; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0010271 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0010271
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Descriptiontranscription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like
Genome locationchr11:27523014..27524678
RNA-Seq ExpressionPay0010271
SyntenyPay0010271
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
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GO:0034756 - regulation of iron ion transport (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004145819.1 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR [Cucumis sativus]4.5e-15897.09Show/hide
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XP_022943777.1 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like [Cucurbita moschata]3.7e-12883.82Show/hide
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XP_022986352.1 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like [Cucurbita maxima]1.7e-12582.52Show/hide
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A0A1S3CQB6 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR isoform X11.0e-163100Show/hide
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A0A1S4E5Y5 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR isoform X21.7e-12381.23Show/hide
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A0A5A7T764 Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR isoform X11.0e-163100Show/hide
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A0A6J1FTZ6 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like1.8e-12883.82Show/hide
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A0A6J1J7B0 transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR-like8.3e-12682.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A0N7KIY3 Transcription factor BHLH1562.2e-2234.03Show/hide
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        R + T T+ V + E D++  +   +KLW+  ALL  GF
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Q0V7X4 Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR1.1e-6150.31Show/hide
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        +++IND  EL +F+   NFD+++NLIRG ++T   + N  LDF  G L       Q+    +D N  + +  + LF  L   +S + E         V  
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          E+++ED N+  ++S++TT    ++K K DR+RTLISERRRRGRMK+KLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYV+ELQ QAKKLK++I+ LE+S+N T
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           Q+   D  K +  +    +     KIIQ+DV QVEE+GFY+RLVC  GE VA SLYK LESLT+F +Q+SNL+S S D ++LT T++    E  +NL
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        PNLKLW+TG+LLN GFEF
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH353.7e-1432.63Show/hide
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        +E IVD  +    +P+S              ++NED + D     +E  S    SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKA
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Query:  SIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKV
        SI+ DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V
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         ESL N  I +SNL S S     T  I   + E ++
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Q700E3 Transcription factor bHLH273.8e-1132.21Show/hide
Query:  KEVENEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLES----
        +E+E +    +E  + S E+SS   +    A  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNI+K+DKAS++ D++ Y++EL  Q K L+AEI  LES    
Subjt:  KEVENEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLES----

Query:  ----------SINETQ----KIHRDQTKKKIIQTSYSD--QFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTNFIIQSSNLASASDRF
                  +  ET       + D   KK  Q  YS   Q  P +++++ V  + E+   + + C       + L KVLESL N  I ++N +S + R 
Subjt:  ----------SINETQ----KIHRDQTKKKIIQTSYSD--QFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTNFIIQSSNLASASDRF

Query:  ILTATINV
          T  + V
Subjt:  ILTATINV

Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES5.5e-1032.79Show/hide
Query:  ENEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKP--KADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEI---SVLESSI
        EN   D   D ++ +++      KK   K  + + L++ERRRR ++ ++LYALRSLVP ITK+D+ASI+GDA+ YVKELQ +AK+L+ E+   S  E   
Subjt:  ENEDEDEDEDENESVENSSSTTSKKP--KADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEI---SVLESSI

Query:  NETQ-----------KIH-------RDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESL
        N  Q             H          + K+ +    S+        Q+DV Q++ R F+++++C+        L + L+SL
Subjt:  NETQ-----------KIH-------RDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28160.1 FER-like regulator of iron uptake7.5e-6350.31Show/hide
Query:  MTDINDQFELQDFIHGDNFDRYVNLIRGGNETPIFNNNFDLDFVNGCLIEDRVVDQSLEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKE---------VEN
        +++IND  EL +F+   NFD+++NLIRG ++T   + N  LDF  G L       Q+    +D N  + +  + LF  L   +S + E         V  
Subjt:  MTDINDQFELQDFIHGDNFDRYVNLIRGGNETPIFNNNFDLDFVNGCLIEDRVVDQSLEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKE---------VEN

Query:  EDEDEDEDENESVENSSSTT----SKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINET
          E+++ED N+  ++S++TT    ++K K DR+RTLISERRRRGRMK+KLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYV+ELQ QAKKLK++I+ LE+S+N T
Subjt:  EDEDEDEDENESVENSSSTT----SKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINET

Query:  ---QKIHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTNFIIQSSNLASAS-DRFILTATINVRDCEVDMNL
           Q+   D  K +  +    +     KIIQ+DV QVEE+GFY+RLVC  GE VA SLYK LESLT+F +Q+SNL+S S D ++LT T++    E  +NL
Subjt:  ---QKIHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTNFIIQSSNLASAS-DRFILTATINVRDCEVDMNL

Query:  PNLKLWLTGALLNHGFEF
        PNLKLW+TG+LLN GFEF
Subjt:  PNLKLWLTGALLNHGFEF

AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.0e-1532.77Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE---DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKAS
        +E IVD  +    +P+S              ++NED + D    +E  S    SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKAS
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE---DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKAS

Query:  IVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVL
        I+ DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V 
Subjt:  IVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVL

