL  + G   EGE    ++A L+ K
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Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 317.7e-1134.19Show/hide
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        K+K C KF++   CP+G+ C+F H  P  ++        +  +++G    P            P+RA          A GN  P S  KT++CTK+    
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         C FGDKCHFAHG+ EL
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Q84UQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 565.1e-3938.43Show/hide
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        N   ++ I  +FFKT++C KF+ G C    +CNFAHG+E++R+PPPNWQEIV   E+       +    +                         K + C
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Query:  RKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGD
        +KFY  E CPYGD C FLH       D+  + RES AIS+    +P + G         + A + S S A       +PS WKT++C KWE+TG+CPFG 
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        KCHFAHG +EL  Y G
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Q9LQM3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 126.7e-3934.45Show/hide
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        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
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         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
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Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIG
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  + G
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Q9LT81 Zinc finger CCCH domain-containing protein 398.9e-6851.24Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI

Query:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAMEA
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A EA
Subjt:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAMEA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein4.7e-4034.45Show/hide
Query:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG
        PPP + + + GD+         +  W+  P N   D         PP K+ R S   PSS  + +  + ++R         K I  +FFKT++C KF+ G
Subjt:  PPPLHSYGSNGDA---------SGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLG

Query:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF
         C    +CNFAH VE++R+PPPNWQEIV   E+++S         +++                      K + C+KFY  E CPYG+ C FLH      
Subjt:  LCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQ----------------------KMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKF

Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIG
         D++ R RES AIS+G  G     G  S         +S +V       G+        ++PS WKT++C KWEITG+CPFG KCHFAHG +EL  + G
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIG

AT1G66810.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein3.4e-0632Show/hide
Query:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ
        R++  R     +IS+ + G   +N    +S ++ S+ +S SVS +     ++  G          R    KT+LC KW+ TG C +GD C FAHG  EL+
Subjt:  RDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDA-----LRANGN--------VRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQ

AT1G68200.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein2.2e-0526.17Show/hide
Query:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES
        KT +C K+ + G C  G  C FAHG++++R    + +                       K ++CR    G+ CPYG RC+F H    + +  +  F+  
Subjt:  KTRMCAKF-KLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRES

Query:  SAISIGT
        S++ + T
Subjt:  SAISIGT

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein9.9e-1434.21Show/hide
Query:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFW
        K KLC KF  G  CPY    C+F H           P  +++   ++ R RES A+S+G  G                     +V+  L++        W
Subjt:  KMKLCRKFYNGEECPY-GDRCNFLHE---------DPAKFRD---DSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFW

Query:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR--EGEV---STAALNVK
        KT++C KW+ TG+CPFG  CHFAHG SEL  + G   EGE    ++A L+ K
Subjt:  KTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR--EGEV---STAALNVK

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein6.3e-6951.24Show/hide
Query:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI
        QSQ   Q QP  KR R  ++N  +P       S SNP +    +PP  PVNKG +NIF+KTRMCAKF+ G CRNG  CNFAHG+ED+RQPP NWQEIVG 
Subjt:  QSQFEVQ-QPPYKRARNSEENPSSPI------SYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASCNFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGI

Query:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI
            Q                      NNW DDQKII +MKLCRKF  GEECPYGDRCNF+HED +KFR+DSG+ RESS IS+G T         +S+ I
Subjt:  KEDDQS--------------------VNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYI

