; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0010236 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0010236
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionGibberellin regulated protein
Genome locationContig00140_ERROPOS1134973:112909..113334
RNA-Seq ExpressionPay0010236
SyntenyPay0010236
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7026958.1 Snakin-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.5e-4086.17Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKS S++LVL+S +LSSF LQ+  ADSS TYAPS CDSKCG RCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

XP_008440339.1 PREDICTED: peamaclein-like [Cucumis melo]4.8e-47100Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

XP_031742787.1 peamaclein-like isoform X1 [Cucumis sativus]1.9e-4394.74Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAP-SVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKS+SVTLVLLS ILSSFFLQY TADSSTTYAP  VCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAP-SVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

XP_031742788.1 peamaclein-like isoform X2 [Cucumis sativus]2.6e-4596.81Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKS+SVTLVLLS ILSSFFLQY TADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

XP_038880848.1 peamaclein-like [Benincasa hispida]3.6e-4291.49Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKS SV LVLLS ILSSF LQY  ADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCG+CCQQC CVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLG3 Uncharacterized protein9.2e-4494.74Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAP-SVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKS+SVTLVLLS ILSSFFLQY TADSSTTYAP  VCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAP-SVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

A0A1S3B1M5 peamaclein-like2.3e-47100Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

A0A5D3CMS1 Peamaclein-like1.3e-3484.04Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAP               VKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

A0A6J1HEX9 peamaclein-like1.4e-3985.11Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKS S++LVL+S +LSSF LQ+  ADS  TYAPS CDSKCG RCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

A0A6J1KSF0 peamaclein-like6.8e-3984.04Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MKS S++LVL+S ILSSF L +  ADSS TY PS CDSKCG RCLNAGVKDRC+KYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80641 Gibberellin-regulated protein 82.5e-2254.26Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MK + V   ++S +L+S F    +ADSS       C  KC VRC  AG  + CLKYC +CCQ+C CVPSGT+G+K ECPCYRD  NSKG SKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

O82328 Gibberellin-regulated protein 71.6e-2152.78Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGT---ADSSTTYAPSV-----------CDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLN
        MK +   LVL S +L S  L   T   A  S   AP+            C  KC  RC  AG+KDRCLKYCG+CC+ C+CVPSGTYGNK EC CYRDKL+
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGT---ADSSTTYAPSV-----------CDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLN

Query:  SKGKSKCP
        SKG  KCP
Subjt:  SKGKSKCP

P86888 Peamaclein3.5e-2475.41Show/hide
Query:  SVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        S CDSKCGVRC  AG ++RCLKYCG+CC++C CVPSGTYGNK ECPCYRD  NSKG  KCP
Subjt:  SVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

Q8LFM2 Gibberellin-regulated protein 108.6e-2355.79Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCK-CVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MK  +V ++++S +++S      TADSS       C  KC VRC  AG +DRCLKYC +CC++C  CVPSGTYGNK ECPCYRD  NSKG SKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCK-CVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

Q948Z4 Snakin-14.4e-2759.57Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MK   +TL+L++ +++   +Q      +T    S CDSKC +RC  AG+ DRCLKYCG+CC++CKCVPSGTYGNK ECPCYRDK NSKGKSKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10588.1 Gibberellin-regulated family protein1.8e-2053.33Show/hide
Query:  VTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAG-VKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        V   ++S +L+S F    +ADS      S C  KC VRC  A    + CL+ C +CCQ+C CVPSGTYGNK ECPCYRD  NSKG SKCP
Subjt:  VTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAG-VKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

AT1G10588.2 Gibberellin-regulated family protein2.4e-2053.33Show/hide
Query:  VTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAG-VKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        V   ++S +L+S F    +ADSS       C  KC VRC  A    + CL+ C +CCQ+C CVPSGTYGNK ECPCYRD  NSKG SKCP
Subjt:  VTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAG-VKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

AT2G14900.1 Gibberellin-regulated family protein1.2e-2252.78Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGT---ADSSTTYAPSV-----------CDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLN
        MK +   LVL S +L S  L   T   A  S   AP+            C  KC  RC  AG+KDRCLKYCG+CC+ C+CVPSGTYGNK EC CYRDKL+
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGT---ADSSTTYAPSV-----------CDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLN

Query:  SKGKSKCP
        SKG  KCP
Subjt:  SKGKSKCP

AT2G39540.1 Gibberellin-regulated family protein1.8e-2354.26Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MK + V   ++S +L+S F    +ADSS       C  KC VRC  AG  + CLKYC +CCQ+C CVPSGT+G+K ECPCYRD  NSKG SKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP

AT5G59845.1 Gibberellin-regulated family protein6.1e-2455.79Show/hide
Query:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCK-CVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP
        MK  +V ++++S +++S      TADSS       C  KC VRC  AG +DRCLKYC +CC++C  CVPSGTYGNK ECPCYRD  NSKG SKCP
Subjt:  MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCK-CVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCTCTTTCCGTCACTTTGGTTCTTCTTTCATTTATTCTGAGCTCATTCTTCCTCCAGTATGGCACTGCCGATTCCTCTACAACCTATGCTCCAAGTGTTTGTGA
TTCAAAATGTGGGGTAAGATGCTTGAATGCAGGGGTGAAGGACAGGTGTTTGAAGTATTGTGGACTCTGCTGCCAACAGTGCAAGTGCGTGCCCTCTGGAACCTATGGAA
ACAAATCAGAATGCCCTTGTTATAGAGACAAGTTGAACTCCAAGGGAAAATCTAAATGCCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAATCTCTTTCCGTCACTTTGGTTCTTCTTTCATTTATTCTGAGCTCATTCTTCCTCCAGTATGGCACTGCCGATTCCTCTACAACCTATGCTCCAAGTGTTTGTGA
TTCAAAATGTGGGGTAAGATGCTTGAATGCAGGGGTGAAGGACAGGTGTTTGAAGTATTGTGGACTCTGCTGCCAACAGTGCAAGTGCGTGCCCTCTGGAACCTATGGAA
ACAAATCAGAATGCCCTTGTTATAGAGACAAGTTGAACTCCAAGGGAAAATCTAAATGCCCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSLSVTLVLLSFILSSFFLQYGTADSSTTYAPSVCDSKCGVRCLNAGVKDRCLKYCGLCCQQCKCVPSGTYGNKSECPCYRDKLNSKGKSKCP