; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0009992 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0009992
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr08:7920921..7922009
RNA-Seq ExpressionPay0009992
SyntenyPay0009992
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046727.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.1e-10059.63Show/hide
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KAA0062747.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]6.8e-11168.31Show/hide
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TYK08389.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-12188.31Show/hide
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]3.9e-12288.71Show/hide
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XP_008455792.1 PREDICTED: putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo]9.2e-12475.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B4J8 uncharacterized protein LOC1034859521.9e-12288.71Show/hide
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A0A1S3C1U8 putative nuclease HARBI14.5e-12475.82Show/hide
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A0A5A7U0J9 Putative nuclease HARBI11.9e-12288.71Show/hide
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A0A5D3CDG6 Putative nuclease HARBI17.1e-12288.31Show/hide
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A0A5D3DG22 Retrotransposon protein3.3e-11168.31Show/hide
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        ASNEWSEWRDQLAHTMFSDWEL+ Q
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G19120.1 PIF / Ping-Pong family of plant transposases3.5e-0441.07Show/hide
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        T     F+      R+V+  A GLLK RW IL+  +   V+   +TI+ACC+LHNL
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AT4G10890.1 unknown protein1.4e-0830.67Show/hide
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        +L    GL E E + +EE VAMFL  +  +   R I   + +S   V R  + VL A  +   + LK  +     V   C   R + F     N    L 
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         +            R   YHL ++ G    P T +E FN KH   R+VI+R FG+ K +W IL
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AT5G12010.1 unknown protein4.9e-0629Show/hide
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        T  +  FN K S  + V + AFG LKGRWA L+ ++   +      + ACC+LHN+              E+ + E++  N + + N     RD ++H +
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AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)4.9e-1441.46Show/hide
Query:  RGERYHLSEWRGESNAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVDVQCRTIMACCLLHNLINREMTNSE
        RG RYHL E+ G+   P T  E FN++H S RNVIER FG+ K R+AI +    +    Q   ++ C  LHN + +E  + E
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AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)1.4e-2128.67Show/hide
Query:  MDRRCFAILCHLLRTTAGLVETEVIDVEEMVAMFLHILAHDVKNRMIQREFVRSGETVSRHFNIVLLAGFRLHDELLKKPQPVTNSCT----DPRWKWFE
        MD+  F  LC LL+T   L  T  I +E  +A+FL I+ H+++ R +Q  F  SGET+SRHFN VL A   +  +     QP +NS T    DP   +F+
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Query:  NCLGALDGTYIKVNV--------------------------------------SATDR---------------PRGERY-----------HLSEWRGES-
        +C+G +D  +I V V                                      SA+D+               P+G+ Y            ++ + G S 
Subjt:  NCLGALDGTYIKVNV--------------------------------------SATDR---------------PRGERY-----------HLSEWRGES-

Query:  NAPTTAREFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVDVQCRTIMACCLLHNLINREMTNSEIIEINYIEASNEWSEWRD
        N+   A+E FN +H      I R FG LK R+ IL     YP+  Q + ++A C LHN +  E  +  +  +   E   E  E R+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATAGAAGGTGTTTTGCCATTTTATGCCATTTACTAAGGACGACTGCTGGATTAGTCGAAACAGAAGTTATAGATGTAGAGGAGATGGTTGCCATGTTCCTGCATAT
ATTAGCTCATGACGTGAAGAACCGAATGATACAAAGGGAATTTGTACGGTCTGGTGAGACTGTTTCTAGACATTTCAACATTGTCTTGTTAGCGGGTTTTCGGTTACACG
ACGAGTTGTTGAAAAAACCTCAGCCAGTAACAAACTCGTGCACCGATCCAAGATGGAAATGGTTTGAGAATTGTCTTGGTGCGTTAGATGGCACATACATTAAGGTGAAT
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GTTGTCTGCTACACAATCTTATCAATAGAGAGATGACTAACAGTGAAATAATCGAGATTAATTACATTGAGGCTTCAAACGAATGGAGTGAATGGAGGGATCAATTGGCT
CATACGATGTTTAGTGATTGGGAGTTACGTGATCAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATAGAAGGTGTTTTGCCATTTTATGCCATTTACTAAGGACGACTGCTGGATTAGTCGAAACAGAAGTTATAGATGTAGAGGAGATGGTTGCCATGTTCCTGCATAT
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CATACGATGTTTAGTGATTGGGAGTTACGTGATCAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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HTMFSDWELRDQ