CuGenDBv2

Gene ID	Pay0010815
Organism	Cucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Photosystem II CP47 reaction center protein
Genome location	Contig00288_ERROPOS136135:31970..33489
RNA-Seq Expression	Pay0010815
Synteny	Pay0010815
Gene Ontology terms	GO:0009772 - photosynthetic electron transport in photosystem II (biological process) GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process) GO:0009523 - photosystem II (cellular component) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function) GO:0045156 - electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity (molecular function)
InterPro domains	IPR000932 - Photosystem antenna protein-like IPR017486 - Photosystem II CP47 reaction centre protein IPR036001 - Photosystem antenna protein-like superfamily

Homology

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A0A249RZY7 Photosystem II CP47 reaction center protein

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A0A286NFP0 Photosystem II CP47 reaction center protein

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G3ETS3 Photosystem II CP47 reaction center protein

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SwissProt top hits

e value

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Q2MIG2 Photosystem II CP47 reaction center protein

1.4e-294

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Q2QD63 Photosystem II CP47 reaction center protein

5.9e-296

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Q33C06 Photosystem II CP47 reaction center protein

1.4e-294

95.64

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Q3C1K3 Photosystem II CP47 reaction center protein

1.4e-294

95.64

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        PTTKR
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Q7FNS4 Photosystem II CP47 reaction center protein

1.4e-294

95.64

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        PTTKR
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

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ATCG00280.1 photosystem II reaction center protein C

5.2e-21

22.73

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        G  W+  +  ++N  G+LL  H+ H  L+  WAG+M L+E+A F P      PM+ QG   + +    GW +  GG + +   +   GV   H++ S + 
Subjt:  GLPWYRVHTVVLNDPGRLLSVHIMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLDPMWRQG---MNNQFMGGWSI-TGGTITNPGIWSYEGVAGAHIVFSGLC

Query:  FLAAIWHWVYWDLEIFCDER------TGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCF--GFGAFHVTGLY---GPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEGFDPFVPG
            I+H +     +  +E         K    +  I GIHL L G+G F   F A +  G+Y    PG    D   +T    + +  +G     PF   
Subjt:  FLAAIWHWVYWDLEIFCDER------TGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCF--GFGAFHVTGLY---GPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEGFDPFVPG

Query:  G----------IASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGYFQQEIYR
        G          I   H+  G++ I  G++H+  +P     + L + + E  LS S+AA+    F+    +W+ +   P E +GPT  +  Q         
Subjt:  G----------IASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGYFQQEIYR

Query:  RVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPVFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIVRADV-PFRR
        +  T L  +Q L               Y+  +P    +F   +M   D +   WL     R   G +L                      ++ D+ P++ 
Subjt:  RVSTGLAENQSLSEAWSKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPVFRDKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIVRADV-PFRR

Query:  AESKYSVEQVGVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDVFAGIDPD
          S                              +Y   A LG +  +     + + V   SPR W +  H       F GH+WH  R   R   AG +  
Subjt:  AESKYSVEQVGVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDVFAGIDPD

Query:  LDAQVE
        +D   E
Subjt:  LDAQVE

ATCG00680.1 photosystem II reaction center protein B

4.3e-294

95.05

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Query:  IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDERTGKPSLDLPKIFGIHLFLSGLGCFGFGAFHVTGLYGPGIWVSDPYGLTGRVQAVNPAWGVEGFDPFVPGGIAS
        IVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDERTGKPSLDLPKIFGIHLFLSG+ CFGFGAFHVTGLYGPGIWVSDPYGLTG+VQ VNPAWGVEGFDPFVPGGIAS
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        PTTKR
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Pay0010815 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome