; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0008647 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0008647
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptionintegumentary mucin C.1-like
Genome locationchr09:5216321..5217805
RNA-Seq ExpressionPay0008647
SyntenyPay0008647
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_016902320.1 PREDICTED: integumentary mucin C.1-like [Cucumis melo]5.4e-72100Show/hide
Query:  MSDHSGVISTTATATTATTASCRCRCRSCCCRVAAAPTAAAPTAAAPTTAAPTTAAPTTVAPTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTTATTTTTTTTTT
        MSDHSGVISTTATATTATTASCRCRCRSCCCRVAAAPTAAAPTAAAPTTAAPTTAAPTTVAPTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTTATTTTTTTTTT
Subjt:  MSDHSGVISTTATATTATTASCRCRCRSCCCRVAAAPTAAAPTAAAPTTAAPTTAAPTTVAPTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTTATTTTTTTTTT

Query:  TTTPTTYYYYSYYLLPTTTPTTTTATTTTATTTATTTTATTTAATITATTLIFSSSPFASVSCRQVIALEFLNFLLSLVGIRLSTTWIGSLGFFENQDFS
        TTTPTTYYYYSYYLLPTTTPTTTTATTTTATTTATTTTATTTAATITATTLIFSSSPFASVSCRQVIALEFLNFLLSLVGIRLSTTWIGSLGFFENQDFS
Subjt:  TTTPTTYYYYSYYLLPTTTPTTTTATTTTATTTATTTTATTTAATITATTLIFSSSPFASVSCRQVIALEFLNFLLSLVGIRLSTTWIGSLGFFENQDFS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E2W4 integumentary mucin C.1-like2.6e-72100Show/hide
Query:  MSDHSGVISTTATATTATTASCRCRCRSCCCRVAAAPTAAAPTAAAPTTAAPTTAAPTTVAPTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTTATTTTTTTTTT
        MSDHSGVISTTATATTATTASCRCRCRSCCCRVAAAPTAAAPTAAAPTTAAPTTAAPTTVAPTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTTATTTTTTTTTT
Subjt:  MSDHSGVISTTATATTATTASCRCRCRSCCCRVAAAPTAAAPTAAAPTTAAPTTAAPTTVAPTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTTATTTTTTTTTT

Query:  TTTPTTYYYYSYYLLPTTTPTTTTATTTTATTTATTTTATTTAATITATTLIFSSSPFASVSCRQVIALEFLNFLLSLVGIRLSTTWIGSLGFFENQDFS
        TTTPTTYYYYSYYLLPTTTPTTTTATTTTATTTATTTTATTTAATITATTLIFSSSPFASVSCRQVIALEFLNFLLSLVGIRLSTTWIGSLGFFENQDFS
Subjt:  TTTPTTYYYYSYYLLPTTTPTTTTATTTTATTTATTTTATTTAATITATTLIFSSSPFASVSCRQVIALEFLNFLLSLVGIRLSTTWIGSLGFFENQDFS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGACCATAGTGGTGTTATTTCTACTACTGCTACTGCTACTACTGCTACTACTGCTAGCTGCCGCTGCCGCTGCCGCTCCTGCTGCTGCCGCGTTGCTGCT
GCTCCCACTGCTGCTGCTCCCACTGCTGCTGCTCCCACTACTGCTGCTCCCACTACTGCTGCTCCCACTACTGTTGCTCCCACTACTGCTGCTACCACTACTGCT
GCTACCACTACTGCTGCTACCACTACTGCTGCTACCACTACTGCTACTACCACTACTGCTACTACCACTACTACTACCACCACTACTACTACTACTACTCCTACT
ACCTACTACTACTACTCCTACTACCTACTACCTACGACTACGCCTACTACGACTACTGCTACTACGACTACTGCTACTACCACTGCTACTACCACTACTGCTACT
ACTACTGCTGCTACTATTACTGCTACTACTCTCATCTTCTCATCTTCTCCTTTTGCTTCAGTTTCGTGTCGTCAGGTTATAGCACTTGAATTCCTTAACTTTCTA
TTAAGTCTGGTTGGAATTCGACTTTCAACTACTTGGATTGGATCTTTGGGCTTTTTTGAGAACCAGGATTTTAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTGACCATAGTGGTGTTATTTCTACTACTGCTACTGCTACTACTGCTACTACTGCTAGCTGCCGCTGCCGCTGCCGCTCCTGCTGCTGCCGCGTTGCTGCT
GCTCCCACTGCTGCTGCTCCCACTGCTGCTGCTCCCACTACTGCTGCTCCCACTACTGCTGCTCCCACTACTGTTGCTCCCACTACTGCTGCTACCACTACTGCT
GCTACCACTACTGCTGCTACCACTACTGCTGCTACCACTACTGCTACTACCACTACTGCTACTACCACTACTACTACCACCACTACTACTACTACTACTCCTACT
ACCTACTACTACTACTCCTACTACCTACTACCTACGACTACGCCTACTACGACTACTGCTACTACGACTACTGCTACTACCACTGCTACTACCACTACTGCTACT
ACTACTGCTGCTACTATTACTGCTACTACTCTCATCTTCTCATCTTCTCCTTTTGCTTCAGTTTCGTGTCGTCAGGTTATAGCACTTGAATTCCTTAACTTTCTA
TTAAGTCTGGTTGGAATTCGACTTTCAACTACTTGGATTGGATCTTTGGGCTTTTTTGAGAACCAGGATTTTAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSDHSGVISTTATATTATTASCRCRCRSCCCRVAAAPTAAAPTAAAPTTAAPTTAAPTTVAPTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTTATTTTTTTTTTTTTPT
TYYYYSYYLLPTTTPTTTTATTTTATTTATTTTATTTAATITATTLIFSSSPFASVSCRQVIALEFLNFLLSLVGIRLSTTWIGSLGFFENQDFS