Query:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAMEA
        E +R  S  V   +   G V+  +WKT+LC K++ITG CPFGDKCHFAHGQ+EL   +GR EGE   + A++N + ++ A EA
Subjt:  EPSRATSCSVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGR-EGEV--STAALNVKPLIVAMEA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTTCAATGATATGAGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTAATGGCGATGCGTCTGGTTGCTGGTCTCAGTTTCCCAGGAATGATCCATT
TGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCTAGTCCTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTGAATTCTA
GGGGGCACCCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATATTTTTCAAGACGAGGATGTGTGCGAAATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGAAATGGTGCTAGTTGT
AACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGGATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAA
GATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAATTTTCTTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATT
CTGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGTACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTCTTCTAGTTATATTGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGT
TCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGTGGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTG
CCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTAAATGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAAGCCATCT
TTCGAGTCTTGCACAATCGTGTACTTCCCCCTCTGCCTTTACCGCGAGGGCCAGGCAGAGCCAAGTTGCCTGAAAATGGCCTAAAGAACAAAGAAGCGATACAAACTCGG
CATCTCTATTTTGCGATTGTGCTCGTCGTCTCTCCCCTTCTCTCTCAAGAGCGTCCAAGTCAAAATGGCAGGTGTGAGAGCCCTTTTTTTTTTTCAGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCGTCTTTTGACTAACTCGCCTACAAAAATTCCCTTGTGTCGATTCAGAAGATTCCATGGTTTTGGCCTTCCTCAATCCTCCGATTTTCATTAGGGTTTTCGTTTCTCCT
TGGCGGCTAGGGTTTTGATTCTTCATTCACTTTGTTGTTTTTCTTTTCGACCTCTTCATTATAAATATATAACTACAACTCTTTCACTTTCGCCATTGTTTTGATTCCTT
CTTCCATTGATCTTCATTCCGCTGTTTTCTTTTTATTGATATTTCAAAAAACCTTTTGTTTATTTATCCAAACTCAACTTTAATTTGCCTACTTTTCTTGTTTTCTTGTT
TTCTTGTTTTCTTTTTCTTCTTGCCAATTGTTGGTATAAGGGAGGATGATCACGTCGATTGATTGAAATTTCTATTGGGTGGATTCGTTGTTCGTTGTTGATTCATTGTT
TTGATTGATTAAAGAGAACTGGGTTTTGTTTTAGAAGATGAGTTTCAATGATATGAGAGGCTCTGTTATACCGCCGCCTCTGCATTCTTATGGTTCTAATGGCGATGCGT
CTGGTTGCTGGTCTCAGTTTCCCAGGAATGATCCATTTGATCCACAATCACAATTTGAAGTACAACAGCCTCCGTATAAAAGAGCTAGAAATTCTGAAGAAAACCCATCT
AGTCCTATCTCTTATTCAAATCCCTCCTTGAATTCTAGGGGGCACCCACCAAATGCTCCAGTGAATAAAGGAATAAGTAATATATTTTTCAAGACGAGGATGTGTGCGAA
ATTTAAGCTTGGTTTGTGTAGAAATGGTGCTAGTTGTAACTTTGCTCATGGTGTTGAAGATATGAGACAACCTCCACCAAATTGGCAAGAAATTGTTGGTATAAAGGAGG
ATGATCAATCAGTAAATAATTGGAATGATGATCAGAAGATAATTCAGAAAATGAAGCTGTGTAGGAAGTTTTATAATGGAGAGGAATGCCCTTATGGAGATAGGTGTAAT
TTTCTTCATGAAGATCCTGCAAAGTTTAGAGATGATTCTGGTAGGTTTAGGGAGAGTTCAGCTATAAGTATTGGTACTACAGGAACTCCATTGATGAATGGAAGTGATTC
TTCTAGTTATATTGAACCTAGCAGGGCAACTTCTTGTTCTGTTTCTGATGCTCTTCGAGCTAATGGAAATGTTAGGCCTTCATTCTGGAAGACAAAGTTATGCACCAAGT
GGGAGATTACAGGCCATTGCCCCTTTGGTGATAAGTGCCATTTTGCTCATGGCCAATCTGAGTTACAACTATATATTGGACGTGAGGGGGAAGTATCTACTGCTGCCCTA
AATGTAAAGCCTCTAATTGTAGCCATGGAAGCCATCTTTCGAGTCTTGCACAATCGTGTACTTCCCCCTCTGCCTTTACCGCGAGGGCCAGGCAGAGCCAAGTTGCCTGA
AAATGGCCTAAAGAACAAAGAAGCGATACAAACTCGGCATCTCTATTTTGCGATTGTGCTCGTCGTCTCTCCCCTTCTCTCTCAAGAGCGTCCAAGTCAAAATGGCAGGT
GTGAGAGCCCTTTTTTTTTTTCAGGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFNDMRGSVIPPPLHSYGSNGDASGCWSQFPRNDPFDPQSQFEVQQPPYKRARNSEENPSSPISYSNPSLNSRGHPPNAPVNKGISNIFFKTRMCAKFKLGLCRNGASC
NFAHGVEDMRQPPPNWQEIVGIKEDDQSVNNWNDDQKIIQKMKLCRKFYNGEECPYGDRCNFLHEDPAKFRDDSGRFRESSAISIGTTGTPLMNGSDSSSYIEPSRATSC
SVSDALRANGNVRPSFWKTKLCTKWEITGHCPFGDKCHFAHGQSELQLYIGREGEVSTAALNVKPLIVAMEAIFRVLHNRVLPPLPLPRGPGRAKLPENGLKNKEAIQTR
HLYFAIVLVVSPLLSQERPSQNGRCESPFFFSG