; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Pay0010956 (gene) of Melon (Payzawat) v1 genome

Gene IDPay0010956
OrganismCucumis melo var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationchr06:3008778..3009488
RNA-Seq ExpressionPay0010956
SyntenyPay0010956
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049241.1 hypothetical protein E6C27_scaffold171G004810 [Cucumis melo var. makuwa]7.4e-12999.15Show/hide
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KAG6582389.1 hypothetical protein SDJN03_22391, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-1837.14Show/hide
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        MAFLL+ P              S PW SS F KS  NPS  ++LFTS ++S RP R+NTIFGAPCGLCGQ I  SE LNHH     L + L        P
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           +S               P  +L    T   +LR H  A          A+DMAH+LPLHPLLA+PPP   T                     N+IR 
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KAG6597359.1 hypothetical protein SDJN03_10539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-6763.33Show/hide
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        L  LFFLT+FSPS + PW+SS + KSG NPSL+++L  S E+SSR P R++TIFGAPCGLCGQVIFGSEALNHHYNYHFLQN+LAS+     P S  S +
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        PP    +FHGQASASREPQ+TLN+ LTMPP     SLRS+    +DMAH LPLHPLLA+PPP  R +T N +    N+  A QR QGNQ + NNGG R  
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          + A+EQ QP Q+VIDL S+EENDCSSDGS+GLDLTLSL
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KGN56847.1 hypothetical protein Csa_010766 [Cucumis sativus]1.6e-11087.14Show/hide
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        REVGGQPASE+QPPQDVIDL+SEENDCSSD SEGLDLTLSL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L892 C2H2-type domain-containing protein7.5e-11187.14Show/hide
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A0A5A7U6I9 C2H2-type domain-containing protein3.6e-12999.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTTCCTCCTTCAACCTCCTCTGTTTGCTCTGTTTTTCCTCACATCCTTCTCTCCTTCTTGGTCTCTTCCATGGAATTCTTCCTCCTTTGGTAAATCGGGCTCCAA
CCCATCACTCGACGACATGTTGTTCACCTCCAGCGAGTCTTCCAGCAGGCCGTCTCGCCAAAACACAATTTTTGGTGCCCCTTGTGGGCTCTGTGGCCAAGTGATTTTTG
GCTCTGAAGCTCTTAATCATCATTACAATTACCATTTCTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTAGAGGCCACTCTAATCCTTGCTCCGGTGTCTCTCACCAGCCACCGTTT
TTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTCGAGAACCCCAAATGACGCTTAACGATTATTTAACGATGCCTCCATCTTTGAGAAGCCATTCAGGCGCCGCCATTGATATGGCTCA
CTTTCTTCCGCTTCATCCTTTGTTGGCTCGACCCCCGCCGCTGCCGCGAACCAGCACCCCCAACAGTATGAACTTTCAACAGAATCAGGCTGTGGCACGGCAGAGAAGGC
AGGGGAACCAAATCCGATGGAATAACGGCGGAGTGAGGGAAGTTGGTGGCCAGCCGGCATCAGAACAGCAGCCACCCCAAGATGTGATTGATCTGAGTAGTGAGGAGAAT
GATTGTAGCTCTGATGGTTCGGAAGGCTTGGATTTGACACTGAGTCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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