Query:  ESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINVRDCEVDM
        ESL N  I +SNL S S     T  I   + E ++
Subjt:  ESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINVRDCEVDM

AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.0e-1533.62Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE----DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKA
        +E IVD  +    +P+S              ++NED + D     +E  S    SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKA
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE----DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKA

Query:  SIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKV
        SI+ DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V
Subjt:  SIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKV

Query:  LESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINV
         ESL N  I +SNL S S     T  I V
Subjt:  LESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINV

AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.6e-1533.19Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE----DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKA
        +E IVD  +    +P+S              ++NED + D     +E  S    SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKA
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE----DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKA

Query:  SIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKV
        SI+ DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V
Subjt:  SIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKV

Query:  LESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINV
         ESL N  I +SNL S S     T  I +
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.0e-1633.48Show/hide
Query:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE----DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKA
        +E IVD  +    +P+S              ++NED + D     +E  S    SS+      +  ++ ++SER RR ++ ++L+ALRS+VPNITKMDKA
Subjt:  LEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDE----DENESVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKA

Query:  SIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKV
        SI+ DA+ Y++ LQ + KKL+AEI  LE    SS++ ++   RD     T KK+ Q          ++++L V  + ER   + + C       + L +V
Subjt:  SIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLE----SSINETQKIHRD----QTKKKIIQTSYSDQFLPTKIIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKV

Query:  LESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINVR
         ESL N  I +SNL S S     T  I +R
Subjt:  LESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINVR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCAATTTGGGAGGCATTTAATGACGGACATCAACGATCAATTTGAGCTCCAAGATTTCATCCATGGCGACAACTTTGATCGATATGTGAATCTGATTCGTGGAGG
GAACGAAACTCCGATATTCAATAATAACTTTGATCTCGATTTTGTGAACGGTTGCTTGATCGAGGATCGTGTGGTGGATCAAAGCTTGGAATACATTGTAGATTCGAATA
TGGTGATGAATTCTGATCCAAATTCTCTGTTTAGTACATTGGAGAGTTTCAATAGCATCATGAAAGAAGTTGAAAACGAAGACGAAGACGAAGACGAGGACGAAAACGAG
TCTGTAGAGAACTCTTCTTCAACAACTTCAAAGAAACCTAAGGCAGATAGAACAAGAACTTTGATTTCTGAAAGAAGAAGAAGAGGAAGAATGAAGGAAAAGCTTTATGC
ATTGCGTTCATTGGTTCCAAATATAACTAAGATGGACAAAGCTTCCATTGTTGGAGATGCAGTGTTATATGTGAAAGAGCTACAAATGCAAGCCAAGAAGCTCAAAGCAG
AGATATCAGTTTTGGAATCTTCAATCAATGAAACACAAAAAATTCATAGAGATCAAACCAAAAAGAAAATCATTCAAACTTCATATTCTGACCAATTCCTCCCCACCAAA
ATAATTCAGCTGGATGTGTTTCAAGTAGAGGAAAGAGGGTTTTATTTGAGGCTAGTTTGCAAGATGGGTGAAAGAGTGGCCATGTCTCTTTACAAAGTTCTTGAATCTCT
CACCAACTTCATTATTCAAAGCTCCAATTTGGCTTCTGCTTCTGACAGATTCATTCTCACTGCTACAATTAATGTGAGGGATTGTGAGGTGGACATGAATTTGCCAAATC
TGAAGCTTTGGCTAACTGGGGCACTTCTTAACCATGGATTTGAGTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGCAATTTGGGAGGCATTTAATGACGGACATCAACGATCAATTTGAGCTCCAAGATTTCATCCATGGCGACAACTTTGATCGATATGTGAATCTGATTCGTGGAGG
GAACGAAACTCCGATATTCAATAATAACTTTGATCTCGATTTTGTGAACGGTTGCTTGATCGAGGATCGTGTGGTGGATCAAAGCTTGGAATACATTGTAGATTCGAATA
TGGTGATGAATTCTGATCCAAATTCTCTGTTTAGTACATTGGAGAGTTTCAATAGCATCATGAAAGAAGTTGAAAACGAAGACGAAGACGAAGACGAGGACGAAAACGAG
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TGAAGCTTTGGCTAACTGGGGCACTTCTTAACCATGGATTTGAGTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEQFGRHLMTDINDQFELQDFIHGDNFDRYVNLIRGGNETPIFNNNFDLDFVNGCLIEDRVVDQSLEYIVDSNMVMNSDPNSLFSTLESFNSIMKEVENEDEDEDEDENE
SVENSSSTTSKKPKADRTRTLISERRRRGRMKEKLYALRSLVPNITKMDKASIVGDAVLYVKELQMQAKKLKAEISVLESSINETQKIHRDQTKKKIIQTSYSDQFLPTK
IIQLDVFQVEERGFYLRLVCKMGERVAMSLYKVLESLTNFIIQSSNLASASDRFILTATINVRDCEVDMNLPNLKLWLTGALLNHGFEF