; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0008632 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0008632
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationchr11:31521568..31523423
RNA-Seq ExpressionPay0008632
SyntenyPay0008632
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039848.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold122G001230 [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-10799.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein1.4e-10598.51Show/hide
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A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988822.6e-10498.98Show/hide
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A0A5A7TA84 Uncharacterized protein1.1e-10799.5Show/hide
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A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557806.4e-8786.63Show/hide
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A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883502.5e-8383.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein1.2e-2946.15Show/hide
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AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)3.3e-3548.02Show/hide
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        DR
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AT2G33510.2 unknown protein3.4e-3244.7Show/hide
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        VEDCPKC +++L+HFDR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGACGAGAGTAATGGGTTCCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGACGAGATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCTCTTGAGCAATCTTTCCGTAACTTCTCCCTCAAC
CACCGTCTATCCTCTGCCGCCCCCTCTTCCGCCGGAGTGCGGAGATCACCGTCTTCATTTTCTTCCTCTTCTTCCTCCTCCGATGACGAACCTCATCTTCCTCTTTATCA
ACATAATCGCTTCGACACAATCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCCCTCCCTCCTTTCTGGGAGCAATGCCTCGATTTGAAGACAGGGGAAGTTTACTATAGAAACTGCC
GAACCGGAATGAAGGTAAAAGAAGATCCGAGGACAGCCGTAGCACACAGTCGAGATTTATATTCGGAAGACGACGGGGAGGACGGTGATGAGAGTTCTTCAGACGGTGGA
AGTGAGGAGTCGTGTTCTTCATCGTCGTACGGTGGTAGTAGACAGCAATATCCGGCGGAAAACGTGGAGGATGTACTGGTAGTAGCTGGATGCAAGAGATGCTTCATGTA
TTTCATGGTGCCGAAACAGGTTGAAGATTGTCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTTGTTCATTTCGATCGCTCCGACGAGAGTAATGGGTTCCCATGAACCACTTTTTTTT
TTCTTTTGAGAAAAACAAGAAACCAAAATCAAACTGTATTTGGGTTAATTGATCTGACAAAATCATTGATTCTTTTTCTTTGGATTAATTAATTTGGTTAGCAAAAGAGC
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TGGTGTATGAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAGATAGAGAGAGGGTATGAATGGGATGGTCAACGACTCAAACGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGAATAATATT
TTGCTCGTGAAGACAGCGACTTGTTGCTTTCATGATGCATTCCACAACCCACACTGATTGAATCGTACGCAATTATTATTATTTTTAAAACGGAAAATTCAATCCATTTA
GTAAACTTTTTATATGATTAATTATAGAATTTATGTAATTGAAAATGGGATAACTTTAGCCATAATAAAATGTCTAAAATGCACTATTAGAGAATATCATTATAATATAG
TCCTAATCCCTCTCATCTAACCTTTTATTTTATTTATTTTTTGGTTCAACATTAAACAAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSPDMAAVTDSLEQSFRNFSLNHRLSSAAPSSAGVRRSPSSFSSSSSSSDDEPHLPLYQHNRFDTILELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMKVKEDPRTAV
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